本文主要研究内容
作者侯胜奎（2019）在《猪性染色体生物信息学分析及精液纯度评价方法的研究》一文中研究指出：性控精液作为动物性别控制最重要的组成部分之一,对畜牧业的发展具有重要意义,高质量性控精液的生产,需要建立高效、准确的精液纯度评价方法。下载NCBI数据库中猪X、Y性染色体序列,通过序列BLAST比对,找出X、Y性染色体特有基因,对X、Y性染色体特有基因进行GO、KEEG分析;在已找到的X、Y特有基因中各随机挑选5个进行基因保守性分析,找出保守性比较高的X、Y性染色体特有基因用于后续试验;建立实时荧光定量PCR检测精液纯度的方法;采用不同比例的性控精液对检测方法的检测效果进行验证。主要结果如下:1.通过BLAST比对分析找到PLP、SYP、TLR等共计856个X染色体特有基因,SRY、AMELY、UTY等共计58个Y染色体特有基因。并对X、Y性染色体特有基因进行GO、KEEG分析,其中X特有基因PLP注释到基因上调、炎症反应、细胞膜等二级功能;Y特有基因SRY注释到性别分化、雄性性别决定、序列特异性DNA结合等二级功能。通过对X、Y性染色体特有基因保守性分析,挑选出保守性比较高的X特有基因PLP和Y染色体特有基因SRY用于后续试验。2.PLP基因系统发育树显示,猪与牛在亲缘关系上最近,与虹鳟鱼、黑腹果蝇在亲缘关系上关系最远;SRY基因系统发育树显示,牛与山羊、猪在亲缘关系上最近,牛和猪在亲缘关系上与小家鼠、褐家鼠关系最远。基因编码蛋白结构进行分析发现PLP基因存在多个跨膜结构域和PLP结构域,有多种剪接形式。SRY基因编码236个氨基酸,有HMG结构域和一个简单结构域,不存在跨膜结构域和信号肽。3.对牛X、Y特有基因PLP、SRY设计特异引物,构建含有PLP和SRY基因的质粒,把PLP和SRY质粒按照不同比例混合,即X:Y 1:20、1:10、1:5、1:1、5:1、10:1、20:1,进行实时荧光定量PCR,得到标准曲线,建立检测方法。对性控精液进行纯度检测,市售X分选精液检测平均纯度为90.73%(商标标注平均纯度91.67%),市售Y分选精液检测平均纯度为89.04%(商标标注平均纯度90.67%),市售未分选精液检测平均纯度为49.84%(理论平均纯度50%),经过对比,本研究建立的方法检测精液纯度与商标标注纯度差异不显著(P>0.05)。对市售X分选精液和Y分选精液DNA按照1:20、1:10、1:5、1:1、5:1、10:1、20:1比例混合,采用已建立的检测方法对混合精液进行纯度检测,混合精液检测纯度和理论值差异不显著。由以上研究结果可以得出以下结论:对猪性染色体做了生物信息学分析找出了X、Y染色体的特异基因,筛选性染色体特异基因建立了实时荧光定量PCR检测方法,检测准确度高,可用于性控精液纯度的评价。为今后开展动物性控精液精确检测和性别控制进一步研究奠定了基础。
Abstract
xing kong jing ye zuo wei dong wu xing bie kong zhi zui chong yao de zu cheng bu fen zhi yi ,dui chu mu ye de fa zhan ju you chong yao yi yi ,gao zhi liang xing kong jing ye de sheng chan ,xu yao jian li gao xiao 、zhun que de jing ye chun du ping jia fang fa 。xia zai NCBIshu ju ku zhong zhu X、Yxing ran se ti xu lie ,tong guo xu lie BLASTbi dui ,zhao chu X、Yxing ran se ti te you ji yin ,dui X、Yxing ran se ti te you ji yin jin hang GO、KEEGfen xi ;zai yi zhao dao de X、Yte you ji yin zhong ge sui ji tiao shua 5ge jin hang ji yin bao shou xing fen xi ,zhao chu bao shou xing bi jiao gao de X、Yxing ran se ti te you ji yin yong yu hou xu shi yan ;jian li shi shi ying guang ding liang PCRjian ce jing ye chun du de fang fa ;cai yong bu tong bi li de xing kong jing ye dui jian ce fang fa de jian ce xiao guo jin hang yan zheng 。zhu yao jie guo ru xia :1.tong guo BLASTbi dui fen xi zhao dao PLP、SYP、TLRdeng gong ji 856ge Xran se ti te you ji yin ,SRY、AMELY、UTYdeng gong ji 58ge Yran se ti te you ji yin 。bing dui X、Yxing ran se ti te you ji yin jin hang GO、KEEGfen xi ,ji zhong Xte you ji yin PLPzhu shi dao ji yin shang diao 、yan zheng fan ying 、xi bao mo deng er ji gong neng ;Yte you ji yin SRYzhu shi dao xing bie fen hua 、xiong xing xing bie jue ding 、xu lie te yi xing DNAjie ge deng er ji gong neng 。