基于靶点数据对治疗心血管疾病的中西药治病机理的比较

论文摘要

心血管疾病作为复杂疾病,其病因往往涉及到炎症,氧化环境压力,脂代谢,离子迁移和基因突变等多种生理过程。西药往往直接作用疾病病变网络、达到治疗疾病的药效。而基于整体协调治病理论的中药往往能够在多水平,多层次上系统性地纠正疾病状态。考虑到中西药对心血管疾病都有较好的疗效,因此从靶点水平分析两者之间的异同有助于揭示它们在治病机理上的差异,同时这些异同信息将有利于加深对心血管疾病病因的理解,有助于将来设计出更好的治疗手段。在本研究中,通过现有资源收集了治疗心血管类疾病的中西药靶点,并从靶点自身生物学特征和靶点在疾病网络中的分布特征来具体分析它们之间的异同。最后本工作以丹参活性化合物丹酚酸b为例,系统分析了中药有效成分治疗心血管疾病的机制。结果表明,西药在治疗心血管疾病过程中,通常作用于细胞膜附近的蛋白,处于生理通路的上游,而中药则趋向于影响一些基础生理通路,且作用在通路中下游的蛋白。此外,在调控一些与心血管疾病关联的生理过程中,中药不仅能够作用于西药治疗心血管疾病的通路,还能够通过其它通路来共同治疗心血管疾病。丹酚酸b主要通过调节机体免疫生理过程(炎症)来达到治病目的。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第1章 前言
• 1.1 心血管疾病的研究概况
• 1.2 西药治疗心血管疾病的概况
• 1.3 中药治疗心血管疾病的概括
• 1.4 中药丹参和所含化合物丹酚酸b目前的研究情况
• 1.5 CVD治病靶点的研究情况
• 1.6 课题研究的目的与意义
• 第2章 实验材料与方法
• 2.1 收集治疗CVD的中西药蛋白靶点
• 2.1.1 收集治疗CVD的西药蛋白靶点数据集
• 2.1.2 收集治疗CVD的中药蛋白靶点数据集
• 2.1.3 丹酚酸b治疗CVD蛋白靶点数据收集
• 2.1.4 分析蛋白靶点所用的数据信息
• 2.2 实验分析流程图
• 2.3 中西药靶点自身生物学特征的比较分析
• 2.3.1 超几何分布和P值
• 2.3.2 靶点的生物特征分析
• 2.4 中西药靶点在心血管疾病网络的比较分析
• 2.5 丹酚酸b治疗CVD的机理分析
• 2.5.1 分析丹酚酸b治疗CVD机理的步骤
• 2.5.2 网络模块化软件Netcarto的工作原理
• 第3章 中西药蛋白靶点的生物特征比较
• 3.1 收集治疗CVD中西药的靶点
• 3.2 中西药蛋白靶点的生化家族分类
• 3.3 中西药蛋白靶点细胞定位分析
• 3.4 中西药蛋白靶点结构家族分类
• 3.5 中西药蛋白靶点转录调控分析
• 3.6 中西药蛋白靶点在生物全局网络中拓扑学分析
• 3.7 中西药蛋白靶点在KEGG pathway中的富集分析
• 3.8 本章小结
• 第4章 中西药蛋白靶点在心血管疾病pathway中的分析
• 4.1 中西药蛋白靶点在炎症网络中的分析
• 4.2 中西药蛋白靶点在凋亡网络中的分析
• 4.3 中西药蛋白靶点在肌细胞收缩网络中的分析
• 4.4 中西药蛋白靶点在心血管疾病网络中的分析
• 4.5 本章小结
• 第5章 中药丹参所含丹酚酸b治疗心血管疾病的具体分析
• 5.1 丹酚酸b分子对接靶点和实验验证靶点的基本信息
• 5.1.1 丹酚酸b分子对接靶点的蛋白生化家族分析
• 5.1.2 丹酚酸b分子对接靶点的细胞定位分析
• 5.2 对接靶点对应的通路关联网络图分析
• 5.3 通路关联网络模块的具体分析
• 5.4 本章小结
• 第6章 结论与展望
• 6.1 全文总结
• 6.2 研究展望
• 参考文献
• 附录1 检索治疗CVD的中药蛋白靶点关键词列表
• 附录2 治疗CVD中西药蛋白靶点
• 附录3 治疗CVD的中西药蛋白靶点的KEGG pathway富集情况
• 致谢
• 攻读硕士学位期间的科研成果