论文题目: 水稻microRNA和其它相关小分子RNA的克隆鉴定
论文类型: 博士论文
论文专业: 发育生物学
作者: 鲁玉柱
导师: 吕应堂
关键词: 水稻
文献来源: 武汉大学
发表年度: 2005
论文摘要: mciroRNA作为一种真核生物体内的重要的调节因子,近年来在动物和植物中被广泛研究。许多工作证明,这些microRNA在生物体内有着非常重要的调节功能,几乎涉及到了所有的细胞水平方面的功能(Bartel,2004)。由于目前在各个物种中所鉴定的microRNA的数量远远不及其理论上的饱和值,所以对microRNA的分离鉴定依然是对microRNA研究的一个热点方向。拟南芥作为一个模式植物在2000年便完成了对其基因组的测序(The Arabidopsis Genome Initiative 2000)。但是拟南芥作为一种双子叶的植物,其microRNA的代表意义在植物中总是有限度的。一些在单子叶植物中所特有microRNA可能会仅在对拟南芥的microRNA的研究中被遗漏。水稻作为单子叶植物同时是一种重要的粮食作物,在2002年便完成了对其基因组草图的测序(yu等,2002)。这是我们克隆水稻microRNA的前提基础。对水稻microRNA的克隆鉴定有着非常重要的理论和现实意义!除此外,许多研究表明生物体内还有许多其它小分子RNA,比如,siRNA在生物体内依然还有其调节目标基因的功用。 因此,我们采用传统的克隆手段,在水稻中克隆出178个小分子RNA序列,在这些序列中鉴定出9个microRNA,其中包括在拟南芥中发现的miR167和miR171。现将我们的研究结果小节如下: 1.所克隆的178个小分子RNA的序列遍布水稻的12条染色体,其中在基因组中属于单拷贝的序列是129个,属于多拷贝的序列是49个;它们在水稻基因组内的位点是726个;分布在基因间的序列是130个(70%):分布在转座子内的序列有6个(3%):与基因
论文目录:
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本论文缩略词表
第一章 前言
引言
第一节 关于microRNA
1.microRNA的发现过程
2.microRNA的代谢机制和功能鉴定
2.1.microRNA的代谢机制
2.2.动物中microRNA的生物学功能
2.3.植物中的microRNA
3.通过microRNA的转录后的抑制
第二节 另外一种小分子RNA—siRNA和与其关联的RNAi途径
1.RNAi的发现
2.RNAi的发生是多步骤的
3.转录后基因沉默的机制
4.RNAi的起始步骤
5.沉默机制的放大和扩展
6.RNAi的功效实施步骤
7.RNAi机制中的其它的成分
8.RNAi的生物学功能
9.RNAi和基因组学
10.miRNA和siRNA的区别
第三节 microRNA的克隆鉴定
1.从整个基因组内努力分离鉴定microRNA
2.microRNA的登记方式
结论
展望
本研究的意义
第二章 水稻microRNA和其它小分子RNA的克隆鉴定
第一节 材料和方法
1.材料
2.方法
第二节 结果与分析
1.实验结果
2.实验数据及其分析
2.1.所测序列及其在水稻基因组内的分布分析
2.2.克隆序列的二级结构及其在基因组内分布的分析
2.3.microRNA在水稻不同组织的表达分析
2.4.水稻microRNA在不同植物中的保守性
2.5.预测水稻microRNA的目标基因
第三章 总讨论
1.对水稻microRNA克隆鉴定的意义
2.水稻其它小分子RNA的克隆意义
3.关于我们在水稻中克隆鉴定的microRNA
3.1.水稻microRNA的克隆鉴定、基因组分布、及其表达
3.2.关于低丰度microRNA的鉴定
3.3.水稻microRNA和它的靶基因
3.4.所鉴定microRNA的其它特性
4.关于目前整个microRNA研究中的关键问题和对未来的展望
参考文献
在读期间所发表的文章
致谢
发布时间: 2006-03-27
参考文献
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