中国沿海蛾螺科5属10种的系统学分析

论文摘要

蛾螺科属于软体动物门（Mollusca）,腹足纲（Gastropoda）,在全世界有数百种。目前已报道在我国分布的蛾螺科种类有13个属,约31个种,但其系统学和一些种类的分类地位仍存在较大的争议。本研究利用核糖体小亚基18S rRNA基因、核糖体大亚基28S rRNA基因及线粒体COI基因的部分序列对我国辽宁、山东、福建沿海蛾螺科内5个属10个种的系统发生进行了分析。通过PCR分别获得了大约1800bp、1400bp和700bp的片段,测序之后,通过遗传分析软件对序列进行了比对分析,利用Neighbor-joining （NJ）法、Minimum evolution （ME）法和Maximum parsimony（MP）法建立了系统树。结果显示,所研究的蛾螺科5属10种可以被分为5个亚群:第一大分支为香螺亚群,包括Neptunea属的香螺、新英格兰蛾螺、Neptunea eulimata Dall、和一个未知种以及Siphonalia属的略胀管蛾螺;第二个分支为侧平肩螺亚群;第三个分支为水泡蛾螺和黄海蛾螺亚群;第四个分支为褐管蛾螺亚群;第五个分支为方斑东风螺亚群。由系统学分析可知,香螺是蛾螺科中较为进化的种;未知种为香螺属内的种;略胀管蛾螺与Neptunea属的种类亲缘关系较近,建议将略胀管蛾螺归为Neptunea属。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 前言
• 1.1 腹足纲动物的分类情况
• 1.2 腹足纲系统学研究概况
• 1.2.1 形态学研究
• 1.2.2 细胞学研究
• 1.2.3 分子标记研究
• 1.2.4 分子系统学研究在分类学和进化研究中的局限性与分歧
• 1.3 展望
• 1.4 蛾螺科的概况
• 1.5 本研究进行系统学分析所用的基因特点及应用
• 1.5.1 核糖体基因
• 1.5.2 线粒体基因
• 1.6 本研究的目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 实验材料及仪器试剂
• 2.1.1 材料采集
• 2.1.2 主要试剂
• 2.1.3 主要仪器
• 2.2 方法
• 2.2.1 总 DNA 的提取
• 2.2.2 PCR
• 2.2.3 目的片段的纯化
• 2.2.4 目的片段克隆
• 2.2.5 测序
• 2.2.6 序列分析
• 3 结果
• 3.1 总DNA 的提取结果
• 3.2 PCR
• 3.2.1 18S rRNA 基因PCR 结果
• 3.2.2 28S rRNA 基因PCR 结果
• 3.2.3 COI 基因 PCR 结果
• 3.3 序列分析
• 3.3.1 18S rRNA 测序比对结果
• 3.3.2 28S rRNA 测序比对结果
• 3.3.3 COI 基因测序比对结果
• 3.4 序列分析
• 3.4.1 18S rRNA 基因序列分析结果
• 3.4.2 28S rRNA 基因序列分析结果
• 3.4.3 COI 基因序列分析结果
• 4 讨论
• 4.1 蛾螺科5 属10 种的形态学描述
• 4.2 18S rRNA 基因序列分析
• 4.2.1 18S rRNA 基因的序列分析
• 4.2.2 基于18S rRNA 基因的系统学分析
• 4.3 28S rRNA 基因序列分析
• 4.3.1 28S rRNA 基因的序列分析
• 4.3.2 基于28S rRNA 基因的系统学分析
• 4.4 COI 基因分析
• 4.4.1 COI 基因的序列分析
• 4.4.2 基于COI 基因的系统学分析
• 4.5 对三个基因总的系统学分析
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 个人简历
• 论文发表情况