本文主要研究内容
作者（2019）在《鸟类六种吸虫的分子鉴定和线粒体基因组研究》一文中研究指出：分类学和系统学是学习生物多样性的重要方法。采用分子数据挖掘与形态数据描述相结合的方法,可最大化地提供吸虫分类及系统发育学的相关信息。核糖体DNA(rDNA)及线粒体(mt)基因组可提供丰富的遗传标记。部分或完整的rDNA序列已被广泛用于吸虫的物种鉴定及系统研究。然而,目前GenBank中仅有为数不多的吸虫线粒体基因组数据。许多被忽略的或有分类及归属争议的吸虫需要通过解析其线粒体基因组序列来解决其分类争议。尽管鸟类是最常见的吸虫终末宿主之一,但对寄生于鸟类的吸虫的分类及系统发育研究仍很有限。为了填补该空白,本论文解析了来自巴基斯坦不同食性鸟类的6种吸虫的rDNA和mt基因组序列,研究了他们与其他吸虫的系统发育关系。采用通用引物或者根据相对保守序列设计的引物,对寄生于不同鸟类的6种斜睾吸虫,通过PCR扩增获得rDNA中的内转录间隔区(ITS)及大亚基(LSU/28S),以及完整或近乎完整的mt基因组序列。rDNA序列数据用于虫种鉴定、遗传变异以及部分物种科内进化树构建。注释、描述了6种吸虫的mt基因组的基因排列、12个蛋白编码基因(PCGs)的碱基组成、碱基偏斜、密码子使用、相对同义密码子使用度(RSCU),并进行了比较分析。本研究解析的这6种复殖吸虫的mt基因组包含36个基因、12个PCGs、22转运RNA(tRNA)、2个核糖体RNA(rRNA)及1-2个非编码区(NCR)。atp8基因在这6个复殖吸虫中都缺失了。基于12个PCGs的连续的氨基酸(或核苷酸)序列,本项目研究了这6种吸虫与相关吸虫的系统发育关系。本实验的6个吸虫分别来源于三个亚目的四个科。本实验首次提出,相对于双腔科,并殖科更接近斜睾科和Brachycladiidae科;本实验认可环肠科位于棘口目;通过分析Hepatiarius sudarikovi(苏氏肝居吸虫)和Opisthorchis felineus(猫后睾吸虫)的ITS rDNA及mt基因组序列的高度相似性并结合系统发育分析,建议将H.sudarikovi归入Opisthorchis后睾属。本论文首次解码了寄生于鸟类的6种吸虫的线粒体基因组序列,其中Plagiorchis maculosus(斑状斜睾吸虫)是斜睾科的首次报道,Uvitellina sp.是环肠科的代表性物种,Brachylecithum sp.,Brachydistomum sp.和Lyperosomum longicauda(双腔科)分别是其属(短腺属,短盘属,窄体属)的代表性物种。因此,本研究首次提供了来自这些吸虫的rDNA和mt基因组序列,不仅为研究这些吸虫的分类、鉴定、诊断检测提供了新的分子标记,也为进一步研究复殖吸虫的系统发育提供了新的数据。
Abstract
fen lei xue he ji tong xue shi xue xi sheng wu duo yang xing de chong yao fang fa 。cai yong fen zi shu ju wa jue yu xing tai shu ju miao shu xiang jie ge de fang fa ,ke zui da hua de di gong xi chong fen lei ji ji tong fa yo xue de xiang guan xin xi 。he tang ti DNA(rDNA)ji xian li ti (mt)ji yin zu ke di gong feng fu de wei chuan biao ji 。bu fen huo wan zheng de rDNAxu lie yi bei an fan yong yu xi chong de wu chong jian ding ji ji tong yan jiu 。ran er ,mu qian GenBankzhong jin you wei shu bu duo de xi chong xian li ti ji yin zu shu ju 。hu duo bei hu lve de huo you fen lei ji gui shu zheng yi de xi chong xu yao tong guo jie xi ji xian li ti ji yin zu xu lie lai jie jue ji fen lei zheng yi 。jin guan diao lei shi zui chang jian de xi chong zhong mo su zhu zhi yi ,dan dui ji sheng yu diao lei de xi chong de fen lei ji ji tong fa yo yan jiu reng hen you xian 。wei le tian bu gai kong bai ,ben lun wen jie xi le lai zi ba ji si tan bu tong shi xing diao lei de 6chong xi chong de rDNAhe mtji yin zu xu lie ,yan jiu le ta men yu ji ta xi chong de ji tong fa yo guan ji 。cai yong tong yong yin wu huo zhe gen ju xiang dui bao shou xu lie she ji de yin wu ,dui ji sheng yu bu tong diao lei de 6chong xie gao xi chong ,tong guo PCRkuo zeng huo de rDNAzhong de nei zhuai lu jian ge ou (ITS)ji da ya ji (LSU/28S),yi ji wan zheng huo jin hu wan zheng de mtji yin zu xu lie 。