导读:本文包含了流平衡分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:COBRA,通量平衡分析,通量可变性分析,最小反应集
流平衡分析论文文献综述
赵圆圆[1]（2019）在《利用流平衡分析方法研究聚球藻代谢酶反应之间的协同性》一文中研究指出光合作用是生物界赖以生存的基础,也是地球碳氧循环的重要媒介。光合代谢系统提供了生命体基本的物质来源,同时是未来生物工业发展的基石。光合代谢网络的研究是生物学的热点问题之一。通过对全球碳循环的主要参与者和初级生产力的主要贡献者--光合生物蓝细菌聚球藻(Synechococcus)的代谢流、代谢途径等网络特性的研究,了解生物体代谢过程,以及酶反应之间的影响。生物过程的系统级建模和模拟,在定量和动态获得细胞功能方面具有指导作用。本文利用基于约束的代谢网络分析方法在计算机中模拟细胞代谢,分析聚球藻代谢网络的基本拓扑结构和网络内在联系。iJB785模型是为聚球藻Synechococcus elongatus PCC 7942建立的模型,以该聚球藻为实验对象,我们通过对其代谢网络中的反应进行逐一删除,使用FBA方法分析敲除反应后的代谢网络的通量分布,以及该反应的敲除对其余反应的影响,并找到代谢网络中对整个系统有影响的反应,进一步验证其网络理论和模型方法的可行性。对所构建的突变体进行代谢研究,比较其与野生型Synechococcus在上述功能方面的差异。并使用FVA方法找到给定约束条件的目标函数的最优值,并优化每个反应的最小和最大通量值,从而确定聚球藻代谢网络中每个反应通量的可允许范围,且通过使用FVA方法对网络中的反应进行分类,能粗略判断代谢网络的部分必需与非必需基因。代谢网络的最小反应集是能够维持生物体生命体征的最小反应集合,既可使生命体在恶劣的生存环境中保持最小的消耗,也可以在工业生产中实现最大的产出。传统的方法难以快速有效的找到达到某一生物学目标并满足最小化代谢调节的生命体的最小反应集,根据基因必要性,通过结合数学中的凸优化理论,找到一种在时间和规模上都优于传统方法的凸优化方法。(本文来源于《贵州师范大学》期刊2019-03-28）
袁肇凯,简维雄,黄献平,张月娟,孙安会[2]（2016）在《基于冠心病血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型的流平衡分析》一文中研究指出目的探讨冠心病(coronary artery heart disease,CHD)急、慢性血瘀证心肌细胞能量代谢的变化特点。方法 (1)运用Flux Explorer软件平台构建起的CHD血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型;(2)应用GC-MS技术和血气自动分析仪从健康对照、CHD慢性血瘀证、CHD急性血瘀证叁组大鼠模型中取冠状动脉血检测葡萄糖、脂肪酸及血氧含量;(3)检测结果代入网络模型,通过流平衡分析CHD急、慢性血瘀证状态下参数的特点。结果 (1)叁组的糖酵解、脂代谢和叁羧酸循环均已被激活,但网络运算后各组代谢物的数值则有明显差别,均呈现出健康对照组>CHD慢瘀证组>CHD急瘀证组的趋势。(2)叁组心肌细胞能量代谢的血糖、脂肪酸和血氧含量及ATP的产量均呈递减的趋势,这与叁组中糖酵解的关键酶(HK、pfk、PK)、叁羧酸循环的关键酶(Cs、Icdh、Od)的浓度呈一致性变化。结论 CHD急性血瘀和慢性血瘀不同证候的形成可能与机体内心肌细胞能量代谢的水平密切相关。(本文来源于《湖南中医药大学学报》期刊2016年02期）
袁肇凯,简维雄,黄献平,张月娟,孙安会[3]（2015）在《基于冠心病血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型的流平衡分析》一文中研究指出目的探讨冠心病急、慢性血瘀证心肌细胞能量代谢的变化特点。方法①运用FluxExplorer软件平台构建起的冠心病血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型;②应用GC-MS技术和血气自动分析仪从健康对照、冠心病慢性血瘀证、冠心病急性血瘀证叁组大鼠模型中取冠状动脉血检测葡萄糖、脂肪酸及血氧含量;③检测结果代入网络模型,通过流平衡分析冠心病急、慢性心血瘀证状态下参数的特点。结果①叁组的糖酵解、脂代谢和叁羧酸循环均已被激活,但网络运算后各组代谢物的数值则有明显差别,均呈现出健康对照组>CHD慢瘀证组>CHD急瘀证组的趋势。②叁组心肌细胞能量代谢的血糖、脂肪酸和血氧含量及ATP的产量均呈递减的趋势,这与叁组中糖酵解的关键酶(HK、pfk、PK)、叁羧酸循环的关键酶(Cs、Icdh、Od)的浓度呈一致性变化。结论冠心病急性血瘀和慢性血瘀不同证候的形成可能与机体内心肌细胞能量代谢的水平密切相关。(本文来源于《第九次全国中西医结合诊断学术研讨会论文集》期刊2015-07-19）
