汪娜娜:用ForenSeqTM DNA签名准备试剂盒进行祖先推断论文

汪娜娜:用ForenSeqTM DNA签名准备试剂盒进行祖先推断论文

本文主要研究内容

作者汪娜娜,李燃,乌日嘎,彭丹,李海霞,沈雪枫,孙宏钰(2019)在《采用ForenSeqTM DNA Signature Prep试剂盒进行祖先推断》一文中研究指出:目的评估ForenSeqTM DNA Signature Prep试剂盒中56个祖先信息单核苷酸多态性(ancestry informative single nucleotide polymorphism,aiSNP)遗传标记进行祖先推断的效果。方法采集我国河北汉族、内蒙古自治区蒙古族、西藏自治区藏族、新疆维吾尔自治区维吾尔族和尼日利亚5个群体共85个样本,采用ForenSeqTM DNA Signature Prep试剂盒构建文库,基于MiSeq FGx法医基因组学系统进行测序,对获得的56个aiSNP分型数据分别采用ForenSeqTM通用分析软件(universal analysis software,UAS)、主成分分析(principle component analysis,PCA)、Structure和似然比方法进行群体间遗传关系分析和祖先来源推断。结果在所检测的5个群体中,我国的4个民族(河北汉族、内蒙古自治区蒙古族、西藏自治区藏族和新疆维吾尔自治区维吾尔族)与尼日利亚群体可明确区分;新疆维吾尔自治区维吾尔族个体显示为混合祖先来源,能与中国其他3个群体进行区分;而中国的其他3个群体(河北汉族、内蒙古自治区蒙古族和西藏自治区藏族)使用该体系不能有效区分。结论 ForenSeqTM DNA Signature Prep试剂盒的56个aiSNP可从洲际水平准确进行族源推断,但尚不能实现中国群体之间的区分。

Abstract

mu de ping gu ForenSeqTM DNA Signature Prepshi ji he zhong 56ge zu xian xin xi chan he gan suan duo tai xing (ancestry informative single nucleotide polymorphism,aiSNP)wei chuan biao ji jin hang zu xian tui duan de xiao guo 。fang fa cai ji wo guo he bei han zu 、nei meng gu zi zhi ou meng gu zu 、xi cang zi zhi ou cang zu 、xin jiang wei wu er zi zhi ou wei wu er zu he ni ri li ya 5ge qun ti gong 85ge yang ben ,cai yong ForenSeqTM DNA Signature Prepshi ji he gou jian wen ku ,ji yu MiSeq FGxfa yi ji yin zu xue ji tong jin hang ce xu ,dui huo de de 56ge aiSNPfen xing shu ju fen bie cai yong ForenSeqTMtong yong fen xi ruan jian (universal analysis software,UAS)、zhu cheng fen fen xi (principle component analysis,PCA)、Structurehe shi ran bi fang fa jin hang qun ti jian wei chuan guan ji fen xi he zu xian lai yuan tui duan 。jie guo zai suo jian ce de 5ge qun ti zhong ,wo guo de 4ge min zu (he bei han zu 、nei meng gu zi zhi ou meng gu zu 、xi cang zi zhi ou cang zu he xin jiang wei wu er zi zhi ou wei wu er zu )yu ni ri li ya qun ti ke ming que ou fen ;xin jiang wei wu er zi zhi ou wei wu er zu ge ti xian shi wei hun ge zu xian lai yuan ,neng yu zhong guo ji ta 3ge qun ti jin hang ou fen ;er zhong guo de ji ta 3ge qun ti (he bei han zu 、nei meng gu zi zhi ou meng gu zu he xi cang zi zhi ou cang zu )shi yong gai ti ji bu neng you xiao ou fen 。jie lun ForenSeqTM DNA Signature Prepshi ji he de 56ge aiSNPke cong zhou ji shui ping zhun que jin hang zu yuan tui duan ,dan shang bu neng shi xian zhong guo qun ti zhi jian de ou fen 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自法医学杂志的汪娜娜,李燃,乌日嘎,彭丹,李海霞,沈雪枫,孙宏钰,发表于刊物法医学杂志2019年05期论文,是一篇关于法医遗传学论文,多态性论文,单核苷酸论文,祖先推断论文,二代测序论文,法医学杂志2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自法医学杂志2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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