rDNAxu lie shu ju yong yu chong chong jian ding 、wei chuan bian yi yi ji bu fen wu chong ke nei jin hua shu gou jian 。zhu shi 、miao shu le 6chong xi chong de mtji yin zu de ji yin pai lie 、12ge dan bai bian ma ji yin (PCGs)de jian ji zu cheng 、jian ji pian xie 、mi ma zi shi yong 、xiang dui tong yi mi ma zi shi yong du (RSCU),bing jin hang le bi jiao fen xi 。ben yan jiu jie xi de zhe 6chong fu shi xi chong de mtji yin zu bao han 36ge ji yin 、12ge PCGs、22zhuai yun RNA(tRNA)、2ge he tang ti RNA(rRNA)ji 1-2ge fei bian ma ou (NCR)。atp8ji yin zai zhe 6ge fu shi xi chong zhong dou que shi le 。ji yu 12ge PCGsde lian xu de an ji suan (huo he gan suan )xu lie ,ben xiang mu yan jiu le zhe 6chong xi chong yu xiang guan xi chong de ji tong fa yo guan ji 。ben shi yan de 6ge xi chong fen bie lai yuan yu san ge ya mu de si ge ke 。ben shi yan shou ci di chu ,xiang dui yu shuang qiang ke ,bing shi ke geng jie jin xie gao ke he Brachycladiidaeke ;ben shi yan ren ke huan chang ke wei yu ji kou mu ;tong guo fen xi Hepatiarius sudarikovi(su shi gan ju xi chong )he Opisthorchis felineus(mao hou gao xi chong )de ITS rDNAji mtji yin zu xu lie de gao du xiang shi xing bing jie ge ji tong fa yo fen xi ,jian yi jiang H.sudarikovigui ru Opisthorchishou gao shu 。ben lun wen shou ci jie ma le ji sheng yu diao lei de 6chong xi chong de xian li ti ji yin zu xu lie ,ji zhong Plagiorchis maculosus(ban zhuang xie gao xi chong )shi xie gao ke de shou ci bao dao ,Uvitellina sp.shi huan chang ke de dai biao xing wu chong ,Brachylecithum sp.,Brachydistomum sp.he Lyperosomum longicauda(shuang qiang ke )fen bie shi ji shu (duan xian shu ,duan pan shu ,zhai ti shu )de dai biao xing wu chong 。yin ci ,ben yan jiu shou ci di gong le lai zi zhe xie xi chong de rDNAhe mtji yin zu xu lie ,bu jin wei yan jiu zhe xie xi chong de fen lei 、jian ding 、zhen duan jian ce di gong le xin de fen zi biao ji ,ye wei jin yi bu yan jiu fu shi xi chong de ji tong fa yo di gong le xin de shu ju 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国农业科学院的，发表于刊物中国农业科学院2019-07-05论文，是一篇关于吸虫论文,线粒体基因组论文,系统发育学论文,鸟类论文,巴基斯坦论文,中国农业科学院2019-07-05论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国农业科学院2019-07-05论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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