本文主要研究内容
作者谢珊珊（2019）在《利用整合组学开展MSTN编辑梅山猪的表型遗传分析》一文中研究指出：骨骼肌是产肉动物的主要肉类产品来源,也是重要的代谢器官,因此研究骨骼肌生长发育的分子机制意义重大。MSTN是一个重要的肌肉调节因子,可以负调控骨骼肌的生长发育。本研究对象是利用锌指核酸酶技术（ZFN）编辑的MSTN基因编辑梅山猪,与野生梅山猪相比该猪具有明显的双肌表型、高瘦肉率和生长速度快等特点。为了探究MSTN编辑梅山猪肌肉肥大和肌纤维转化的原因,本研究通过对胚胎期65天的各4头MSTN-/-编辑梅山猪和野生梅山猪背最长肌进行RNA-Seq,miRNA-Seq和iTRAQ测序分析,鉴定出与猪生长发育相关的差异表达基因、miRNA和蛋白,并验证了miRNA-95的功能,其分析结果将为后期进一步研究猪骨骼肌生长发育提供理论基础。主要研究结果如下:1.通过对背最长肌进行转录组测序,结果发现MSTN编辑梅山猪组较野生梅山猪组共鉴定出了438个差异基因,对这些差异基因进行功能分析,发现其主要参与了肌纤维发育形成,肌纤维收缩,肌纤维转化等过程中。同时还鉴定出了102个与肌肉生长相关的差异基因,主要参与肌细胞分化,肌肉组织发育,肌原纤维形成等过程,其中包括XK,ACTC1,IGFBP3,LRP4,METTL8,MYH7和AIMP2等差异表达基因。2.通过对背最长肌进行miRNA测序,本研究共鉴定出了20个差异显著表达的miRNA,其靶基因主要富集到了AMPK,mTOR和TGF-beta等信号通路上。3.通过对mRNA和miRNA整合分析发现了miRNA-208b,miRNA-499和miRNA-95以及LRP4,METTL8和AIMP2等与骨骼肌生长发育相关的关键miRNA和候选基因。4.在成肌细胞中初步验证miRNA-95的生物学功能,结果发现miRNA-95对成肌细胞的分化具有促进作用,其通过下调AIMP2表达而促进C2C12成肌分化。成肌细胞分化标志基因在miRNA-95过表达后显著上调,而在抑制miRNA-95表达后显著下调。通过生物信息学分析和双荧光素酶实验,本文发现在成肌细胞中AIMP2是miRNA-95的靶基因,通过干扰AIMP2内源表达,发现AIMP2在成肌细胞分化的过程中具有负调控的作用。5.iTRAQ测序总共鉴定出了2446个蛋白,其中有66个差异表达的蛋白,主要包括TNNT1,MYH1,MYH7,MYL9,TPM1,TNNI3,TNNI1,TNNC1和TNNT2等,这些蛋白主要富集到了骨骼肌的系统发育和生长以及糖酵解等生物学过程中,它们很可能是调控猪肌肉生长的重要蛋白。6.iTRAQ和转录组整合分析,结果发现了TNNT1和MYL9表达差异显著且在转录水平和蛋白水平表达一致,这两个基因与骨骼肌的生长发育和肌纤维转化相关,可能是其重要的候选基因。综上所述,本研究对胚胎期65天背最长肌的mRNA,miRNA和蛋白进行整合分析,鉴定出了与骨骼肌生长发育相关的基因、miRNA和蛋白,为进一步研究猪的生长发育提供了新的方向和目标。
Abstract
gu ge ji shi chan rou dong wu de zhu yao rou lei chan pin lai yuan ,ye shi chong yao de dai xie qi guan ,yin ci yan jiu gu ge ji sheng chang fa yo de fen zi ji zhi yi yi chong da 。MSTNshi yi ge chong yao de ji rou diao jie yin zi ,ke yi fu diao kong gu ge ji de sheng chang fa yo 。ben yan jiu dui xiang shi li yong xin zhi he suan mei ji shu （ZFN）bian ji de MSTNji yin bian ji mei shan zhu ,yu ye sheng mei shan zhu xiang bi gai zhu ju you ming xian de shuang ji biao xing 、gao shou rou lv he sheng chang su du kuai deng te dian 。wei le tan jiu MSTNbian ji mei shan zhu ji rou fei da he ji qian wei zhuai hua de yuan yin ,ben yan jiu tong guo dui pei tai ji 65tian de ge 4tou MSTN-/-bian ji mei shan zhu he ye sheng mei shan zhu bei zui chang ji jin hang RNA-Seq,miRNA-Seqhe iTRAQce xu fen xi ,jian ding chu yu zhu sheng chang fa yo xiang guan de cha yi biao da ji yin 、miRNAhe dan bai ,bing yan zheng le miRNA-95de gong neng ,ji fen xi jie guo jiang wei hou ji jin yi bu yan jiu zhu gu ge ji sheng chang fa yo di gong li lun ji chu 。zhu yao yan jiu jie guo ru xia :1.tong guo dui bei zui chang ji jin hang zhuai lu zu ce xu ,jie guo fa xian MSTNbian ji mei shan zhu zu jiao ye sheng mei shan zhu zu gong jian ding chu le 438ge cha yi ji yin ,dui zhe xie cha yi ji yin jin hang gong neng fen xi ,fa xian ji zhu yao can yu le ji qian wei fa yo xing cheng ,ji qian wei shou su ,ji qian wei zhuai hua deng guo cheng zhong 。