AB-QTL法定位海岛棉产量及纤维品质基因

论文摘要

利用优异的陆地棉栽培品种中棉所36和海岛棉品种海1杂交,中棉所36为轮回亲本,构建含BC1F1、BC2F1和BC1S1三个世代的回交群体,利用BC1F1分离群体以SSR标记构建连锁图谱,采用复合区间作图方法（CIM）对产量性状和纤维品质性状进行QTL定位研究,以将海岛棉优异基因导入陆地棉优异栽培品种,来拓宽陆地棉狭窄的遗传基础,为品种改良提供更丰富的资源材料。1.用亲本（中棉所36和海1）和F1DNA对不同来源的3223对SSR引物进行多态性筛选,共筛选到294对含有海1显性带的引物,占筛选引物总数的9.12%;最终对其中的264对引物进行了群体扩增,获得277个SSR标记差异位点。连锁分析表明（LOD=6.5）,有217个标记位点连锁,分布在44个连锁群中,覆盖1908.67cM,约占棉花基因组的42.89%;平均每个连锁群有27.46个标记,覆盖43.38 cM;标记间平均间距为8.80cM。2.利用BC1F1、BC2F1和BC1S1三个不同世代分离群体产量性状数据,共定位9个产量性状QTL,解释表型变异6.90%～19.17%。其中,衣分2个,铃重5个,籽指2个。控制衣分的2个QTL可在三个不同的世代稳定检测到。3.依据BC1F1、BCF1和BCS1三个不同世代的纤维品质数据,共定位纤维品质5个性状的30个QTL。其中,长度7个QTL;强度8个QTL;伸长率8个QTL;整齐度4个QTL;马克隆值3个QTL。每个QTL分别解释6.62%～15.38%的表型变异。有2个纤维长度的QTL可在三个不同世代中稳定检测到,1个与纤维长度相关和1个与纤维强度相关的QTL可在BC1S1和BC2F1两个世代稳定检测到。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 文献综述
• 1.1 遗传标记的类型及其发展
• 1.1.1 形态标记（morphological marker）
• 1.1.2 细胞学标记（cytologiealmarker）
• 1.1.3 生化标记（biochemical marker）
• 1.1.4 分子标记（molecular marker）
• 1.2 分子标记的类型及其应用
• 1.2.1 基于DNA-DNA杂交的DNA标记
• 1.2.2 基于PCR的DNA分子标记技术
• 1.2.3 基于PCR与限制性酶切结合的DNA标记
• 1.2.4 基于单核苷酸多态性的DNA标记
• 1.3 分子连锁图谱的构建
• 1.3.1 作图群体
• 1.3.2 棉花分子标记连锁群在染色体上的定位
• 1.4 QTL定位的基本原理和方法
• 1.5 棉花分子生物学的研究进展
• 1.5.1 四倍体棉种的起源与进化
• 1.5.2 四倍体棉花基因组的特点
• 1.5.3 棉花数量性状基因座（QTL）的研究进展
• 1.6 棉花分子育种的问题及展望
• 1.6.1 特异种质资源相对匮乏，其创造、鉴定和遗传评价尚待加强
• 1.6.2 饱和遗传图谱，开发适于辅助选择的分子标记
• 1.6.3 重要性状QTLs的遗传机理有待进一步明确
• 1.6.4 完善分子标记辅助育种平台，实现分子设计育种
• 1.7 研究的目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 田间实验
• 2.1.1 实验材料
• 2.1.2 表型性状调查
• 2.1.3 表型数据统计分析
• 2.2 室内实验
• 2.2.1 DNA提取
• 2.2.2 SSR标记技术
• 2.2.3 标记筛选和群体扩增
• 2.2.4 分子连锁图谱构建和染色体定位推测
• 2.2.5 QTL定位
• 3 结果和分析
• 3.1 表型数据分析
• 3.2 分子连锁图谱构建
• 3.2.1 标记筛选和群体扩增
• 3.2.2 分子连锁图谱构建
• 3.2.3 连锁群的染色体定位
• 3.2.4 标记的偏分离
• 3.2.5 标记的亚基因组分布
• 3.3 QTL分析
• 3.3.1 产量相关性状QTL定位
• 3.3.2 纤维品质相关性状 QTL定位
• 3.3.3 QTL的成簇分布现象
• 4 讨论
• 4.1 高代回交QTL分析法
• 4.2 标记的偏分离
• 4.3 分子连锁图谱的构建
• 4.4 产量及纤维品质相关性状的QTL分析
• 4.5 QTL的成簇分布（QTL clusters）
• 4.5.1 同类性状 QTL成簇分布
• 4.5.2 不同类性状 QTL成簇分布
• 4.5.3 QTL成簇分布与性状同步改良问题
• 4.6 标记及QTL在A、D亚基因组的分布
• 4.6.1 标记及连锁群在A、D亚基因组的分布
• 4.6.2 QTL在A、D亚基因组的分布
• 4.7 稳定遗传的QTL与分子标记辅助选择
• 5 全文结论
• 5.1 分子连锁图谱构建
• 5.2 QTL分析
• 参考文献
• 符号表
• 致谢
• 个人简历