山羊MSTN、IGFBP-3基因多态性及其与生长性能的关联性分析

论文摘要

本文采用PCR-RFLP技术分析了天府肉羊和波尔山羊MSTN基因内含子2,IGFBP-3内含子2及外显子2、3的酶切位点多态性,分析了这两种基因在品种内、品种间的群体遗传变异和物种间的系统发育及两种基因与天府肉羊、波尔山羊生产性状的相关性,结果表明:1.山羊MSTN基因内含子2部分序列中共检测到7个突变位点,其中4个单一信息位点,3个多态信息位点;碱基变异中以G-A转换、颠换为主（4/7）。波尔山羊内含子2序列的167、463位点处有AT碱基缺失。2.利用PCR-RFLP技术检测到天府肉羊、波尔山羊MSTN基因EcoRV酶切位点多态性,产生两种基因型,为AA和AB。A等位基因在群体中处于优势地位,其频率（0.932）大大高于等位基因B（0.068）。生产性能相关分析表明,在EcoRV基因座位上AA基因型个体的体高和初生重显著高于AB型个体（P＜0.05）,因此,表明不携带突变型等位基因B个体的体高和初生重更具优势。3.山羊IGFBP-3基因内含子2序列中共检测到25个突变位点,其中24个单一信息位点,1个多态信息位点,碱基变异全部为A-G,T-C转换、颠换。外显子2序列中共检测到12个突变位点,全部为单一信息位点,碱基变异主要为A-G,T-C转换、颠换（9/12）。外显子3序列中共检测到7个突变位点,全部为单一信息位点,碱基变异全部为A-G,C-G,T-C转换。4.IGFBP-3基因外显子2、3区域共编码74个氨基酸。外显子2序列编码21个氨基酸,有3个氨基酸发生变化,其中第15位谷氨酰胺变为色氨酸。第16位丙氨酸变为缬氨酸,第20位精氨酸变为组氨酸。外显子3序列编码53个氨基酸,有3个氨基酸发生变化,其中第488位组氨酸变为天冬氨酸,第494位甲硫氨酸变为苏氨酸,第499位甘氨酸变为丙氨酸。5.利用PCR-RFLP技术检测到天府肉羊、波尔山羊IGFBP-3基因FspBI酶切位点多态性,产生三种基因型,分别为AA、AG和GG。A等位基因在群体中处于优势地位,其频率（0.565）高于等位基因G（0.435）。生产性能相关分析表明,在FspBI基因座位上GG基因型个体的体长值要显著高于AG、AA型个体（P＜0.05）,且GG＞AG＞AA,因此,表明携带突变型等位基因G个体的体长更具优势。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1 文献综述
• 1.1 MSTN基因的研究现状
• 1.1.1 MSTN基因的发现
• 1.1.2 MSTN基因的结构和特征
• 1.1.3 MSTN基因的组织分布及表达
• 1.1.4 MSTN基因的作用机制
• 1.1.5 MSTN基因的突变及多态性
• 1.1.6 MSTN基因与生产性状的关系
• 1.2 胰岛素样生长因子的研究现状
• 1.2.1 胰岛素样生长因子的功能
• 1.2.2 IGFBP-3基因的研究进展
• 1.2.3 IGFBP-3基因的生物学作用
• 1.2.4 IGFBP-3基因的多态性
• 1.2.5 IGFBP-3基因与生产性状的关系
• 1.3 MSTN与IGFBP-3
• 1.4 PCR-RFLP标记
• 1.5 试验的目的和意义
• 2 材料和方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 试验动物
• 2.1.2 主要仪器设备
• 2.1.3 主要试剂和配制
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 技术路线
• 2.2.2 血样采集
• 2.2.3 基因组DNA的提取
• 2.2.4 DNA浓度和纯度检测
• 2.2.5 引物的设计与合成
• 2.2.6 PCR反应及目的产物检测
• 2.2.7 序列的测定
• 2.2.8 PCR-RFLP分析
• 2.3 数据处理与统计分析
• 2.3.1 序列比对
• 2.3.2 序列多态性分析
• 2.3.3 MSTN和IGFBP-3基因系统进化分析
• 2.3.4 山羊MSTN和IGFBP-3基因酶切多态性与生产性能的相关分析
• 3 试验结果与分析
• 3.1 基因组DNA的抽提结果
• 3.2 山羊MSTN基因PCR扩增结果
• 3.3 山羊IGFBP-3基因PCR扩增结果
• 3.4 山羊MSTN基因内含子2序列分析
• 3.4.1 MSTN基因内含子2的核苷酸序列
• 3.4.2 MSTN基因内含子2碱基组成
• 3.4.3 MSTN基因内含子2品种间核苷酸多态位点变异
• 3.4.4 MSTN基因内含子2品种间Kimura双参数遗传距离分析
• 3.5 山羊IGFBP-3基因内含子2,外显子2、3序列分析
• 3.5.1 牛IGFBP-3基因内含子2,外显子2、3的核苷酸序列
• 3.5.2 山羊IGFBP-3基因内含子2碱基组成
• 3.5.3 山羊IGFBP-3基因内含子2品种间核苷酸多态位点变异
• 3.5.4 山羊IGFBP-3基因外显子2、3碱基组成
• 3.5.5 山羊IGFBP-3基因外显子2、3品种间核苷酸多态位点变异
• 3.5.6 山羊IGFBP-3基因外显子2、3品种间氨基酸分析
• 3.6 山羊MSTN基因PCR-RFLP与生产性能的相关分析
• 3.6.1 山羊EcoRV酶切结果分析
• 3.6.2 山羊MSTN基因等位基因（型）在群体中的分布
• 3.6.3 EcoRV酶切位点不同基因型对山羊生长性能的影响
• 3.7 山羊IGFBP-3基因PCR-RFLP与生产性能的相关分析
• 3.7.1 山羊FspBI酶切结果分析
• 3.7.2 山羊IGFBP-3基因等位基因（型）在群体中的分布
• 3.7.3 FspBI酶切位点不同基因型对山羊生长性能的影响
• 4 讨论
• 4.1 基因组DNA的提取
• 4.2 PCR反应
• 4.3 山羊MSTN基因的多态性
• 4.4 山羊IGFBP-3基因的多态性
• 4.5 山羊MSTN和IGFBP-3基因对经济性状的影响
• 4.6 MSTN和IGFBP-3基因遗传多样性的产生
• 4.7 MSTN和IGFBP-3基因的应用前景
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 附录攻读硕士学位期间发表的论文