tong guo dui X、Yxing ran se ti te you ji yin bao shou xing fen xi ,tiao shua chu bao shou xing bi jiao gao de Xte you ji yin PLPhe Yran se ti te you ji yin SRYyong yu hou xu shi yan 。2.PLPji yin ji tong fa yo shu xian shi ,zhu yu niu zai qin yuan guan ji shang zui jin ,yu hong zun yu 、hei fu guo ying zai qin yuan guan ji shang guan ji zui yuan ;SRYji yin ji tong fa yo shu xian shi ,niu yu shan yang 、zhu zai qin yuan guan ji shang zui jin ,niu he zhu zai qin yuan guan ji shang yu xiao jia shu 、he jia shu guan ji zui yuan 。ji yin bian ma dan bai jie gou jin hang fen xi fa xian PLPji yin cun zai duo ge kua mo jie gou yu he PLPjie gou yu ,you duo chong jian jie xing shi 。SRYji yin bian ma 236ge an ji suan ,you HMGjie gou yu he yi ge jian chan jie gou yu ,bu cun zai kua mo jie gou yu he xin hao tai 。3.dui niu X、Yte you ji yin PLP、SRYshe ji te yi yin wu ,gou jian han you PLPhe SRYji yin de zhi li ,ba PLPhe SRYzhi li an zhao bu tong bi li hun ge ,ji X:Y 1:20、1:10、1:5、1:1、5:1、10:1、20:1,jin hang shi shi ying guang ding liang PCR,de dao biao zhun qu xian ,jian li jian ce fang fa 。dui xing kong jing ye jin hang chun du jian ce ,shi shou Xfen shua jing ye jian ce ping jun chun du wei 90.73%(shang biao biao zhu ping jun chun du 91.67%),shi shou Yfen shua jing ye jian ce ping jun chun du wei 89.04%(shang biao biao zhu ping jun chun du 90.67%),shi shou wei fen shua jing ye jian ce ping jun chun du wei 49.84%(li lun ping jun chun du 50%),jing guo dui bi ,ben yan jiu jian li de fang fa jian ce jing ye chun du yu shang biao biao zhu chun du cha yi bu xian zhe (P>0.05)。dui shi shou Xfen shua jing ye he Yfen shua jing ye DNAan zhao 1:20、1:10、1:5、1:1、5:1、10:1、20:1bi li hun ge ,cai yong yi jian li de jian ce fang fa dui hun ge jing ye jin hang chun du jian ce ,hun ge jing ye jian ce chun du he li lun zhi cha yi bu xian zhe 。you yi shang yan jiu jie guo ke yi de chu yi xia jie lun :dui zhu xing ran se ti zuo le sheng wu xin xi xue fen xi zhao chu le X、Yran se ti de te yi ji yin ,shai shua xing ran se ti te yi ji yin jian li le shi shi ying guang ding liang PCRjian ce fang fa ,jian ce zhun que du gao ,ke yong yu xing kong jing ye chun du de ping jia 。wei jin hou kai zhan dong wu xing kong jing ye jing que jian ce he xing bie kong zhi jin yi bu yan jiu dian ding le ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自河北农业大学的侯胜奎，发表于刊物河北农业大学2019-09-19论文，是一篇关于性染色体论文,牛性控精液论文,纯度论文,河北农业大学2019-09-19论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自河北农业大学2019-09-19论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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