福氏4c志贺菌的脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型分析

论文摘要

我国福氏4c志贺菌的分离率近年来有升高的趋势。我们使用脉冲场凝胶电泳分型方法对2005—2006年在河南省、安徽省、山西省和甘肃省细菌性痢疾监测点分离到的322株福氏4c志贺菌进行了分析,发现有81种带型,以CNJZXN11.0002、CNJZXN11.0003带型为优势带型。其中,河南省、安徽省、山西省均以CNJZXN11.0003为主要带型,甘肃省的优势带型是CNJZXN11.0002。PFGE型别的分布有地区性差异。我们还使用多位点序列分型技术,对24株河南分离的福氏4c志贺菌、9株河南分离的其他血清型的福氏志贺菌和1株宋内志贺菌进行了分析。结果发现,24株福氏4c志贺菌菌株属于一个序列型,命名为ST91。ST91还包括其他血清型志贺菌,譬如福氏1a志贺菌、福氏2a志贺菌和福氏X变种志贺菌。通过与已经完成基因组分析的6株志贺菌和EcMLST数据库中19株志贺菌序列资料所作的种系发生树显示,ST91志贺菌和24577福氏2a志贺菌的亲缘关系较近。ST91志贺菌是我们首先命名的,可能已经在我国流行多年。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 引言
• 第一部分 福氏4C志贺菌的脉冲场凝胶电泳分析
• 1.1 材料和方法
• 1.1.1 实验菌株
• 1.1.2 主要试剂
• 1.1.3 仪器设备
• 1.1.4 福氏4c志贺菌的PFGE实验方法
• 1.1.4.1 胶块的制备
• 1.1.4.2 胶块内DAN的酶切、上样、电泳
• 1.1.4.3 电泳图像分析和结果聚类分析
• 1.2 实验结果
• PFGE结果和聚类分析
• 1.3.讨论
• 第二部分 福氏4c志贺菌的多位点序列分型
• 2.1 材料和方法
• 2.1.1 实验菌株
• 2.1.2 主要试剂
• 2.1.3 仪器设备
• 2.1.4 实验方法
• 2.2 实验结果
• MLST结果和进化分析
• 2.3 讨论
• 参考文献
• 致谢
• 附录1
• 附录2