四川生态区苏云金芽胞杆菌资源的筛选鉴定及其新型杀虫基因的克隆表达研究

四川生态区苏云金芽胞杆菌资源的筛选鉴定及其新型杀虫基因的克隆表达研究

论文摘要

苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,简称Bt)是目前研究最深入、使用最广泛的杀虫微生物之一。深入发掘我国丰富的苏云金芽胞杆菌资源,筛选高毒力及特异性菌株,对其基因型进行分析,分离克隆新型杀虫基因,其结果对微生物杀虫剂的研制、构建高效广谱工程微生物和培育转基因抗虫植物都具有重要的理论及实践意义。本研究对四川盆地不同生态区的Bt资源进行了较为系统的调查研究,从中分离克隆了数个新型杀虫基因,并进行了初步的表达研究,具体结果如下:1.采集四川不同生态区的土壤样品2650份,利用醋酸钠-抗生素法分离Bt菌791株,平均分离率为13.2%。分离出的菌株产生的伴胞晶体形态各异,有长菱形、短菱形、大菱形、小菱形、方形、球形、不定形等,充分显示了四川生态区Bt菌株资源多样性的特点。利用PCR-RFLP鉴定体系鉴定了791株Bt菌的杀虫晶体蛋白基因类型:其中522株含有cry1型基因,312株含有cry2型基因,20株含有cry3型基因,33株含有cry9型基因,28株含有cry4/10型基因,33株含有cry30型基因,3株含有cry40型基因。有80株菌未鉴定出基因型,对这些菌株的伴胞晶体SDS-PAGE分析结果表明:有的菌株表达130kDa和60kDa的蛋白;有的菌株表达90kD和40kDa的蛋白;有的菌株表达60kDa的蛋白;有的则表达90kDa左右的蛋白,可以推测,这些菌株极有可能含有新型的杀虫基因。2.系统地研究了四川生态条件下分离的Bt菌株Rpp02和Rpp39的生物学特性。根据形态特征、培养特征、细胞壁化学组分和生理生化分析,Rpp02菌株被定名为苏云金芽孢杆菌莫里逊亚种(Bacillus thuringiensis subsp.morrisoni),Rpp39被定名为苏云金芽孢杆菌杀虫变种(Bacillus thuringensis var.entomocidus)。Rpp02生长3h进入对数生长期,生长速率略快于Rpp39(4h),Rpp39与已知标准菌株HD-1生长速率相当。Rpp02产生大菱形、小菱形、圆形、不定形伴胞晶体,Rpp39产生菱形、方形和圆形伴胞晶体。PCR-RFLP鉴定结果表明Rpp02含有cry1Ab、cry1Ac、cry1Ca和cry1Ia四种基因,Rpp39含有cry1Aa、cry1Ab、cry1Ac、cry1Ia和cry2Aa五种基因。SDS-PAGE电泳分析Rpp02主要产生130kDa和40kDa大小的蛋白,Rpp39主要产生130kDa和60kDa的蛋白。3.设计了一对cry1Ac基因的特异引物,对Rpp02菌株基因组DNA进行PCR扩增,得到大约4kb的产物。测序结果表明,克隆到的片段含有一个较大的ORF框,该基因编码区为3534bp,编码1177个氨基酸,分子量为133.144kDa;等电点pI=4.825,为弱酸性蛋白质;亮氨酸(Leu)、丝氨酸(Ser)、谷氨酸(Glu)3种氨基酸含量最高,分别为7.98%、7.81%、7.73%。与已报道的cry1Ac序列同源性达到99%,存在着几个核苷酸以及编码氨基酸的差别。该基因序列的Accessionnumber为DQ285666,被国际Bt杀虫晶体蛋白基因命名委员会命名为cry1Ac20。该基因在大肠杆菌中得到了表达,表达产物具有较强的杀虫效果。4.以Rpp39为出发菌株,分离克隆了cry2Aa类杀虫晶体蛋白全长基因。序列分析显示该基因的开放阅读框(ORF)为1902 bp,编码由634个氨基酸组成的蛋白质。其氨基酸序列与Cry2Aa1蛋白同源性为99.7%,被国际Bt杀虫晶体蛋白基因命名委员会命名为cry2Aa12。根据cry2Aa12基因ORF两端序列,设计1对特异引物P3/P4,PCR扩增获得cry2Aa12完整ORF。将获得的片段与大肠杆菌表达载体pET-30a连接,构建了重组表达质粒pET-2Aa。将该质粒导入E.coli BL21(DE3),经IPTG诱导能正常表达,SDS-PAGE电泳验证含有65kDa表达蛋白。生物活性测定表明表达的包涵体蛋白对小菜蛾和二化螟具有杀虫活性,LC50分别为5.4μg/mL和22.3μg/mL。5.采用PCR-RFLP鉴定法,从菌株BtMC28中挖掘出一个新型杀虫模式基因,其部分序列与已知模式基因cry4Aa和cry10Aa的同源性分别为57%和60.5%。进一步采用Tail-PCR和Son-PCR技术获得了基因的全长序列。该基因的编码区为2022bp,编码673个氨基酸组成的蛋白,与Cry10Aa蛋白所氨基酸序列同源性最高为38%;其分子量为76.32kDa:异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、天冬酰胺(Asn)含量最高,分别为9.65%、9.36%、8.91%;它的等电点为7.535,属弱碱性蛋白。该新基因已在GenBank中注册,Accession number为EU339367。根据cry基因国际命名原则(即新发现的基因编码的氨基酸序列与已知蛋白同源性在45%以下为第一分类等级,用阿拉伯数字表示,如cry1、cry2、cry3…),该基因被国际Bt杀虫晶体蛋白基因命名委员会正式命名为cry54Aa1基因。根据cry54Aa1基因ORF两端序列,设计1对特异引物经扩增获得了cry54Aa1完整ORF。随后与大肠杆菌表达载体pET-30a连接,构建了重组表达质粒pET-54Aa。将该质粒导入E.coliBL21(DE3),经IPTG诱导能正常表达,SDS-PAGE电泳验证含有76kDa表达蛋白。生物活性测定表明表达的包涵体蛋白对甜菜夜蛾的LC50为5.8μg/mL,对伊蚊的LC50为6.02μg/mL。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 目录
