微卫星标记多态性与波尔山羊生长性状的相关性研究

论文摘要

本试验根据山羊遗传连锁图谱选择20个微卫星标记,利用PCR技术对波尔山羊基因组DNA进行扩增,用以检测其群体遗传特征并进行了微卫星标记和出生体重、体长、体高、胸围、断奶体重、体长、体高、胸围和周岁体重、体长、体高、胸围的相关性分析,对微卫星标记各位点不同基因型个体间进行了多重比较,分析了各基因型对生长性状的影响。结果表明:所选择的20个微卫星标记在波尔山羊群体中表现出较好的多态性,共检测到193个等位基因,平均在每个位点检测到9.65个等位基因,平均有效等位基因数(Ne)为7.3287,平均多态信息含量(PIC)为0.8290,平均杂合度(H)为0.8478。利用SAS程序下的GLM过程,对20个微卫星位点进行生长性状的最小二乘分析,结果如下:(1)体重方面:INRA011位点228/228、INRA040位点238/238与246/216、ILSTS034位点193/167为出生体重的有利基因型。BM1312位点145/121、INRA011位点240/240、MAF064位点159/159、IDVGA64位点281/243、LSSCV37位点159/143与161/147、BMS1248位点162/162、CSSM047位点153/153、INRA129位点198/172为出生体重的不利基因型。INRA011位点228/228、IDVGA64位点245/245、INRA040位点238/238、ILSTS034位点193/167、BM0415位点136/136为断奶体重的有利基因型。MAF064位点141/141、INRA040位点238/238、CSSM047位点171/171为周岁体重的有利基因型。CSSM047位点171/153、SRCRSP10位点311/275为周岁体重的不利基因型。(2)体长方面:BM1312位点145/117、INRA040位点238/238为出生体长的有利基因型。INRA011位点240/240、MAF064位点159/159、IDVGA64位点281/243、NRA129位点198/172为出生体长的不利基因型。MAF070位点198/184为断奶体长的有利基因型。BM0415位点136/136、MCM527位点203/203与207/207为断奶体长的不利基因型。CSSM011位点206/206、NRA040位点238/238、CSSM047位点171/171、SRCRSP10位点303/269为周岁体长的有利基因型。(3)体高方面:INRA040位点238/238为出生体高的有利基因型。BM1312位点145/121、MAF064位点159/159、IDVGA64位点281/243、LSSCV37位点159/143与161/147、BMS1248位点162/162与142/142、INRA129位点198/172为出生体高的不利基因型。(4)胸围方面:INRA040位点238/238与246/216、INRA129位点178/178为出生胸围的有利基因型,INRA129位点198/172、LSSCV37位点161/147与159/143、MAF064位点159/159、IDVGA64位点281/243为出生胸围的不利基因型。IDVGA64位点245/245为断奶胸围的有利基因型。MAF070位点198/184与198/198为断奶胸围的不利基因型。BM1312位点145/117、INRA129位点178/178为周岁胸围的有利基因型。研究结果将为开展波尔山羊标记辅助选择提供依据。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 缩略词表
• 1 文献综述
• 1.1 分子生物学与动物育种
• 1.1.1 基因定位与数量性状的主效基/QTL
• 1.1.2 标记辅助选择（MAS）
• 1.1.3 分子育种中常用的分子标记
• 1.2 畜禽生长性状主基因研究现状
• 1.2.1 生长激素（GH）基因
• 1.2.2 生长激素受体（GHR）基因
• 1.2.3 IGF-I及IGFBP-3基因
• 1.2.4 肌肉生长抑制素（Myostatin,MSTN,GDF-8）基因
• 1.2.5 垂体特异性转录因子（POU1F1）基因
• 1.2.6 Callipyge（CLPG）基因
• 2 研究的目的和意义
• 3 材料与方法
• 3.1 材料
• 3.1.1 试验动物与样品采集
• 3.1.2 主要仪器设备
• 3.1.3 主要试剂
• 3.2 方法
• 3.2.1 山羊基因组DNA的提取、浓度测定和质量检测
• 3.2.2 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测
• 3.2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测
• 3.3 微卫星引物及反应条件
• 3.4 统计分析
• 3.4.1 群体等位基因频率
• 3.4.2 群体杂合度（H）
• 3.4.3 多态信息含量（PIC）
• 3.4.4 有效等位基因数（Ne）
• 3.4.5 标记基因型与波尔山羊生长性状的相关性分析
• 4 结果与分析
• 4.1 基因组DNA提取结果
• 4.2 微卫星多态性检测
• 4.2.1 琼脂糖凝胶电泳检测结果
• 4.2.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果
• 4.3 数据统计结果与分析
• 4.3.1 微卫星标记在波尔山羊群体中的基因频率
• 4.3.2 微卫星标记在波尔山羊群体中的遗传特性
• 4.3.3 20个微卫星位点各基因型与生长性状的最小二乘均值分析
• 5 讨论
• 5.1 关于微卫星标记的选择
• 5.2 利用微卫星标记分析群体的遗传特性
• 5.3 微卫星位点多态性与生长发育性状的关系
• 5.4 关于样本含量
• 6 小结
• 参考文献
• 致谢