IL-6基因启动子区-572G/C、-597G/A多态性的实时荧光PCR检测及其与汉族人冠心病的关系

IL-6基因启动子区-572G/C、-597G/A多态性的实时荧光PCR检测及其与汉族人冠心病的关系

论文摘要

目的为了研究IL-6基因多态性与心血管病的相关性,根据荧光共振能量转移和溶点曲线分析原理,建立了一种IL-6基因快速分型的实时荧光分析方法。并通过对中国北方地区汉族人IL-6基因启动子区-572G/C,-597G/A多态性与体重指数(BMI)和炎症因子等生化指标的相关性的调查,探索基因多态性与冠心病(CHD)发生发展的关系。方法利用实时荧光PCR方法检测我国北方地区汉族人群IL-6基因启动子-572G/C,-597G/A的多态性。甘油三脂(TG)、总胆固醇(TC)采用酶法测定。高密度脂蛋白胆固醇(HDL)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL)采用均相酶法测定。脂蛋白a[Lp(a)]、载脂蛋白A1(ApoA1)、载脂蛋白A2(ApoA2)、载脂蛋白B(ApoB)、载脂蛋白C2(ApoC2)、载脂蛋白C3(ApoC3)、载脂蛋白E(ApoE)采用免疫透射比浊法测定。超敏C反应蛋白(hsCRP)采用颗粒增强的免疫散射比浊法测定。白细胞介素-6(IL-6)采用细胞因子芯片检测。通过实时荧光PCR方法、直接DNA测序、聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(RFLP)三种检测方法的比较,分析其对77例样本检测结果的一致性。结果一、在国内首次成功建立了同时检测IL-6基因启动子区-572G/C、-597G/A多态性的实时荧光PCR检测方法。用DNA测序方法验证检测结果正确。经对中国北方地区汉族123例健康对照和194例冠心病患者的IL-6基因检测,发现在-597位点仅有两种基因型,为GG型和GA型,尚未发现AA型。-572位点有三种基因型,分别为GG,GC,CC型。其中-597GA型为国内首次报道。二、实时荧光PCR方法、直接DNA测序、RFLP三种检测方法的比较分析发现:在77例样本中,采用实时荧光PCR方法与直接DNA测序相比仅有3例结果不一致。77例PCR产物用限制性内切酶BsrBI酶切,有20例与实时荧光PCR方法结果不一致。当PCR产物用限制性内切酶FokI酶切时,仅有5例是GA型,另外两例未被检测出。三、统计分析发现IL-6基因启动子区-572G/C基因型频率和等位基因频率在冠心病组和对照组中的分布差异无统计学意义。携带G等位基因(GG+GC)和非G等位基因(CC)频率在冠心病组和对照组中的差异有统计学意义。在正常对照组中,与非G等位基因相比,携带G等位基因组的收缩压中位数水平显著升高。在所有观测对象中,与非G等位基因相比,携带G等位基因组的BMI、hsCRP、收缩压中位数水平显著升高。四、Logistic回归分析显示,ApoC2、TH、lip(a)、年龄、TG、性别、高血压是本研究对象冠心病发生的独立危险因素,ApoAl是保护因子,未见G等位基因是一个独立的危险因子。结论实时荧光PCR方法在30分钟内能够完成32例样本两个位点的同时检测。与DNA测序、RFLP方法相比,具有简单、准确、快速的特点,便于临床实验室大规模样本筛查。本研究未发现IL-6基因启动子区-597G/A多态性与CHD的易感性有关,但发现-572G/C多态性与CHD的易感性有关。其机制可能与-572G/C多态性可导致BMI、hsCRP和血压的变化有关。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 正文
  • 第一部分 REAL-TIME PCR结合荧光标记探针同时检测IL-6基因启动子区-572G/C,-597G/A多态性方法的研究
  • 1 材料
  • 1.1 主要试剂
  • 1.2 主要仪器
  • 1.3 实验对象
  • 2 方法
  • 2.1 基因组DNA的提取
  • 2.2 引物及探针的设计
  • 2.3 反应原理
  • 2.4 PCR扩增
  • 2.5 基因型的验证
  • 3 结果
  • 3.1 PCR扩增曲线图及其产物的电泳鉴定
  • 3.2 不同浓度的探针对熔点曲线的影响
  • 3.3 不同引物浓度对熔点曲线的影响
  • 3.4 基因测序结果
  • 3.5 熔点曲线分析
  • 3.6 IL-6基因-572G/C基因分型及等位基因频率
  • 4 讨论
  • 第二部分 REAL-TIME PCR方法与DNA测序分析、RFLP方法检测IL-6基因启动子区多态性方法的比较研究
  • 1 材料
  • 1.1 主要试剂
  • 1.2 主要仪器
  • 1.3 实验对象
  • 2 方法
  • 2.1 real-time PCR分析77例研究对象IL-6基因多态性
  • 2.2 DNA测序分析
  • 2.3 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析
  • 3 结果
  • 3.1 real-time PCR分析77例研究对象IL-6基因多态性
  • 3.2 DNA测序分析77例研究对象IL-6基因多态性
  • 3.3 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析77例研究对象IL-6基因多态性
  • 4 讨论
  • 第三部分 IL-6基因启动子区多态性与体重指数和炎症因子等生化指标的相关性及与冠心病发生发展关系的探索
  • 1 材料
  • 1.1 主要试剂
  • 1.2 主要仪器
  • 1.3 实验对象
  • 2 方法
  • 2.1 运用Light Cycler实时荧光定量PCR仪分析317例中国北方汉族人IL-6基因多态性
  • 2.2 血压、超敏C-反应蛋白、BMI、血脂及脂蛋白水平测定
  • 2.3 血清IL-6水平测定
  • 2.4 统计学处理
  • 3 结果
  • 3.1 IL-6基因启动子区-572G/C,-597G/A多态性基因型和等位基因比较
  • 3.2 IL-6基因启动子区572G/C多态性和血压、hsCRP、血脂及脂蛋白水平之间的关系
  • 3.3 冠心病危险的多因素分析
  • 4 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 综述
  • 附录(英文缩写词表)
  • 攻读学位期间发表文章情况
  • 致谢
  • 相关论文文献

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