BoLA基因多态性及其与奶牛乳房炎的关联研究

论文题目: BoLA基因多态性及其与奶牛乳房炎的关联研究

论文类型: 博士论文

论文专业: 动物遗传育种与繁殖

作者: 高树新

导师: 李金泉,许尚忠

关键词: 乳房炎,体细胞,体细胞评分

文献来源: 内蒙古农业大学

发表年度: 2005

论文摘要: 乳房炎是造成奶牛业损失最严重的疾病,而主组织相容性复合物(体)是染色体上紧密连锁的、高度多态的一组基因,在动物体的免疫系统中发挥着非常重要的作用,已有研究证明 MHC 与动物的多种疾病的抗性(或易感性)相关。本研究采用PCR-SSCP 方法,揭示了中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛 MHCⅡ类 DRA、DQA、DQB 和 DRB3 四个基因的分子遗传多态性,并进行了其多态性与奶牛乳房炎的关联性研究,分析了影响乳房炎的因素,得到以下结果: 1.发现了 3 个 BoLA-DRA* exon2 等位基因,其中中国荷斯坦牛 3 个、中国西门塔尔牛 3 个、三河牛 3 个;11 个 BoLA-DQA* exon2 等位基因,其中中国荷斯坦牛 7个、中国西门塔尔牛 7 个、三河牛 11 个;13 个 BoLA-DQB* exon2 等位基因,其中中国荷斯坦牛 8 个、中国西门塔尔牛 12 个、三河牛 12 个;10 个 BoLA-DRB3* exon2等位基因,其中中国荷斯坦牛 8 个、中国西门塔尔牛 9 个、三河牛 8 个。 2.DRA* exon2 的 CC 基因型,DQA* exon2 的 B 基因、BB 和 FF 基因型,DQB* exon2 的 D 基因、DD 基因型,DRB3* exon2 的 E 基因、EE 基因型可能与中国西门塔尔牛和三河牛乳房炎易感性有正关联;而 BoLA-DRA*exon2 的 BC 基因型,DQA* exon2 的 A、G 基因、AA 基因型,DQB* exon2 的 A 基因、AA 基因型,DRB3* exon2 的 B 基因、BB 基因型,可能与中国西门塔尔牛和三河牛乳房炎抗性有正关联。本研究在中国荷斯坦牛中,没有发现与乳房炎易感或抗性有关联的基因和基因型。 3.DQA-B/DRB3-C 和 DQA-G/DRB3-F 两条单体型可能与中国荷斯坦牛乳房炎的易感性有正关联,DQB-F/DRB3-E 单体型可能与其乳房炎抗性有正关联;DRA-C/DQA-A 单体型可能与中国西门塔尔牛和三河牛的乳房炎易感性有正关联,DRA-B/DQA-E、DRA-C/DQA-E、DRA-B/DQA-E、DRA-C/DQA-E、DRA-B/DQB-A 、DRA-B/DQB-M、DQA-A/DQB-J、DQA-E/DQB-M、DQA-F/DQB-C、DQA-J/DQB-B、 DQA-K/DQB-D、DQA-A/DRB3-B、DQA-K/DRB3-F、DQB-B/DRB3-H 和 DQB-M/DRB3-B单体型可能与其乳房炎抗性有正关联。 4.中国荷斯坦牛比中国西门塔尔牛和三河牛更容易患乳房炎。随着年龄的增长,奶牛乳房炎的发病率上升;在潮湿多雨的季节里,奶牛更容易得乳房炎;随着泌乳月的递增、胎次的增加,乳房炎发病率呈上升的趋势。 5.在 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DRB3 的四个位点中,BoLA-DRB3 位点的标记基因型对奶牛乳房炎的标记指标 SCSLAW的影响最大。

论文目录:

