B组轮状病毒核酸杂交检测方法的建立及其初步应用

B组轮状病毒核酸杂交检测方法的建立及其初步应用

论文摘要

人B组轮状病毒(group B rotavirus,GBRV)由我国洪涛1983年首次发现,主要感染成年人,在我国多次引起大规模的暴发性腹泻的大流行。人群B组轮状病毒抗体水平调查结果显示,其他国家和地区人群中都检测到滴度不同的B组轮状病毒抗体。除了中国之外,在周边国家印度、孟加拉等国也相继从散发的霍乱样腹泻病例中检测到B组轮状病毒。本研究旨在建立一种方便、快捷、灵敏高、特异性强的检测技术和方法,用于B组轮状病毒的检测,有助于深入研究B组轮状病毒的生物学特征、流行病学规律、检测技术以及防治措施等。用PCR法对B组轮状病毒nsp5基因作同位素标记,测试探针的灵敏度和特异性,并用于检测腹泻样本。结果显示探针灵敏度达500pg,特异性好,不与无关的基因产生杂交信号。检测来源于武汉市的94例腹泻标本,其中阳性一例,用RT-PCR和序列测定的方法对该检测结果进行了验证。根据B组轮状病毒ADRV的vp7基因序列设计合成引物,在上、下游引物5’端标记生物素,用PCR法制备GBRV vp7基因片段的生物素标记探针,灵敏度达50ng,用同样的方法制备了地高辛标记探针,灵敏度达10ng,特异性好。本研究所采用的核酸杂交方法可用作B组轮状病毒的初筛,也可用来验证其它方法的检测结果,或是用于B组轮状病毒的流行病学研究。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 B组轮状病毒的病毒学特点
  • 1.1 形态结构
  • 1.2 B组轮状病毒的理化性质
  • 1.3 B组轮状病毒的基因组及其编码蛋白质
  • 1.4 RNA在 PAGE上迁移特征
  • 1.5 B组轮状病毒的分离培养
  • 2 人B组轮状病毒的流行病学
  • 3 检测方法
  • 3.1 电镜法(electronic microscope,EM)
  • 3.2 免疫学检测技术
  • 3.3 基因检测技术
  • 3.4 病毒分离
  • 4 研究目的与意义
  • 第二章 同位素标记nsp5基因探针及其杂交检测
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 方法
  • 2 实验结果
  • 2.1 探针灵敏度试验
  • 2.2 探针的特异性试验
  • 2.3 杂交温度对探针灵敏度的影响
  • 2.4 探针检测腹泻样本
  • 2.5 阳性样的RT-PCR认证
  • 2.6 nsp5基因克隆质粒的限制性内切酶分析
  • 2.7 含nsp5基因的克隆质粒的PCR分析
  • 2.8 阳性样nsp5基因序列测序结果如下
  • 3 讨论
  • 第三章 生物素标记vp7基因探针及其杂交检测
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 方法
  • 2 实验结果
  • 2.1 生物素标记vp7基因探针的电泳检测
  • 2.2 探针标记效率
  • 2.3 探针灵敏度
  • 3 讨论
  • 第四章 地高辛标记vp7基因探针及其杂交检测
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 方法
  • 2 实验结果
  • 2.1 探针灵敏度测定
  • 2.2 探针特异性测定
  • 2.3 探针检测腹泻样本
  • 3 讨论
  • 小结
  • 参考文献
  • 在校期间发表的论文、科研成果等
  • 致谢
  • 相关论文文献

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