黎茂盛,王炜[4]（2007）在《基于路网子图空间的交通流平衡分析方法》一文中研究指出通过定义路网子图空间,提出了基于路网子图空间的Wardrop平衡原理,建立了相应的交通流平衡分析模型,并通过实例阐释了偏态均衡路网交通流的形成机理与演化过程。研究表明:该模型能够很好地解释包括新路开通期的路网交通流、换乘子图空间路网交通流、收费道路偏好子图空间路网交通流等多种情形下由于网络结构被差异性地认知所形成的偏态均衡路网交通流现象,为多标准下交通流的平衡分析建立了新途径;该分析方法有助于道路网络结构设计与道路网络管理方案的优化。(本文来源于《中国公路学报》期刊2007年02期）
黎茂盛,王炜,史峰[5]（2006）在《降级路网的认知及交通流平衡分析模型》一文中研究指出为定量衡量因路段降级原因导致路网通行能力的丧失量,分析出行者在降级路网中的路径选择行为将导致何种网络交通流平衡状态,通过将降级路网划分为车流外界因素导致路段可通行能力降级和路段上车流量增加导致道路服务水平的下降两种类型,辨别旅行时间长短与旅行时间波动对出行者路径选择行为的影响,推导出同时考虑这两方面因素影响的可变路径旅行时间风险度量;在此基础上建立了降级路网中的交通流平衡分析模型,该模型满足存在性和惟一性,并能正确描述出行者对降级路网结构认知差异性情况下的网络交通流平衡状态。通过实例展示了不同旅行可靠性要求下,出行者对路径旅行时间长短的权衡关系以及整个路网交通流平衡结果。(本文来源于《中国公路学报》期刊2006年06期）
陶冠阳[6]（2006）在《应用动态流平衡分析对代谢网络初步建模仿真》一文中研究指出现代生物信息技术,特别是高通量生物芯片技术的发展,使人类对生物体代谢网络的认识无论是知识量,还是知识的准确性都大大提高了。这就要求从系统角度全面和准确地描述代谢网络。随着系统生物学研究的兴起,采用计算生物学方法研究代谢网络建模,避免传统动力学方法的不足,成为生物代谢研究的热点之一。此类工作对于揭示深层次的代谢机理、生命本质,以及物种进化过程中与环境的相互作用和适应过程都有重要的作用和意义。本文主要分析了系统生物学方法动态流平衡分析(Dynamic Flux Balance Analysis DFBA)的数学理论基础-动态最优控制理论以及其数值解法,动态流平衡分析强调通过整合已有的生物信息重建生物代谢网络,在此基础上利用化学计量矩阵对整个网络进行动态特性的仿真。然后应用DFBA对大肠杆菌简化代谢网络建模,从系统角度以动态最优控制理论加深对微生物代谢的理解与认识。以大肠杆菌代谢网络为研究对象,对大肠杆菌简化代谢网络建模,初步模拟了大肠杆菌的二次生长现象。结合动力学信息,扩展动态流平衡分析的约束条件,对大肠杆菌中心碳代谢网络建立模型并求解。模拟结果与代谢网络的动态特性趋势相吻合。论文最后讨论了建模过程中遇到的一些问题以及模型将来可能的发展方向。通过对课题的研究,主要获得以下一些结论:可以对同样的代谢网络可以建立多个合理的动态流平衡模型;复杂的代谢网络中应用动态流平衡分析方法,在仅仅利用化学计量矩阵时,可以获得部分正确的代谢网络动态特性;结合动力学信息和化学计量矩阵信息,可以获得更多正确的代谢网络动态特性。(本文来源于《华中科技大学》期刊2006-05-01）
流平衡分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的探讨冠心病(coronary artery heart disease,CHD)急、慢性血瘀证心肌细胞能量代谢的变化特点。方法 (1)运用Flux Explorer软件平台构建起的CHD血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型;(2)应用GC-MS技术和血气自动分析仪从健康对照、CHD慢性血瘀证、CHD急性血瘀证叁组大鼠模型中取冠状动脉血检测葡萄糖、脂肪酸及血氧含量;(3)检测结果代入网络模型,通过流平衡分析CHD急、慢性血瘀证状态下参数的特点。结果 (1)叁组的糖酵解、脂代谢和叁羧酸循环均已被激活,但网络运算后各组代谢物的数值则有明显差别,均呈现出健康对照组>CHD慢瘀证组>CHD急瘀证组的趋势。(2)叁组心肌细胞能量代谢的血糖、脂肪酸和血氧含量及ATP的产量均呈递减的趋势,这与叁组中糖酵解的关键酶(HK、pfk、PK)、叁羧酸循环的关键酶(Cs、Icdh、Od)的浓度呈一致性变化。结论 CHD急性血瘀和慢性血瘀不同证候的形成可能与机体内心肌细胞能量代谢的水平密切相关。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
流平衡分析论文参考文献
[1].赵圆圆.利用流平衡分析方法研究聚球藻代谢酶反应之间的协同性[D].贵州师范大学.2019
[2].袁肇凯,简维雄,黄献平,张月娟,孙安会.基于冠心病血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型的流平衡分析[J].湖南中医药大学学报.2016
[3].袁肇凯,简维雄,黄献平,张月娟,孙安会.基于冠心病血瘀证心肌细胞能量代谢网络模型的流平衡分析[C].第九次全国中西医结合诊断学术研讨会论文集.2015
[4].黎茂盛,王炜.基于路网子图空间的交通流平衡分析方法[J].中国公路学报.2007
[5].黎茂盛,王炜,史峰.降级路网的认知及交通流平衡分析模型[J].中国公路学报.2006
[6].陶冠阳.应用动态流平衡分析对代谢网络初步建模仿真[D].华中科技大学.2006