大豆疫霉RXLR效应分子的筛选及Avh238的功能研究

大豆疫霉RXLR效应分子的筛选及Avh238的功能研究

论文摘要

大豆疫霉(Phytophthora sojae Kaufmann&Gerdemann)侵染大豆引起的大豆根腐病是大豆生产上的毁灭性病害之一,每年造成大豆10多亿美元的损失。大豆疫霉隶属卵菌门,在进化上与真菌相差甚远,和藻类同属于茸鞭生物界,尽管和其他真菌一样呈丝状生长,但是其致病机理与其他真菌差异显著。RXLR类效应分子的发现促使本研究就大豆疫霉RXLR效应分子进行了功能筛选,并对其中一个引起烟草细胞死亡的效应基因Avh238进行了功能研究。利用PVX病毒表达载体对大豆疫霉RXLR效应分子的功能研究。卵菌含有RXLR-dEER基序的效应蛋白在病原物与植物互作过程中具有抑制植物防卫反应的作用。生物信息学分析表明大豆疫霉的基因组中含有超过350个的RXLR类效应分子。为了确定这些候选效应分子中哪些真正具有抑制植物防卫反应的功能,本研究以老鼠细胞凋亡蛋白诱导因子Bax为激发子,采用双元病毒表达载体Potato virus X vector(PVX)在本氏烟Nicotiana benthamiana中表达了32个候选效应分子,通过分析这些效应分子对BAX诱导HR的抑制作用,从中筛选了13个RXLR效应分子能够抑制老鼠凋亡蛋白Bax诱导的过敏性反应;另外得到10个效应蛋白可以诱导烟草发生细胞死亡,对这10个效应分子在烟草上引起的表型进行了详细的研究,同时对它们在大豆疫霉发育阶段的转录水平进行了分析。本研究结果表明大豆疫霉RXLR效应分子既可能起到毒性功能抑制植物的防卫反应,同时有一些效应分子也可激活寄主防卫反应。大豆疫霉RXLR效应蛋白Avh238的功能研究。大豆疫霉含RXLR-dEER基序蛋白除了包含许多能够抑制植物细胞过敏性反应的效应分子之外,也有部分蛋白可以直接诱导植物过敏性反应。本章就一个含有RXLR基序能够诱导烟草细胞死亡的效应分子Avh238的功能进行了详细的分析。本研究构建了Avh238基因的PVX表达系统,发现该基因编码产物能够在本氏烟和W38烟草上发生过敏性反应。同时,利用基因枪粒子轰击法表明该基因表达产物也能导致大豆细胞死亡。RT-PCR分析表明该基因能够诱导烟草PR基因PR1aPR1bPR1c的上调表达。其具有RXLR家族的保守结构域包括信号肽序列及RFLR-dEER基序。将序列在Swiss-Prot,EMBL,和GenBank中比对发现此蛋白与已知蛋白序列无明显同源性。功能域分析表明此蛋白诱导细胞死亡的主要位置在其C末端,不需要信号肽、RXLR-dEER基序的参与。RT-PCR及Microarray分析结果表明Avh238在休止孢萌发阶段特异表达,同时该基因在侵染早期6-24h高度上调表达,而在互作的48小时后表达量显著下降。揭示该基因在病原菌从活体寄生到死体营养的转变过程中可能起非常重要的作用。将该基因在大豆疫霉菌株中过量表达,转化子的致病性显著下降,提示该基因编码产物可能起到胞内激发子的功能。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 引言
  • 上篇 文献综述
  • 第一章 植物病原卵菌外泌蛋白研究
  • 1 胞外效应分子APOPLASTIC EFFECTORS
  • 1.1 酶抑制剂
  • 1.2 富含半胱氨酸小蛋白
  • 2 胞内效应分子CYTOPLASMIC EFFECTORS
  • 2.1 卵菌无毒蛋白
  • 2.2 CRN蛋白家族(CRN1,CRN2)
  • 3 研究展望
  • 参考文献
  • 第二章 RXLR蛋白家族研究进展
  • 1 RXLR作为一个保守的功能域存在于卵菌AVR蛋白
  • 2 RXLR-DEER介导的蛋白运输
  • 3 含有RXLR基序效应蛋白的功能域
  • 4 RXLR外泌蛋白进入寄主细胞的机制
  • 5 RXLR效应蛋白的毒性功能
  • 6 总结
  • 参考文献
  • 下篇 研究内容
  • 第一章 大豆疫霉RXLR效应蛋白的功能筛选
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 材料和方法
  • 1.1 供试烟草和供试菌株的培养
  • 1.2 大豆疫霉菌丝基因组DNA、RNA的提取和CDNA合成
  • 1.3 效应分子基因克隆及重组质粒的构建
  • 1.4 农杆菌GV3101感受态细胞的制备和转化方法
  • 1.5 筛选方法
  • 1.6 激发子基因的转录水平分析
  • 2 结果
  • 2.1 效应分子的生物信息学分析及载体构建
  • 2.2 抑制Bax引发的PCD效应蛋白的筛选
  • 2.3 诱导烟草产生细胞坏死效应分子的筛选
  • 2.4 引发烟草细胞死亡的效应分子转录水平分析
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 第二章 大豆疫霉RXLR效应蛋白AVH238的功能研究
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 材料方法
  • 1.1 供试大豆疫霉菌株和烟草
  • 1.2 大豆疫霉菌株DNA和RNA的提取方法
  • 1.3 大豆疫霉Avh238基因的克隆和序列分析
  • 1.4 大豆疫霉Avh238基因在烟草上引起细胞死亡的分析方法
  • 1.5 烟草PR基因表达分析方法
  • 1.6 大豆疫霉Avh238基因的功能域研究
  • 1.7 大豆疫霉Avh238基因在不同发育阶段的转录分析
  • 1.8 大豆疫霉Avh238基因的序列分析及多态性分析
  • 1.9 Race19(P7076)的Avh238在烟草上的活性分析
  • 1.10 大豆疫霉的转化
  • 2 结果与分析
  • 2.1 大豆疫霉Avh238基因属于RXLR效应蛋白家族成员
  • 2.2 Avh238诱导烟草细胞的死亡
  • 2.3 大豆疫霉Avh238诱导烟草PR基因表达
  • 2.4 大豆疫霉Avh238基因的功能域研究
  • 2.5 大豆疫霉Avh238的转录分析
  • 2.6 大豆疫霉Avh238基因具有高水平的多态性
  • 2.7 大豆疫霉Avh238-Race19不能引起烟草细胞的死亡
  • 2.8 过量表达Avh238基因降低大豆疫霉的致病性
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 附录
  • 攻读硕士学位期间发表的研究论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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