引起我国葡萄卷叶病的四种病原病毒的RT-PCR鉴定

引起我国葡萄卷叶病的四种病原病毒的RT-PCR鉴定

论文摘要

葡萄卷叶病(GLD)是葡萄上最重要的病毒病害之一,在全世界各葡萄产区均有发生。到目前为止,己从感染GLD的葡萄植株中分离并鉴定出10种葡萄卷叶相关病毒(GLRaVs),按照发现先后顺序依次命名为GLRaV-1~10。这些病毒在血清学上不相关,单独或复合侵染葡萄均可导致GLD的发生。本研究对引起葡萄卷叶病的4种GLRaVs进行了RT-PCR鉴定,初步明确GLRaVs的侵染状况,并对我国GLRaV-1和GLRaV-7分离物的基因片段的序列进行分析。取得的主要研究结果如下:1)采用RT-PCR方法,对来源于中国农业科学院郑州果树研究所国家葡萄种质资源圃,表现有典型卷叶症状的57份葡萄样品携带GLRaV-1、GLRaV-2、GLRaV-3和GLRaV-7状况进行了分析。GLRaVs的总检出率为84.21%,但不同病毒种类其检出率有差异,GLRaV-1检出率最高,达68.42%;其次为GLRaV-3,检出率21.05%;而GLRaV-2和GLRaV-7的检出率相对较低,分别为7.00%和5.26%。不同类型的葡萄之间,病毒的检出率差异不明显,酿酒品种的GLRaV检出率80.77%(21/26),鲜食品种的为87.10%(27/31)。红色品种的为88.89%(24/27),白色品种的为83.33(25/30)。同一葡萄植株中多种GLRaVs复合侵染现象比较普遍。所检测样品中,二号大宛红、红艾基、红汁加美、白拉查基、阿布拉依、超宝、布阿基达希、卡拉斯玫瑰、牛心、罗马尼亚和埃拉基海尼11个品种感染有2-3种病毒。2)运用IC-RT-PCR方法对RT-PCR检测呈阳性的部分葡萄样品进行检测,结果和RT-PCR检测结果一致;对RT-PCR检测呈阴性的葡萄样品进行复检,结果仍呈阴性。IC-RT-PCR操作步骤简单,灵敏度和RT-PCR相当,适合田间样品的大量检测。3)从温室保存的表现卷叶病症状的塞米隆植株上提取dsRNA,通过RT-PCR扩增获得大小为590bp的产物,并对扩增片段进行了克隆和序列分析,该片段为GLRaV-7 HSP70基因的一部分,推测编码196个氨基酸的多肽。该序列GenBank登录号为EF093187,是在NCBI上登陆的第二条GLRaV-7的核苷酸序列。该序列与已报道的GLRaV-7 HSP70基因片段(Y15987)相似性为91%,氨基酸序列相似性为93%。另外,从品丽珠中获得大小为293bp的GLRaV-1CPd2基因片段(EF583823)。和NCBI上登录的其他分离物进行了序列比对,EF583823和报道的GLRaV-1其他分离物核苷酸序列变异较大,相似性最高仅为88%。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 缩略词
  • 1 文献综述
  • 1.1 问题的提出
  • 1.2 葡萄卷叶病研究进展
  • 1.2.1 葡萄卷叶病的症状及危害
  • 1.2.2 葡萄卷叶病的病原及病毒的寄主范围
  • 1.2.3 GLRaVs的传播
  • 1.2.4 GLRaVs的分类及基本特征
  • 1.2.5 GLRaVs的检测方法
  • 1.2.5.1 生物学检测
  • 1.2.5.2 血清学检测
  • 1.2.5.3 分子生物学检测
  • 1.2.5.3.1 dsRNA技术
  • 1.2.5.3.2 分子杂交
  • 1.2.5.3.3 PCR技术
  • 1.2.6 GLD的防治措施
  • 1.3 GLRaV-1研究进展
  • 1.4 研究目的和意义
  • 2 材料和方法
  • 2.1 供试植物及主要试剂
  • 2.1.1 供试植物
  • 2.1.2 试验试剂
  • 2.2 研究方法
  • 2.2.1 双抗体夹心ELISA
  • 2.2.2 dsRNA提取
  • 2.2.3 RT-PCR检测
  • 2.2.3.1 引物设计与合成
  • 2.2.3.2 反转录合成第一链cDNA
  • 2.2.3.3 PCR扩增
  • 2.2.3.4 1%琼脂糖凝胶电泳
  • 2.2.3.5 6%聚丙烯酰胺凝胶电泳
  • 2.2.4 免疫捕捉RT-PCR
  • 2.2.5 基因克隆与序列测定
  • 2.2.5.1 PCR产物的纯化与回收
  • 2.2.5.2 大肠杆菌感受态细胞的制备
  • 2.2.5.3 连接
  • 2.2.5.4 热击转化
  • 2.2.5.5 PCR法鉴定阳性克隆
  • 2.2.5.6 质粒DNA的小量制备
  • 2.2.5.7 阳性克隆的酶切鉴定
  • 3 结果与分析
  • 3.1 田间葡萄植株GLD症状的调查
  • 3.2 GLRaV-1和GLRaV-7的血清学检测结果
  • 3.3 GLRaVs的RT-PCR检测结果
  • 3.4 GLRaVs的IC-RT-PCR检测结果
  • 3.5 GLRaV-1及GLRaV-7基因片段的克隆与序列分析
  • 3.5.1 GLRaV-1 CPd2基因片段的克隆和序列分析
  • 3.5.2 GLRaV-7 HSP70基因片段的克隆与序列分析
  • 4 结论与讨论
  • 参考文献
  • 附 试验所用溶液的配制
  • 致谢
  • 相关论文文献

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