染色体4q25区痛风易感基因的筛查

染色体4q25区痛风易感基因的筛查

论文摘要

目的:台湾学者与本课题组均通过研究发现染色体4q25区与原发性痛风的发病密切相关。本研究通过DNA芯片的方法,寻找该区域内与原发性痛风相关的基因多态性位点,探讨该区域与原发性痛风发病的相关性。方法:收集原发性男性痛风患者480例,男性正常对照480例。取研究对象外周抗凝血,QIAGEN试剂盒提取基因组DNA。应用hapmap数据库寻找tagSNP; Haploviewer软件检验SNP位点的Hardy-Weinberg平衡,确认研究对象选取的随机性;Golden Gate DNA芯片反应进行基因分型;x2检验比较不同组别基因型频率,确定该区域内与原发性痛风相关的SNP位点。结果:1.染色体4q25基因序列分析结果根据hapmap数据库及haploview软件运行结果,最终选取96个tagSNP(在选择SNP时要求最小等位基因频率最低0.05;R2最低值不低于0.8)。2.痛风组与对照组基因型频率比较根据芯片数据分析结果,全部芯片的call rate值为99.9%,在病例和对照组中,以基因为单位,有4个基因中各有一个tag SNP与痛风病的发病相关。根据Bonferroni correction的原则,96位点芯片显著性差异的P值应该小于5.2*10-1。通过校正,只有ELOVL6基因的rs12504538与痛风病的发病相关。结论:中国汉族男性痛风人群ELOVL6基因rs12504538位点多态性与原发性痛风关节炎发病密切相关,尚需进一步扩大样本验证,并通过功能试验进一步证实该位点多态性是否与痛风的发病有关。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 引言
  • 材料与方法
  • 1.1 实验仪器
  • 1.2 实验试剂
  • 1.3 实验方法
  • 1.4 附图、表
  • 结果
  • 2.1 两组间临床资料比较
  • 2.2 SNP位点Hardy-Weinberg平衡检验
  • 2.3 Golden Gate芯片数据分析结果
  • 2.4 Golden Gate芯片数据校正结果
  • 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 综述
  • 参考文献
  • 攻读学位期间的研究成果
  • 致谢
  • 相关论文文献

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