江西水域不同群体黄颡鱼形态差异比较及遗传多样性分析

论文摘要

黄颡鱼属（Peletoagrus）隶属于硬骨鱼纲,鲶形目（siluriofmres）,鲿科（Bagridae）。为一种小型名优经济鱼类,广受消费者喜欢。江西境内有赣江、抚河、信江、饶河、修河等五大流域,五河流域汇聚了江西省境内的绝大部分地表径流并最终流入鄱阳湖。境内的鄱阳湖是中国最大的淡水湖泊,也是目前仅存的两个通江湖泊之一,蕴含着丰富的渔业资源。目前关于黄颡鱼的研究主要集中在长江流域、武汉等地,较少见关于江西水域黄颡鱼的相关研究报道。鄱阳湖“五河”地形独特,地理环境不同,是研究黄颡鱼的良好场所。本论文以广布种普通黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）为材料,从形态、分子遗传学两方面来对江西水域不同群体普通黄颡鱼展开相关研究,旨在为黄颡鱼的保护和合理开发利用,良种的选育提供一手资料和科学指导。1黄颡鱼种质资源普查于2009.05-2010.10期间对江西五大河流和鄱阳湖水域进行全面的黄颡鱼种质资源调查。共在14个采样点,获得862尾野生黄颡鱼。结果显示,江西水域黄颡鱼种质资源还是较为丰富,尚处安全状态,但是黄颡鱼呈现低龄化的情况应该引起我们的关注和采取相应的应对措施。普通黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）在江西五大河流和鄱阳湖水域均有分布,且数量众多；而在万安、湖口还发现有瓦氏黄颡鱼（Peheobagrus Vachell）的分布,尤其是在湖口地区瓦氏黄颡鱼体重明显大于普通黄颡鱼,赣州有长须黄颡鱼（Pelteobagrus eupogon）的分布,南昌有光泽黄颡鱼（Pseudobagrus nitidus）的分布。湖口为黄颡鱼种质资源最丰富的地区。此次黄颡鱼分布调查结果与褚新洛（1999）在中国动物志——硬骨鱼纲（鲇形目）中描述的黄颡鱼分布结果较为接近。同时发现,近年来因为人工过度捕捞,河道内采沙船的滥挖,使得黄颡鱼的产卵地遭到破坏,已经出现严重的黄颡鱼小龄化情况,有必要引起相关部门的重视,采取相应的保护及应对措施。2不同群体黄颡鱼形态分化比较本研究采用聚类分析、判别分析、主成分分析等多元统计分析方法,从形态学角度阐述江西境内9个野生普通黄颡鱼群体间的形态分化,并对其进行分析,同时选取了一个养殖群体作为对照。其结论如下：对可量性状多元分析发现普通黄颡鱼不同群体外部形态差异明显。聚类分析显示,9个群体普通黄颡鱼可分为3支：鄱阳、永修、抚州、余干4个群体聚为一支；南昌、赣州、峡江、万安群体聚为一支；湖口距离最远,单独聚为一支。作为对照的养殖群体,在遗传距离上介于湖口与万安之间。主成分分析反映,湖口群体差异最显著,万安次之。判别分析发现,建立的判别函数综合辨别率达81.67%,交互验证后达77.49%。上述3种多元分析结果表明,江西水域9个普通黄颡鱼群体在形态上已产生了一定程度的分化,且集中表现在头部与尾部纵向长短指标上,尤其是湖口、万安群体差异最显著。这种形态上的分化更多的是为了适应其独特的生活习性以及所处的水域环境造成的。3黄颡鱼遗传多样性分析利用前人已开发出来的12对黄颡鱼SSR引物,对赣州（GZ）、万安（WAN）、湖口（HK）3个野生普通黄颡鱼群体进行了遗传多样性分析。将12对SSR引物通过优化反应条件筛选,获得10对有效引物,7个微卫星位点,且都具有多态性。7个微卫星位点上检测出103个等位基因,每个位点的等位基因数2-8个不等,大小在84-280bp之间。3个群体的平均观察杂合度为（He）0.62,其中HK群体最高（0.6509）,GZ群体次之（0.6209）,WAN最小（0.5882）。3个群体的平均PIC为0.5633.其中GZ群体为：0.5618,HK群体为0.5944,WAN群体为0.5336。WAN与GZ遗传相似指数最高为0.7314,遗传距离最小0.3128；GZ与湖口的遗传相似指数、遗传距离居中。WAN与HK群体遗传相似指数最小0.7002,遗传距离最大0.3517.由此可推断WAN与GZ亲缘关系较为接近,WAN与HK群体亲缘关系最远。SSR分析结果表明,目前赣江和湖口水域黄颡鱼种质资源尚处于安全状态,遗传多样性丰富程度较高。各项遗传多样性指标接近或者略高于已报道的别的水域黄颡鱼群体。而万安群体由于长期的地理隔离,遗传多样性已有所降低,有必要引起我们的重视,采取相应的措施以防止这一情况继续恶化,更好的维系黄颡鱼的种质资源安全。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 引言
• 1.1 江西水域简介
• 1.1.1 江西水域概述
• 1.1.2 鄱阳湖自然概述
• 1.1.3 江西五大水系简介
• 1.1.4 鄱阳湖水系资源状况
• 1.2 黄颡鱼的研究概述
• 1.2.1 分类及分布格局
• 1.2.2 生理生化等方面的研究
• 1.3 DNA分子标记在黄颡鱼遗传研究中的应用
• 1.3.1 分子标记技术介绍
• 1.3.2 分子标记在黄颡鱼遗传学研究中的应用
• 1.3.3 未来的研究方向
• 1.4 形态度量在鱼类研究中的应用
• 1.5 SSR分子标记技术在水生生物遗传多样性研究中的应用
• 1.5.1 遗传多样性概述
• 1.5.2 遗传多样性研究的目的和意义
• 1.5.3 SSR分子标记在水生生物研究中的应用
• 第二章 江西水域黄颡鱼不同群体形态差异分析
• 2.1 引言
• 2.2 材料与方法
• 2.2.1 实验材料
• 2.2.2 数据测量与处理
• 2.2.3 分析方法
• 2.3 结果与分析
• 2.3.1 黄颡鱼种质资源调查结果
• 2.3.2 聚类分析
• 2.3.3 主成分分析
• 2.3.4 判别分析
• 2.4 讨论
• 第三章 江西水域黄颡鱼群体遗传结构的研究
• 3.1 引言
• 3.2 材料与方法
• 3.2.1 试验材料
• 3.2.2 试验试剂与溶液
• 3.2.3 主要仪器设备
• 3.2.4 实验方法
• 3.2.5 黄颡鱼微卫星分析
• 3.3 结果与分析
• 3.3.1 基因组DNA提取结果
• 3.3.2 SSR结果分析
• 3.3.2.1 基因位点、等位基因分析
• 3.3.2.2 遗传杂合度（H）和多态信息含量（PIC）分析
• 3.3.2.3 3个黄颡鱼群体的遗传相似性指数和遗传距离
• 3.3.2.4 群体间遗传分化
• 3.4 讨论
• 3.4.1 黄颡鱼3个群体的遗传多样性水平
• 3.4.2 群体间的亲缘关系与遗传分化
• 第四章 总结
• 4.1 种质资源调查
• 4.2 不同群体黄颡鱼形态分化与分析
• 4.3 3个黄颡鱼群体的遗传多样性分析
• 4.4 形态差异分析与遗传多样性之间的关系
• 致谢
• 参考文献
• 攻读学位期间的研究成果