徐浩:毛竹CCR基因家族成员生物信息学和表达模式分析论文

徐浩:毛竹CCR基因家族成员生物信息学和表达模式分析论文

本文主要研究内容

作者徐浩,孙化雨,王思宁,杨意宏,赵韩生,高志民(2019)在《毛竹CCR基因家族成员生物信息学和表达模式分析》一文中研究指出:肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素生物合成的关键酶之一,对木质素生物合成途径的碳流具有重要的调控作用。研究毛竹(Phyllostachys edulis) CCR基因的分子特征和表达模式对于揭示影响竹子材性的木质素调控机制具有重要意义。采用同源序列比对的方法在毛竹基因组中获取13个CCR基因同源序列,其中9个具有完整的保守结构域,依次命名为PeCCR1~PeCCR9。PeCCRs基因的内含子数量、长度和位置均存在较大差异,如PeCCR2有5个内含子,而PeCCR5没有内含子;内含子最长的为4 090 bp,最短的仅为89 bp。PeCCRs编码的氨基酸序列长度范围为136~391 aa,推测分子量在14.97~43.05 kD之间,理论等电点介于5.60~8.31之间。PeCCRs的氨基酸序列在N-端和C-端均存在明显的差异,二级、三级结构进一步显示了其差异,但中部序列具有很高的一致性,都含有肉桂酰辅酶A还原酶家族蛋白特有的保守结构域和催化位点,表明其进化上是比较保守的。基于转录组数据的基因组织表达特异性分析表明,PeCCRs在各组织中的表达量差异明显,如PeCCR6在盛花期花序、鞭和笋中均未检测到基因表达,PeCCR9在盛花期花序中的表达是所有PeCCRs最高的,而PeCCR5在50 cm笋中则是所有检测到PeCCRs中最低的。本研究为进一步研究毛竹CCR基因家族成员的功能提供了参考,为利用基因工程调控竹子木质素提供了依据。

Abstract

rou gui xian fu mei Ahai yuan mei (CCR)shi mu zhi su sheng wu ge cheng de guan jian mei zhi yi ,dui mu zhi su sheng wu ge cheng tu jing de tan liu ju you chong yao de diao kong zuo yong 。yan jiu mao zhu (Phyllostachys edulis) CCRji yin de fen zi te zheng he biao da mo shi dui yu jie shi ying xiang zhu zi cai xing de mu zhi su diao kong ji zhi ju you chong yao yi yi 。cai yong tong yuan xu lie bi dui de fang fa zai mao zhu ji yin zu zhong huo qu 13ge CCRji yin tong yuan xu lie ,ji zhong 9ge ju you wan zheng de bao shou jie gou yu ,yi ci ming ming wei PeCCR1~PeCCR9。PeCCRsji yin de nei han zi shu liang 、chang du he wei zhi jun cun zai jiao da cha yi ,ru PeCCR2you 5ge nei han zi ,er PeCCR5mei you nei han zi ;nei han zi zui chang de wei 4 090 bp,zui duan de jin wei 89 bp。PeCCRsbian ma de an ji suan xu lie chang du fan wei wei 136~391 aa,tui ce fen zi liang zai 14.97~43.05 kDzhi jian ,li lun deng dian dian jie yu 5.60~8.31zhi jian 。PeCCRsde an ji suan xu lie zai N-duan he C-duan jun cun zai ming xian de cha yi ,er ji 、san ji jie gou jin yi bu xian shi le ji cha yi ,dan zhong bu xu lie ju you hen gao de yi zhi xing ,dou han you rou gui xian fu mei Ahai yuan mei jia zu dan bai te you de bao shou jie gou yu he cui hua wei dian ,biao ming ji jin hua shang shi bi jiao bao shou de 。ji yu zhuai lu zu shu ju de ji yin zu zhi biao da te yi xing fen xi biao ming ,PeCCRszai ge zu zhi zhong de biao da liang cha yi ming xian ,ru PeCCR6zai cheng hua ji hua xu 、bian he sun zhong jun wei jian ce dao ji yin biao da ,PeCCR9zai cheng hua ji hua xu zhong de biao da shi suo you PeCCRszui gao de ,er PeCCR5zai 50 cmsun zhong ze shi suo you jian ce dao PeCCRszhong zui di de 。ben yan jiu wei jin yi bu yan jiu mao zhu CCRji yin jia zu cheng yuan de gong neng di gong le can kao ,wei li yong ji yin gong cheng diao kong zhu zi mu zhi su di gong le yi ju 。

论文参考文献

  • [1].新书推荐:《视频图文版毛竹定向培育技术》[J]. 金爱武.  世界竹藤通讯.2019(02)
  • [2].桐城市毛竹科学栽培技术[J]. 吴飞银.  绿色科技.2019(09)
  • [3].毛竹快速生长期光合蒸腾日变化特征[J]. 胡策,梁谢恩,王海湘,徐超,周哲宇,朱丽娜,黄皓南,张汝民,温国胜.  浙江农林大学学报.2018(02)
  • [4].毛竹病虫害防控技术的探讨[J]. 许茂贵.  绿色科技.2018(03)
  • [5].毛竹卵圆蝽防治技术[J]. 赵平超.  植物医生.2018(07)
  • [6].毛竹种子“以芽繁芽”组培快繁问题初探[J]. 贲柳玲.  现代园艺.2016(24)
  • [7].毛竹向撂荒地扩展过程中叶功能性状变化[J]. 刘广路,范少辉,蔡春菊,刘希珍.  南京林业大学学报(自然科学版).2017(02)
  • [8].毛竹向撂荒地扩展过程中细根性状变化特征[J]. 刘广路,刘希珍,李雁冰,罗天磊,蔡春菊,范少辉.  热带作物学报.2017(07)
  • [9].上海地区毛竹种植的技术关键[J]. 陈征.  园林.2015(01)
  • [10].桂林幼龄毛竹开花报道及机理初探[J]. 刘代汉,陆祖军,李晓铁,秦丽凤.  桂林师范高等专科学校学报.2015(03)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的徐浩,孙化雨,王思宁,杨意宏,赵韩生,高志民,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年03期论文,是一篇关于毛竹论文,肉桂酰辅酶还原酶论文,生物信息学论文,表达模式论文,基因组学与应用生物学2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    徐浩:毛竹CCR基因家族成员生物信息学和表达模式分析论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