中国地区HIV-1 vpr基因多态性及其临床意义的研究

论文摘要

目的：通过对来自中国不同地区的HIV-1感染者的vpr基因序列的分析，比较我国HIV-1 vpr基因的变异位点与国外以往研究的异同，结合感染者的疾病特点及临床资料，挑选出有临床意义的变异，为进一步研究HIV-1 vpr基因变异的功能意义、作用机理及其与感染者临床病情的关系打下基础。方法：用逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）及巢式PCR（nestedPCR）的方法对348例HIV-1感染者血浆提取的病毒RNA进行HIV-1vpr基因的扩增，经琼脂糖凝胶电泳检测后送生物公司进行序列测定。用Blast，ClustalW及Mega等相关生物分析软件进行序列分析，分析中国HIV-1感染者的vpr基因的多态性特征，离散率和常见变异位点。同时将检测中发现的常见变异位点感染者的相应临床资料如病毒水平高低、淋巴细胞亚群的升降及临床病程的进展情况等，进行对比分析，观察HIV-1 vpr基因不同变异位点可能导致的不同的临床表现。结果：对348例确证为阳性的HIV-1感染者血浆标本进行HIV-1vpr基因扩增，得到PCR阳性产物共208份，测序后返回阳性序列159份，经分析后可用序列为153份。序列分析结果显示本批样本中HIV-1vpr基因序列分型主要是CRFO1-AE（51.63％），subtypeC（24.84％），subtypeB（17.65％），CRF03-AB（3.92％），CRF08-BC（1.31％），其他的亚型均少于1％。在HIV-1 Vpr氨基酸序列中保守位点所占比例为33.33％，且变异位点较分散，N末端及C末端均有分布，但线形分析显示C末端较N末端变异更明显。对于以往国外多个研究中所报导的77位精氨酸（Arg，R）变异为谷氨酰胺（Gin，Q）即R77Q的变异与艾滋病长期病情无进展（LTNP）密切相关的观点，我们分析了上述中国感染者的HIV-1 Vpr序列中第77位氨基酸84.3％为谷氨酰胺，故与国外研究结果有明显区别。同时我们结合临床资料发现HIV-1Vpr第55、63、70、85、86、89、94位氨基酸的变异，可能与感染者的临床表现有一定的关联。结论：1．我国HIV-1 Vpr的分型仍以M组为主，其中CRFOI-AE占优势。2．我国HIV-1 Vpr的保守位点所占比例远低于以往研究报导的Vpr序列。3．我国HIV-1 Vpr氨基酸序列中84.3％的序列第77位为谷氨酰胺（Gin，Q），与以往国外研究中所报导的该位置为精氨酸（Arg，R），以及R77Q与长期病情无进展（LTNP）相关的观点不同。4．我们发现HIV-1 Vpr第55、63、70、85、86、89、94位氨基酸的变异可能与感染者临床表现相关，并有待进一步研究。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 中英文缩略词
• 前言
• 第一章 材料与方法
• 1.1 实验材料
• 1.2 实验方法
• 第二章 结果
• 2.1 PCR产物的鉴定
• 2.2 序列测定结果
• 2.3 序列分析结果
• 2.4 C末端几个主要变异位点与临床表现的关系
• 第三章 讨论
• 第四章 结论
• 参考文献
• 综述
• 致谢