水稻CesA9和Expansin基因的功能分析

水稻CesA9和Expansin基因的功能分析

论文摘要

细胞壁是地球上生物质的主要形式,是人类生活所需要的纤维材料和生物能源原料。纤维素是细胞壁的主要成分之一,是地球上最丰富的生物大分子和最重要的可再生资源。因此对纤维素合酶的研究具有重要意义。本实验室从韩国Postech突变体库(http://www.postech.ac.kr/life/pfg/)购买了纤维素合酶的T-DNA突变体,鉴定出了OsCesA9的纯合突变体,并初步研究了该基因的功能。具体结果如下:1、纤维素合酶多克隆抗体的制备选择OsCesA1、OsCes2、OsCesA3基因的特异区段设计引物,制备了三种纤维素合酶的抗原,抗原纯化后免疫家兔获得特异性较强的多克隆抗体。2、不同生育期的表型观察通过全生育期的表型观察发现,该突变体矮且脆,分蘖数少,叶片的机械拉力仅为野生型的10%。3、纤维素合酶基因的表达分析利用定量PCR检测纤维素合酶基因的表达,结果表明:突变体中OsCesA9基因的表达极显著降低。次生壁基因OsCesA4的表达量极显著降低,OsCesA7的表达基本不变。OsCesA1、OsCesA3、OsCesA8、OsCesA2、OsCesA5、OsCesA6表达均极显著降低。4、细胞壁成分分析突变体中晶体纤维素的含量减低47.62%,非晶体纤维素含量降低30.15%,半纤维素的含量升高18.08%,果胶的含量升高23.89%。木质素的主要单体G、S、H的含量均降低。5、育性分析与野生型相比,突变体的花粉活力低;花药短小且颜色较浅;部分花粉粒形状不规则。6、体外活性分析与野生型相比,突变体体外合成纤维素的活性极显著降低。Expansin是一种促进细胞壁松弛和伸展的蛋白,在植物生长发育过程中起着广泛的作用,如促进种子萌发、果实成熟、花器官发育等。该蛋白主要分为四个亚家族:EXPA (a-expansins)、EXPB (β-expansins)、EXLA (expansin-like A)和EXLB (expansin-like B)。本研究通过分析Expansin与细胞壁多糖之间的关系来初步探讨该家族基因的功能,具体结果如下:1、Expansin基因的芯片表达谱分析珍汕97和明恢63的33个组织芯片表达谱分析表明,OsEXPs基因在组织表达中具有特异性,如OsEXPA2、OsEXPA5、OsEXPA10、OsEXPA11、OsEXPA12、OsEXPA29、OsEXPB1、OsEXPB4、OsEXPB6主要在种子萌发后生长2天的胚芽、胚根和愈伤组织中表达;OsEXPA9、OsEXPA12、OsEXPA13、OsEXPA14、OsEXPA17、OsEXPA22、OsEXPA23、OsEXPA24、OsEXPA28、OsEXPA31、OsEXPB5主要在种子萌发后生长2天的胚根和幼根中表达;OsEXPA26、OsEXPA32、OsEXPB9、OsEXPB1a、OsEXPB10主要在雄蕊和穗中表达。2、OsExp/CslD/GT基因的共表达芯片分析珍汕97和明恢63的33个组织芯片表达谱分析表明,OsExp/CslD/GT基因在光暗处理的胚芽、胚根及开花前一天的雄蕊中存在着共表达。3、RT-PCR及Real-time PCR检测OsExp/CslD/GT基因的共表达以珍汕97为材料,RT-PCR检测基因的表达,结果与芯片数据一致,OsEXP/CSL/GT基因在光暗处理的胚芽、胚根及开花前一天的雄蕊中存在着共表达。以日本晴及其突变体(C1、C6、C15、G40)为材料,RT-PCR检测光暗处理的胚芽及胚根中基因的表达,结果表明OsExp/CslD/GT共表达模式与珍汕97一致。RT-PCR及Real-time PCR的结果表明,OsExp/CslD/GT在雄蕊中共表达。4、Expansin与细胞壁多糖之间的关系在水稻胚芽中,通过分析细胞壁多糖成分与多糖合成相关基因GT家族基因之间的关系以及OsGT与Expansin之间的共表达关系,推测OsEXPA1、OsEXPA10可能主要作用于纤维素微纤丝与木糖之间,促进细胞壁的松弛。在水稻胚根中,通过分析细胞壁多糖成分与多糖合成相关基因OsCslD家族基因之间的关系以及OsCslD与(?)Expansin之间的共表达关系,推测OsEXPB5可能主要作用于纤维素微纤丝与木糖之间,促进细胞壁的松弛。在水稻雄蕊中,通过分析通过分析细胞壁多糖成分与多糖合成相关基因OsCslD家族基因之间的关系、OsCslD与Expansin之间的共表达关系以及基因表达的组织特异性,推测OsEXPA26、OsEXPB9、OsEXPB10、OsEXPB1a主要作用于纤维素微纤丝与果胶或纤维素微纤丝与半纤维素之间,促进细胞壁松弛。

