7种寄生粘孢子虫基于18S rDNA的系统发生研究及多涅茨尾孢虫3种群遗传多样性分析

7种寄生粘孢子虫基于18S rDNA的系统发生研究及多涅茨尾孢虫3种群遗传多样性分析

论文摘要

本文研究内容涉及2004-2006年在重庆部分地区鲫(养殖水体及自然水体)及2007年在东南沿海厦门沿岸(24o26ˊN, 118o04ˊE)的部分海水鱼类(养殖水体及自然水体)上采得的粘体门粘孢子虫4属共7种粘孢子虫的形态与分子系统学研究。它们分别是:多涅茨尾孢虫Henneguya doneci Schulman;角形虫未定种1 Ceratomyxa sp. 1,角形虫未定种2 Ceratomyxa sp. 2,斯普氏角形虫Ceratomyxa sprenti Moser et al.,肾形角形虫Ceratomyxa reniforma Wu et al.;楚克拉虫未定种Zschokkella sp.;鲻鱼单囊尾虫Unicapsulocaudum mugilum(Zhao et al. in press)。本工作采用镜检法对粘孢子虫进行种类鉴别;本研究所采取的实验方法和分类系统均参照赵元莙宋微波(2003)所提出的方法和提倡的分类安排,描述则参照Lom & Arthur (1989)以及Lom & Dyková(1992)提出的方法进行。分子系统学研究采用遗传距离法和最大简约法完成了系统发生树的构建。分析研究了部分粘孢子虫分类阶元间的系统发生关系,并对不同标记方法和不同分析方法在粘孢子虫分类和系统学研究中的应用做了一定的探讨。通过对研究构建的分子支序树进行比较分析获得相关研究结果。本研究测得多涅茨尾孢虫3个种群之18S小亚基单位核糖体RNA基因的部分序列,并从Genbank下载了多数为淡水粘孢子虫的29虫种序列构建分子支序树,分析了多涅茨尾孢虫3个种群的遗传多样性及多涅茨尾孢虫的系统发生。本研究还完成了包含3个属6种粘孢子虫之18S小亚基单位核糖体RNA基因的部分序列测定。并选取Genbank中24种海水粘孢子虫的序列构建分子支序树,研究并探讨了6种粘孢子虫的系统地位。本研究结果表明,形态学分析与分子系统学分析基本吻合,因此,建议物种描述时同时提供形态学数据与分子数据更为完善。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第1章 前言
  • 第2章 材料与方法
  • 1、材料
  • 2、方法
  • 3、分类系统
  • 4、分子系统学研究
  • 第3章 多涅茨尾孢虫 4 种群基于 18S rDNA 遗传多样性分析
  • 1、数据来源
  • 2、结果
  • 3、讨论
  • 第4章 基于 18S rDNA 推断多涅茨尾孢虫系统位置
  • 1、系统发生简介
  • 2、序列选取
  • 3、结果与分析
  • 4、讨论
  • 第5章 6 种海水鱼类寄生粘孢子虫的系统地位研究
  • 1、形态鉴定与分子特征描述
  • 2、系统发生研究
  • 参考文献
  • 附录 硕士就读期间发表和已整理的文章及参研课题
  • 致谢
  • 相关论文文献

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