彭小川:禽流感病毒H5N1血凝素基因适应性进化过程中的关键位点突变规律研究论文

彭小川:禽流感病毒H5N1血凝素基因适应性进化过程中的关键位点突变规律研究论文

本文主要研究内容

作者彭小川,靳远,胡明达,周江林,周静,岳俊杰,任洪广,梁龙(2019)在《禽流感病毒H5N1血凝素基因适应性进化过程中的关键位点突变规律研究》一文中研究指出:目的:寻找导致禽流感病毒H5N1血凝素(HA)适应性进化的关键突变,建立氨基酸突变评价体系,对突变作用进行评估,印证它们与病毒适应性进化的关联性。方法:计算株频率和枝频率,寻找标记分枝,向根结点回溯寻找HA进化路径上的氨基酸突变。计算各突变位点氨基酸的频率变化、有效变换及高频次突变,基于以上几个因素建立突变评价体系。结果:建立了大规模自动化寻找突变的方法,计算得到HA进化过程中的氨基酸突变435个,通过氨基酸频率图表分析这些突变可以很好地反映病毒适应性进化过程,其中79个突变是有效变换,发生的位点为正选择位点,且多数位点落在HA抗原表位上;29个突变是高频次突变,其中多数也为有效变换,因而与病毒适应性进化密切相关。结论:大规模自动化寻找突变的方法可靠,建立的突变评价体系准确性高,找到的关键突变及位点对实验有很好的指导意义。

Abstract

mu de :xun zhao dao zhi qin liu gan bing du H5N1xie ning su (HA)kuo ying xing jin hua de guan jian tu bian ,jian li an ji suan tu bian ping jia ti ji ,dui tu bian zuo yong jin hang ping gu ,yin zheng ta men yu bing du kuo ying xing jin hua de guan lian xing 。fang fa :ji suan zhu pin lv he zhi pin lv ,xun zhao biao ji fen zhi ,xiang gen jie dian hui su xun zhao HAjin hua lu jing shang de an ji suan tu bian 。ji suan ge tu bian wei dian an ji suan de pin lv bian hua 、you xiao bian huan ji gao pin ci tu bian ,ji yu yi shang ji ge yin su jian li tu bian ping jia ti ji 。jie guo :jian li le da gui mo zi dong hua xun zhao tu bian de fang fa ,ji suan de dao HAjin hua guo cheng zhong de an ji suan tu bian 435ge ,tong guo an ji suan pin lv tu biao fen xi zhe xie tu bian ke yi hen hao de fan ying bing du kuo ying xing jin hua guo cheng ,ji zhong 79ge tu bian shi you xiao bian huan ,fa sheng de wei dian wei zheng shua ze wei dian ,ju duo shu wei dian la zai HAkang yuan biao wei shang ;29ge tu bian shi gao pin ci tu bian ,ji zhong duo shu ye wei you xiao bian huan ,yin er yu bing du kuo ying xing jin hua mi qie xiang guan 。jie lun :da gui mo zi dong hua xun zhao tu bian de fang fa ke kao ,jian li de tu bian ping jia ti ji zhun que xing gao ,zhao dao de guan jian tu bian ji wei dian dui shi yan you hen hao de zhi dao yi yi 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自生物技术通讯的彭小川,靳远,胡明达,周江林,周静,岳俊杰,任洪广,梁龙,发表于刊物生物技术通讯2019年01期论文,是一篇关于禽流感病毒论文,血凝素论文,适应性进化论文,关键突变论文,氨基酸频率论文,有效变换论文,高频次突变论文,生物技术通讯2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自生物技术通讯2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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