论文目录

  • 第一章 摘要
  • 摘要
  • Abstract
  • 缩略语表
  • 第一章 水稻CesA9基因的功能分析
  • 1 文献综述
  • 1.1 细胞壁的结构与化学组成
  • 1.1.1 初生细胞壁(primery wall)
  • 1.1.2 次生细胞壁(secondary wall)
  • 1.2 纤维素的结构及生物合成
  • 1.3 纤维素合酶
  • 1.3.1 纤维素合酶的发现
  • 1.3.2 纤维素合酶的结构
  • 1.3.3 纤维素合酶的表达调控
  • 1.3.4 纤维素合酶基因的功能
  • 1.4 本研究的目的与意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 水稻纤维素合酶多克隆抗体的制备
  • 2.2.2 OsCesA9的T-DNA突变体的鉴定与分析
  • 2.2.3 OsCesA9基因在细胞壁合成中的作用
  • 3 结果与分析
  • 3.1 纤维素合酶OsCesA1/OsCesA2/OsCesA3多克隆抗体的制备
  • 3.1.1 原核表达载体的构建及鉴定
  • 3.1.2 重组OsCESAs的诱导表达
  • 3.1.3 重组蛋白的纯化
  • 3.1.4 OsCESAs抗体的制备与效价检测
  • 3.1.5 OsCESAs抗体的Western-blotting分析
  • 3.1.6 OsCESAs抗体特异性检测
  • 3.2 OsCesA9 T-DNA纯合突变体的鉴定及OsCesA9功能分析
  • 3.2.1 T-DNA插入位点分析及OsCesA9 T-DNA纯合突变体的鉴定
  • 3.2.2 OsCesA9的功能分析
  • 4 讨论
  • 4.1 纤维素合酶突变体的特性
  • 4.2 纤维素合酶基因突变位点分析
  • 4.3 纤维素合酶与水稻育性的关系
  • 第二章 水稻Expansin基因与细胞壁多糖之间关系的研究
  • 摘要
  • Abstract
  • 1 文献综述
  • 1.1 Expansin的发现
  • 1.2 Expansin的分子结构
  • 1.3 Expansin的基因家族
  • 1.4 Expansin的作用机制
  • 1.5 Expansin的功能
  • 1.5.1 Expansin在种子萌发中的作用
  • 1.5.2 Expansin对细胞组织生长的作用
  • 1.5.3 Expansin在根系发育中的作用
  • 1.5.4 Expansin在果实发育及软化中的作用
  • 1.6 细胞壁的结构及细胞壁多糖的合成
  • 1.7 本研究的目的和意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 选材依据
  • 2.1.2 水稻材料及处理
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 光暗处理下的表型观察
  • 2.2.2 水稻材料总RNA的提取
  • 2.2.3 反转录cDNA第一条链的合成
  • 2.2.4 PCR反应
  • 2.2.5 Real-time荧光定量PCR
  • 2.2.6 细胞壁成分的测定
  • 3 结果与分析
  • 3.1 明恢63和珍汕97水稻品种Expansin的表达谱芯片分析
  • 3.2 明恢63和珍汕97水稻品种Expansin与Csl和GT的共表达芯片分析
  • 3.3 光暗条件下胚芽和胚根的长度变化
  • 3.4 Expansins在水稻胚芽中的功能分析
  • 3.4.1 基因芯片分析
  • 3.4.2 光暗处理条件下的基因表达与成分分析
  • 3.4.3 不同材料胚芽中的基因表达与成分分析分析
  • 3.5 Expansins基因在水稻胚根中的功能分析
  • 3.5.1 基因芯片分析
  • 3.5.2 光暗处理条件下的基因表达与成分分析
  • 3.5.3 不同材料的胚根中OsExpansins、OsCslDs和OsGTs的表达分析
  • 3.6 Expansins基因在雄蕊中的功能分析
  • 3.6.1 基因芯片分析
  • 3.6.2 雄蕊中基因的共表达与成分分析
  • 3.6.3 不同材料中基因的表达差异与成分分析
  • 4 讨论
  • 4.1 芯片表达与RT-PCR表达的一致性
  • 4.2 Expansin与细胞壁多糖之间的关系
  • 4.2.1 水稻胚芽中Expansin基因与细胞壁多糖之间的关系
  • 4.2.2 水稻胚根中Expansin基因与细胞壁多糖之间的关系
  • 4.2.3 水稻雄蕊中Expansin与细胞壁多糖之间的关系
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 相关论文文献

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