  • 第一章 文献综述
  • 1 苏云金芽胞杆菌研究历史
  • 2 苏云金芽胞杆菌的生物学特性及分布
  • 3 Bt杀虫晶体蛋白基因
  • 3.1 杀虫晶体蛋白基因的分类及克隆
  • 3.2 杀虫晶体蛋白基因在Bt的分布
  • 3.3 杀虫晶体蛋白基因的表达调控
  • 3.4 杀虫晶体蛋白基因的鉴定
  • 4 苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白
  • 4.1 杀虫晶体蛋白的结构
  • 4.2 杀虫晶体蛋白的作用机制
  • 4.3 杀虫晶体蛋白结构与功能的关系
  • 5 苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白基因的基因工程
  • 6 一种DNA侧翼序列的分离技术
  • 6.1 TAIL-PCR技术的原理
  • 6.2 改良型TAIL-PCR
  • 7 本研究的立题依据和目的意义
  • 第二章 四川生态区苏云金芽胞杆菌的分离和cry基因的鉴定
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料与仪器
  • 1.2 研究方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 菌株的分离
  • 2.2 伴胞晶体形态的多样性
  • 2.3 苏云金芽胞杆菌cry基因的鉴定
  • 2.4 苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白分析
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第三章 菌株Rpp02和Rpp39的生物学特性研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 研究方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 菌株的鉴定
  • 2.2 杀虫晶体蛋白分析
  • 2.3 PCR-RFLP鉴定结果
  • 2.4 生长曲线
  • 2.5 生物测定
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第四章 Bt Rpp02中cry1Ac基因的克隆表达研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料与仪器
  • 1.2 研究方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 cry1Ac全长基因的克隆
  • 2.2 cry1Ac基因的核苷酸序列测定与分析
  • 2.3 Cry1Ac20氨基酸序列及蛋白质特性分析
  • 2.4 cry1Ac基因的表达
  • 2.5 cry1Ac基因表达产物的生物活性
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第五章 Bt Rpp39菌株中cry2Aa基因的克隆表达研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料与仪器
  • 1.2 研究方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 含cry2Aa基因的全长序列克隆
  • 2.2 cry2Aa基因的核苷酸序列测定与分析
  • 2.3 Cry2Aa12氨基酸序列及蛋白质特性分析
  • 2.4 cry2Aa12基因表达载体的构建
  • 2.5 cry2Aa12基因在大肠杆菌中的表达
  • 2.6 生物测定
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第六章 BtMC28中新型模式基因cry54Aa的克隆表达研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料与仪器
  • 1.2 研究方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 新型模式基因部分序列的克隆测序
  • 2.2 新型模式基因全长序列的克隆
  • 2.3 cry54Aa基因的核苷酸序列测定与分析
  • 2.4 Cry54Aa蛋白氨基酸组成与分析
  • 2.5 cry54Aa基因原核表达载体的构建
  • 2.6 cry54Aa基因在大肠杆菌中的表达
  • 2.7 cry54Aa基因表达产物的生物活性
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 在读期间发表的论文情况
  • 在读期间提交会议论文(摘要)情况
  • 在读期间申请专利情况
  • 相关论文文献

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