论文题目: 中国南方主要地方山羊品种遗传多样性及进化特征的研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 动物遗传育种与繁殖
作者: 刘宁
导师: 赵有璋,吴登俊
关键词: 山羊,线粒体,控制区,遗传多样性,系统进化
文献来源: 甘肃农业大学
发表年度: 2005
论文摘要: 测定了饲养在中国的11个家养山羊品种(包括4个引进品种)72个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-环)全序列,结果表明控制区全序列长度为1,212bp或1,213bp,共检测到276个变异(突变)位点,占分析位点总数的22.56%,其中简约信息位点175个,单一多态位点81个,所有这些突变均为两核苷酸间的变异;同时,本次试验在中国本地山羊的序列中也检测到T?C,G?A颠换的发生。颠换发生的频率在0.0825%(简阳大耳羊)～0.66%(昭通山羊)之间,其中,马头山羊、榕江小香羊的核苷酸序列的颠换发生率均为0.413%,与作为外群参与分析的野生山羊(Capra aegagrus和Capra falconeri)的颠换发生频率(0.436%)相似。在碱基的1,075位有一个核苷酸的插入/缺失。所有序列的Tajima D中性检验结果不显著(P > 0.10或0.05 < P < 0.10),说明序列均为选择性中性,同时也表明中国南方山羊品种在过去没有出现群体扩张。无论国内家养山羊,还是引进品种均表现出了较高的核苷酸多样度(Pi)和单倍型多样性(H)。整个家山羊群体的平均核苷酸差异数为19.475,核苷酸多样度为(1.608±0.09)%,这些差异共定义了60种单倍型,单倍型多样性为0.977。其中,中国家养山羊7个品种有40种单倍型,引进的4个品种有20种单倍型。中国南方山羊的单倍型多样性(0.973)比引进品种(0.903)高,但引进品种的核苷酸多样性(1.731%)、单倍型间的平均距离(0.0187)、单倍型间的平均核苷酸差异数(19.475)高于中国南方山羊品种(分别为1.531%、0.0151和18.554),但差异均不显著(P>0.05)。表明中国家养山羊的遗传多样性较为丰富,且品种间表现出弱的遗传结构。将本研究测定的73条mtDNA的D环全序列与文献报道的76条家山羊序列、2种野山羊(角猾羊和捻角山羊)的D环序列结合分析发现,文献报道的单倍型仅有3种在中国南方地方山羊品种中存在。各家养山羊品种间平均核苷酸差异数为19.475(7.50~30.42),平均核苷酸差异率为1.607%(0.619%~2.512%)。品种间的Kimura双参数距离变异较大(0.0008~0.0315)。许多品种都具有独特的单倍型类型,只有2种单倍型在品种间有共享。各单倍型在品种间和品种内的分布和频率也不平衡,显示出山羊mtDNA控制区(CR,D-loop)序列具有较为丰富的遗传多样性,尤其是在国内地方山羊品种(系)中,D-loop序列的核苷酸单倍型之间没有共享性,大多数为各品种(系)所特有的单倍型。
论文目录:
摘 要
Summary
1 文献综述
1.1 遗传多样性及其研究意义
1.1.1 遗传多样性的概念及其意义
1.1.2 我国家养动物遗传多样性（Diversities of Domestic Animal）研究的重要性和必要性
1.2 遗传多样性研究的原理和方法
1.2.1 数量遗传学的方法
1.2.2 染色体多态性的检测
1.2.3 同工酶和蛋白质电泳技术
1.2.4 DNA 多态性分析技术
1.3 mtDNA在家畜遗传多样性研究中的应用
1.4 山羊遗传多样性的研究
1.5 山羊的起源与中国山羊的种质资源
1.5.1 山羊的起源
2 山羊mtDNA 控制区（D-环）序列多态性与系统进化研究
2.1 山羊mtDNA 控制区D-环序列多态性研究
2.1.1 材料与方法
2.1.2 结果
2.3 家养山羊的系统发育初步研究
2.3.1 单倍型间的系统发育树
2.3.2 家养山羊的母系来源
2.4 分析与讨论
2.4.1 线粒体DNA 的母系遗传
2.4.2 中国家养山羊的mtDNA 遗传多样性
2.4.3 家养山羊品种（系）间的遗传分化
2.4.4 mtDNA 单倍型的分布特征
2.4.5 不同建树方法及其基本假定
2.4.6 需要进一步研究和解决的问题
结论
致谢
参考文献
攻读博士期间发表的论文或专著
论文作者简介
导师简介
附图
发布时间: 2007-03-12
参考文献
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