利用荧光定量实时PCR技术检测脊髓性肌萎缩症携带者与患者基于LDAP的信息网络管理解决方案

论文摘要

一、利用荧光定量实时PCR技术检测脊髓性肌萎缩症携带者与患者背景：脊髓性肌萎缩症（Spinal Muscular Atrophy，SMA）是常见的新生儿致死性常染色体隐性遗传病。临床表现为脊髓前角运动神经元退行性变导致患者肢体肌肉瘫痪，重者因呼吸肌瘫痪而死亡。SMN1的纯合缺失导致SMA，但同时还存在一个与SMN1高度同源的基因SMN2。SMN2与SMN1的主要差异是位于基因第7外显子内的一个同义突变（C→T），约70％的SMN2 mRNA最终合成无功能蛋白质。由于本病目前尚无有效治疗方法，以及高达1：40的携带率，快速准确的检测SMA的携带者与患者成为降低此病发病率的关键。目前常用的基因检测方法仅可检测SMN1纯合缺失，无法检测SMA携带者。目的：建立利用荧光定量实时PCR检测SMA患者与携带者的技术平台，对本组17个SMA家系共60人，15个正常对照进行SMN1 7号外显子缺失检测。方法：以荧光定量实时PCR技术为基础，采用特异性的Taqman探针与MGB探针，选择白蛋白基因做为内参基因，优化反应条件，设计标准化检测程序，建立SMN1与ALB的反应标准曲线，根据标准曲线标准化样品的反应起始量，通过计算标准品与待测样品SMN1起始反应量之比得出样品基因组内SMN1拷贝数。结果：应用荧光定量实时PCR技术对17个SMA家系，15正常个体对照，共75人进行SMN1基因缺失检测，SMN1 7号外显子相对拷贝数分布在[0.38，0.62]，[0.78，1.2]范围内，在目前公认的单拷贝与双拷贝范围内，在17个SMA家系中，检出携带者40人，患者17人，有3人未检测出SMA 7号外显子缺失，15个正常人对照皆未检测出缺失。应用PCR-酶切法对上述样本进行检测，检出SMA患者17例，非患者43例，15例正常对照未检测到缺失，与荧光定量法结果符合。结论：①首次联合应用荧光定量实时PCR技术、MGB探针技术和ALB内对照基因，建立了在ABI Real-Time平台上诊断SMA患者、携带者的基因诊断技术平台，经实验证实，该方法快速、准确。②应用荧光定量实时PCR技术诊断了17个SMA家系共60人，检出携带者40人，患者17人，3人未检测出缺失，15例正常对照样本未见缺失。③应用PCR-酶切法检测17个SMA家系共60人，检出患者17人，15例正常对照样本未见缺失。二、基于LDAP的信息网络管理解决方案背景：目前，我国医学研究机构、大型医院已基本实现了计算机信息化管理，但在信息系统管理方面仍旧存在不少问题尚待解决。主要包括：关键业务数据量的快速增长，给原有的存储系统带来了很大压力；计算机病毒的快速传播、黑客人侵给系统管理以及数据安全带来巨大挑战；客户计算机用户权限过高，导致整个软件系统环境安全性降低、风险加剧、管理成本上升。目的：设计开发一种新型的信息网络管理整体解决方案，解决目前的系统存在的缺陷。方法：以轻量级目录访问协议（Lightweight Directory AccessProtocol，LDAP）为基础，结合Windows 2003，Windows Server UpdateService，HP Array management Utility，Firewall，Anti virus software等先进的计算机技术，解决目前系统存在的缺陷。结果与结论：新开发的系统在安全性、稳定性、移动性与兼容性方面设计了全新的架构，实现了新的功能。此系统已在医学遗传学国家重点实验室稳定运行33个月。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 缩略词
• 一、利用荧光定量实时PCR技术检测脊髓性肌萎缩症携带者与患者
• 1 前言
• 2 实验仪器及所用试剂
• 2.1 实验仪器
• 2.2 试剂与耗材
• 3 实验对象
• 4 实验方法
• 4.1 荧光定量实时 PCR法
• 4.2 PCR-酶切法
• 5 实验结果
• 5.1 荧光定量实时PCR法实验结果
• 5.2 PCR-酶切法实验结果
• 6 讨论
• 7 结论
• 8 参考文献
• 综述 脊髓性肌萎缩症的临床及遗传学研究进展
• 二、基于 LDAP的信息网络管理解决方案
• 1 前言
• 2 系统硬件及软件
• 2.1 系统硬件
• 2.2 软件
• 3 系统架构
• 3.1 网络拓扑改造
• 3.2 架构安装
• 3.3 系统配置
• 4 结果与讨论
• 5 参考文献
• 附录 脊髓性肌萎缩症的知情同意书
• 致谢
• 攻读硕士学位期间参与的研究项目与奖励