tong shi hai jian ding chu le 102ge yu ji rou sheng chang xiang guan de cha yi ji yin ,zhu yao can yu ji xi bao fen hua ,ji rou zu zhi fa yo ,ji yuan qian wei xing cheng deng guo cheng ,ji zhong bao gua XK,ACTC1,IGFBP3,LRP4,METTL8,MYH7he AIMP2deng cha yi biao da ji yin 。2.tong guo dui bei zui chang ji jin hang miRNAce xu ,ben yan jiu gong jian ding chu le 20ge cha yi xian zhe biao da de miRNA,ji ba ji yin zhu yao fu ji dao le AMPK,mTORhe TGF-betadeng xin hao tong lu shang 。3.tong guo dui mRNAhe miRNAzheng ge fen xi fa xian le miRNA-208b,miRNA-499he miRNA-95yi ji LRP4,METTL8he AIMP2deng yu gu ge ji sheng chang fa yo xiang guan de guan jian miRNAhe hou shua ji yin 。4.zai cheng ji xi bao zhong chu bu yan zheng miRNA-95de sheng wu xue gong neng ,jie guo fa xian miRNA-95dui cheng ji xi bao de fen hua ju you cu jin zuo yong ,ji tong guo xia diao AIMP2biao da er cu jin C2C12cheng ji fen hua 。cheng ji xi bao fen hua biao zhi ji yin zai miRNA-95guo biao da hou xian zhe shang diao ,er zai yi zhi miRNA-95biao da hou xian zhe xia diao 。tong guo sheng wu xin xi xue fen xi he shuang ying guang su mei shi yan ,ben wen fa xian zai cheng ji xi bao zhong AIMP2shi miRNA-95de ba ji yin ,tong guo gan rao AIMP2nei yuan biao da ,fa xian AIMP2zai cheng ji xi bao fen hua de guo cheng zhong ju you fu diao kong de zuo yong 。5.iTRAQce xu zong gong jian ding chu le 2446ge dan bai ,ji zhong you 66ge cha yi biao da de dan bai ,zhu yao bao gua TNNT1,MYH1,MYH7,MYL9,TPM1,TNNI3,TNNI1,TNNC1he TNNT2deng ,zhe xie dan bai zhu yao fu ji dao le gu ge ji de ji tong fa yo he sheng chang yi ji tang jiao jie deng sheng wu xue guo cheng zhong ,ta men hen ke neng shi diao kong zhu ji rou sheng chang de chong yao dan bai 。6.iTRAQhe zhuai lu zu zheng ge fen xi ,jie guo fa xian le TNNT1he MYL9biao da cha yi xian zhe ju zai zhuai lu shui ping he dan bai shui ping biao da yi zhi ,zhe liang ge ji yin yu gu ge ji de sheng chang fa yo he ji qian wei zhuai hua xiang guan ,ke neng shi ji chong yao de hou shua ji yin 。zeng shang suo shu ,ben yan jiu dui pei tai ji 65tian bei zui chang ji de mRNA,miRNAhe dan bai jin hang zheng ge fen xi ,jian ding chu le yu gu ge ji sheng chang fa yo xiang guan de ji yin 、miRNAhe dan bai ,wei jin yi bu yan jiu zhu de sheng chang fa yo di gong le xin de fang xiang he mu biao 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国农业科学院的谢珊珊，发表于刊物中国农业科学院2019-07-05论文，是一篇关于梅山猪论文,骨骼肌论文,转录组论文,整合分析论文,中国农业科学院2019-07-05论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国农业科学院2019-07-05论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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