水稻短生育期突变体sgp（t）的基因精细定位

论文摘要

本实验室发现了一个水稻短生育期突变体sgp(t)。前期遗传分析及基因定位表明,该突变体由一对不完全显性基因控制,可能是水稻抽穗期调控的一个新的关键基因。本研究在前期定位结果的基础上,构建sgp(t)/02428杂交F2的定位群体,进行SGP(t)基因的精细定位。利用sgp(t)/02428杂交F2群体将SGP(t)基因定位到标记CAPS023与N13之间。其中CAPS023位于克隆AP004989上,N13位于克隆AP003723上,物理距离为224.4kb。由于在该区段内sgp(t)与02428多态性差,又利用sgp(t)/9311杂交F2新群体继续定位。最终将SGP(t)基因定位到标记CAPS072与N51之间,两个标记均位于克隆AP004989上,物理距离为53.0kb。研究结果为进一步确定候选基因,以及后续的SGP(t)基因功能互补验证、表达分析奠定了基础。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第1章 引言
• 1.1 水稻抽穗期的遗传研究
• 1.1.1 水稻的生育期
• 1.1.2 水稻抽穗期的遗传
• 1.2 水稻抽穗期分子机理的研究
• 1.2.1 光周期调控水稻抽穗期的分子机理研究
• 1.2.1.1 Hd1 与Ehd1
• 1.2.1.2 Hd3a/RFT1
• 1.2.1.3 基因间的联系
• 1.2.2 水稻抽穗期自主途径分子机理的研究
• 1.2.3 水稻与拟南芥抽穗期基因间的保守性
• 1.2.4 存在的问题
• 1.2.5 水稻抽穗期调控的应用
• 1.3 图位克隆
• 1.4 本研究的目的和意义
• 第2章 材料与方法
• 2.1 材料
• 2.1.1 定位亲本的选择
• 2.1.2 定位群体的构建
• 2.1.3 群体的种植
• 2.1.4 抽穗期的调查
• 2.1.5 采样
• 2.1.6 引物来源
• 2.1.7 主要仪器
• 2.2 方法
• 2.2.1 DNA 的提取
• 2.2.2 PCR 反应
• 2.2.3 琼脂糖凝胶电泳
• 2.2.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳
• 2.2.5 基因定位
• 第3章 结果与分析
• 3.1 抽穗期的调查
• 3.2 前期定位结果的验证
• 3.3 原有sgp（t）/9311 极端表型群体的基因定位
• 3.4 sgp（t）/02428 杂交F2 新群体的基因定位
• 3.5 sgp（t）/9311 杂交F2 新群体的基因定位
• 第4章 讨论
• 4.1 突变体材料的独特性
• 4.1.1 难得的突变体材料
• 4.1.2 重要的理论意义
• 4.1.3 具有广阔的应用前景
• 4.2 基因定位的分析
• 4.3 下一步工作
• 参考文献
• 附录
• 致谢