中国家马的遗传多样性与母系起源研究

论文摘要

为了研究中国家马的遗传多样性与起源进化,本研究利用PCR技术和生物信息学技术对我国9个家马品种（宁强马、哈萨克马、贵州马、关中马、蒙古马、西藏马、关山马、云南马和广西马）182个个体的线粒体DNA（mtDNA） D-loop 247bp序列进行分析,得到如下主要结论:（1）在所分析的9个家马品种182条序列中,D-loop区T、C、A、G 4种核苷酸的平均比例分别为29.7%、26.6%、31.8%、11.9%。A+T含量为61.5%,G+C含量为38.5%,A+T含量明显高于G+C含量,符合哺乳动物线粒体DNA碱基组成的基本比例。（2）9个家马品种182条序列中,检测到70种单倍型,47个核苷酸多态位点,约占所测核苷酸长度的19.03%,其中有43个转换,2个颠换,2个转换与颠换共存。（3）9个家马品种单倍型多样度和核苷酸多样度在各品种中的分布分别为0.8420.994和0.02190.0293,均以关中马最小,蒙古马最大,平均单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.946和0.0247,表明中国家马具有丰富的遗传多样性。（4）mtDNA D-loop序列的NJ系统发育树表明,中国家马分为A-G 7个支系17个亚支系,表明为多母系起源。（5）引用了9条中国古代马的D-loop序列,对这9条序列和中国家马的70种单倍型构建NJ系统发育树,结果发现中国古代马与现代家马有相似的mtDNA支系,9条序列形成了7个单倍型,分别聚到A,E和F支系中;这个结果也指出史前时期蒙古草原的马群体可能是多起源的,经过对家马和古马DNA序列比对,支持当前所普遍接受的家马多起源学说。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 文献综述
• 1.1 中国家马的种质资源研究
• 1.1.1 我国马种的分布和生态特点
• 1.1.2 马品种资源的特点
• 1.1.3 马遗传资源管理
• 1.2 线粒体DNA 及其在马遗传多样性中的应用
• 1.2.1 动物线粒体DNA
• 1.2.2 线粒体DNA 在马遗传多样性研究中的应用
• 1.3 家马遗传多样性研究进展
• 1.3.1 形态学水平的遗传多样性
• 1.3.2 细胞学（染色体）水平的遗传多样性
• 1.3.3 生化同工酶水平的遗传多样性
• 1.3.4 DNA 分子水平的遗传多样性
• 1.4 家马的起源分化研究
• 1.5 本研究的目的和意义
• 第二章 实验部分
• 2.1 实验材料
• 2.2 试剂与仪器
• 2.2.1 试剂
• 2.2.2 仪器
• 2.3 实验方法
• 2.3.1 基因组DNA 的提取与检测
• 2.3.2 线粒体DNA D-loop 的扩增
• 2.3.3 PCR 产物的纯化与回收
• 2.3.4 线粒体DNA 的测序
• 2.3.5 数据处理
• 2.4 结果与分析
• 2.4.1 中国家马线粒体DNA 控制区序列变异
• 2.4.2 中国家马单倍型间的系统发育分析
• 2.5 讨论
• 2.5.1 中国家马的遗传多样性
• 2.5.2 中国家马的母系起源
• 第三章 结论
• 参考文献
• 致谢
• 作者简介