1 引言

1.1 前言

1.2 MHC 概述

1.2.1 MHC 的发现

1.2.2 MHC 基因的分类及其编码产物

1.2.3 MHC 对抗原的加工和呈递

1.2.4 MHC 的其他生物学功能

1.2.5 MHC 基因的特点

1.2.6 MHC 的表达调节

1.2.7 MHC 的分型方法

1.3 牛MHC 基因的结构及其研究进展

1.3.1 BoLA 的遗传组成

1.3.2 BoLA 基因及其编码产物

1.3.3 BoLA 等位基因及其编码产物的命名

1.3.4 BoLA 与疾病的关系

1.4 奶牛乳房炎研究进展

1.4.1 奶牛乳房炎概述

1.4.2 奶牛乳房炎的发生

1.4.3 奶牛乳房炎的诊断

1.4.4 奶牛乳房炎的遗传学研究

1.4.5 奶牛乳房炎的防治现状与发展方向

1.5 本研究的目的意义

2 试验材料与方法

2.1 试验材料

2.1.1 血样、奶样的采集

2.1.2 数据的收集

2.1.3 主要试剂及来源

2.1.4 菌株和克隆载体

2.1.5 主要试验设备及来源

2.1.6 常用溶液及试剂的配制

2.2 主要试验步骤

2.2.1 基因组 DNA 的提取及检测

2.2.2 PCR 扩增

2.2.3 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83-ex0112 基因的 SSCP 分析

2.2.4 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83-ex0112 基因的克隆测序

2.2.5 统计方法与分析软件

3 结果与分析

3.1 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83* ex0112 基因位点序列的扩增结果

3.1.1 基因组 DNA 的提取与检测结果

3.1.2 PCR 扩增结果

3.1.3 BoLA DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 基因序列的鉴定

3.2 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83* ex0112 的PCR-SSCP 分析

3.2.1 BoLA-DRA~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析

3.2.2 BoLA-DQA~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析

3.2.3 BoLA-DQB~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析

3.2.4 BoLA-DR83~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析

3.3 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 的测序结果与分析

3.3.1 BoLA-DRA~* ex0112 的测序结果及分析

3.3.2 BoLA-DQA~* ex0112 的测序结果及分析

3.3.3 BoLA-DQB~* ex0112 的测序结果及分析

3.3.4 BoLA-DR83~* ex0112 的测序结果及分析

3.4 BoLA 基因多态性与奶牛乳房炎的关联分析

3.4.1 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 的多态分布

3.4.2 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 的Hardy-Weinberg 检验

3.4.3 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83 的单体型与乳房炎的关联分析

3.4.4 利用 GLM 对 SCS 进行方差分析

3.4.5 影响 SCSLAW 性状的各效应的最小二乘均值及差异显著性检验

3.4.6 BoLA 基因不同基因型的 SCSLAW 最小二乘效应值及差异显著性检验

4 讨论

4.1 样品的采集、保存以及 DNA 的提取

4.2 PCR反应体系与反应条件的优化

4.3 PCR-SSCP 技术影响因素分析

4.4 克隆测序分析

4.5 中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛 BoLA 基因的多态性分析

4.6 中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛乳房炎发病情况

4.7 中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛的遗传特征分析

4.8 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83 基因多态性与奶牛乳房炎关联分析

4.8.1 BoLA 四个位点中与奶牛乳房炎有关联的基因、基因型

4.8.2 BoLA 四个位点中与奶牛乳房炎有关联的单体型

4.9 利用 GLM 对奶牛乳房炎的影响因素进行分析

4.9.1 品种对奶牛乳房炎的影响

4.9.2 年龄对奶牛乳房炎的影响

4.9.3 季节对奶牛乳房炎的影响

4.9.4 泌乳月和胎次对奶牛乳房炎的影响

4.9.5 BoLA 基因型对奶牛乳房炎的影响

4.10 BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83 不同基因型与奶牛乳房炎的关系

5 结论

5.1 中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛BoLA 基因的多态性

5.2 与奶牛乳房炎有关联的BoLA-DRA、DQA、DQB 和DR83 基因、基因型

5.3 与奶牛乳房炎有关联的 BoLA-DRA、DQA、DQB 和DR83 基因单体型

5.4 影响奶牛乳房炎的因素

5.5 影响奶牛乳房炎的标记基因型效应

致谢

参考文献

附录

作者简介

发布时间: 2005-07-18

参考文献

[1].奶牛乳房炎性金葡菌毒力基因和耐药性及其与SCVs致病力差异[D]. 张立梅.中国农业大学2018
[2].华北地区奶牛乳房炎无乳链球菌的生物学特性及其亚单位疫苗的研究[D]. 杜琳.内蒙古农业大学2016
[3].治疗奶牛乳房炎蒙药复方的筛选及其抗炎免疫机理的研究[D]. 战永波.内蒙古农业大学2010
[4].应用SSH技术筛选和克隆奶牛乳房炎抗性相关基因[D]. 曹随忠.甘肃农业大学2005
[5].治疗奶牛乳房炎的复方中药制剂的开发研究[D]. 李成应.内蒙古农业大学2008
[6].奶牛乳房炎源性浅绿气球菌的表型、基因型和致病机制研究[D]. 刘钢.中国农业大学2017
[7].甘草总黄酮抗金黄色葡萄球菌作用及其治疗奶牛乳房炎的应用研究[D]. 吴金梅.吉林大学2012
[8].奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌亚单位疫苗的研究[D]. 范鑫.内蒙古农业大学2011
[9].奶牛乳房炎与肠道菌群的关联研究[D]. 马晨.内蒙古农业大学2016
[10].奶牛乳房炎相关血浆蛋白质初步分析[D]. 牛丽莉.中国农业科学院2009

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