李鸿文:基于高通量测序技术分析番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道转录组学的变化论文

李鸿文:基于高通量测序技术分析番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道转录组学的变化论文

本文主要研究内容

作者李鸿文,黄诗杭,骆钰,吴晓平,王全溪,李健,黄一帆,吴异健(2019)在《基于高通量测序技术分析番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道转录组学的变化》一文中研究指出:番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)感染雏番鸭可导致肠道黏膜受损,造成肠黏膜免疫功能低下甚至丧失。为寻找番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道组织免疫相关的差异表达基因,本研究建立番鸭呼肠孤病毒自然发病模型,在感染后3d、6d、21d采集同居感染组和对照组试验雏番鸭的空肠,对其进行高通量测序,对差异表达基因进行GO功能分类和KEGG数据库分析。结果显示,感染后3d、6d和21d分别筛选出2 297、5 860和3 721个差异表达基因;GO分子功能结果显示,免疫相关差异表达基因主要和免疫球蛋白的产生、T细胞活化和单核细胞趋化性等有关;KEGG通路富集结果显示,差异表达基因主要涉及在吞噬体、细胞溶质DNA传感途径、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Jak-STAT信号通路和RIG-I受体信号通路;荧光定量RT-PCR对差异表达基因进行验证,其结果与转录组学结果基本一致。本研究为进一步阐明MDRV感染导致雏番鸭肠道损伤和黏膜免疫抑制的机制奠定基础。

Abstract

fan ya hu chang gu bing du (Muscovy duck reovirus,MDRV)gan ran chu fan ya ke dao zhi chang dao nian mo shou sun ,zao cheng chang nian mo mian yi gong neng di xia shen zhi sang shi 。wei xun zhao fan ya hu chang gu bing du gan ran chu fan ya chang dao zu zhi mian yi xiang guan de cha yi biao da ji yin ,ben yan jiu jian li fan ya hu chang gu bing du zi ran fa bing mo xing ,zai gan ran hou 3d、6d、21dcai ji tong ju gan ran zu he dui zhao zu shi yan chu fan ya de kong chang ,dui ji jin hang gao tong liang ce xu ,dui cha yi biao da ji yin jin hang GOgong neng fen lei he KEGGshu ju ku fen xi 。jie guo xian shi ,gan ran hou 3d、6dhe 21dfen bie shai shua chu 2 297、5 860he 3 721ge cha yi biao da ji yin ;GOfen zi gong neng jie guo xian shi ,mian yi xiang guan cha yi biao da ji yin zhu yao he mian yi qiu dan bai de chan sheng 、Txi bao huo hua he chan he xi bao qu hua xing deng you guan ;KEGGtong lu fu ji jie guo xian shi ,cha yi biao da ji yin zhu yao she ji zai tun shi ti 、xi bao rong zhi DNAchuan gan tu jing 、xi bao yin zi -xi bao yin zi shou ti xiang hu zuo yong 、Tollyang shou ti xin hao tong lu 、Jak-STATxin hao tong lu he RIG-Ishou ti xin hao tong lu ;ying guang ding liang RT-PCRdui cha yi biao da ji yin jin hang yan zheng ,ji jie guo yu zhuai lu zu xue jie guo ji ben yi zhi 。ben yan jiu wei jin yi bu chan ming MDRVgan ran dao zhi chu fan ya chang dao sun shang he nian mo mian yi yi zhi de ji zhi dian ding ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自病毒学报的李鸿文,黄诗杭,骆钰,吴晓平,王全溪,李健,黄一帆,吴异健,发表于刊物病毒学报2019年02期论文,是一篇关于番鸭呼肠孤病毒论文,黏膜免疫论文,转录组论文,差异表达基因论文,病毒学报2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自病毒学报2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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