史宝:黄条鰤线粒体全基因组测序及结构特征分析论文

史宝:黄条鰤线粒体全基因组测序及结构特征分析论文

本文主要研究内容

作者史宝,柳学周,刘永山,张言祥,高全义,徐永江,王滨,姜燕,宋雪松(2019)在《黄条鰤线粒体全基因组测序及结构特征分析》一文中研究指出:通过二代测序、软件拼接获得中国黄海海域黄条鰤(Seriola aureovittata)线粒体基因组全序列。其序列全长为16609 bp,碱基组成分别为A(26.68%)、G(17.84%)、C(30.12%)和T(25.36%);共有13条蛋白编码基因, 22个tRNA基因, 2个rRNA基因,除NAD6、trnQ、trnA、trnN、trnC、trnY、trnS、trnE、trnP外,其余基因均在H链上编码。黄条鰤线粒体基因组全序列与蛋白编码基因的A+T含量分别为52.05%和51.085%,具有明显的AT偏好性。线粒体基因中存在2个散在重复序列,分别位于NAD1基因序列正义链的中游和COX2基因序列反义链的上游。在其22个tRNA基因中,除了tRNAGly外,均具有典型的三叶草二级结构。黄条鰤线粒体基因组的蛋白编码基因起止位点与密码子除COX1、NAD5外,均与日本海域出产的黄条鰤(Seriola lalandi)完全吻合,且COX1、NAD5基因皆短于日本黄条鰤;两者间存在一定的遗传差异。基于18种隶属于13属的鲹科鱼类线粒体基因组全序列构建系统发生树,可知小甘鲹(Seriolina nigrofasciata)、黄条鰤、五条鰤(Seriola quinqueradiata)、高体鰤(Seriola dumerili)、长鳍鰤(Seriola rivoliana)同属一近支,且黄条鰤与五条鰤亲缘关系最近,与小甘鲹进化距离较远。

Abstract

tong guo er dai ce xu 、ruan jian pin jie huo de zhong guo huang hai hai yu huang tiao shi (Seriola aureovittata)xian li ti ji yin zu quan xu lie 。ji xu lie quan chang wei 16609 bp,jian ji zu cheng fen bie wei A(26.68%)、G(17.84%)、C(30.12%)he T(25.36%);gong you 13tiao dan bai bian ma ji yin , 22ge tRNAji yin , 2ge rRNAji yin ,chu NAD6、trnQ、trnA、trnN、trnC、trnY、trnS、trnE、trnPwai ,ji yu ji yin jun zai Hlian shang bian ma 。huang tiao shi xian li ti ji yin zu quan xu lie yu dan bai bian ma ji yin de A+Than liang fen bie wei 52.05%he 51.085%,ju you ming xian de ATpian hao xing 。xian li ti ji yin zhong cun zai 2ge san zai chong fu xu lie ,fen bie wei yu NAD1ji yin xu lie zheng yi lian de zhong you he COX2ji yin xu lie fan yi lian de shang you 。zai ji 22ge tRNAji yin zhong ,chu le tRNAGlywai ,jun ju you dian xing de san xie cao er ji jie gou 。huang tiao shi xian li ti ji yin zu de dan bai bian ma ji yin qi zhi wei dian yu mi ma zi chu COX1、NAD5wai ,jun yu ri ben hai yu chu chan de huang tiao shi (Seriola lalandi)wan quan wen ge ,ju COX1、NAD5ji yin jie duan yu ri ben huang tiao shi ;liang zhe jian cun zai yi ding de wei chuan cha yi 。ji yu 18chong li shu yu 13shu de can ke yu lei xian li ti ji yin zu quan xu lie gou jian ji tong fa sheng shu ,ke zhi xiao gan can (Seriolina nigrofasciata)、huang tiao shi 、wu tiao shi (Seriola quinqueradiata)、gao ti shi (Seriola dumerili)、chang qi shi (Seriola rivoliana)tong shu yi jin zhi ,ju huang tiao shi yu wu tiao shi qin yuan guan ji zui jin ,yu xiao gan can jin hua ju li jiao yuan 。

论文参考文献

  • [1].黄条鰤室内水泥池养殖试验[J]. 郑春波,连昌,王华东,王同勇,于夕有,张锦涛.  科学种养.2019(07)
  • [2].黄条鰤胚胎发育观察[J]. 钟建兴,蔡良候,郑惠东,李雷斌.  福建水产.2010(02)
  • [3].黄条鰤养殖技术研究现状与展望[J]. 罗耀明,李多慧,高志鹰,王秀艳,姜大为.  河北渔业.2017(10)
  • [4].基于稳定同位素分析的野生黄条鰤食物组成研究[J]. 李多慧,韩羽嘉,李重实.  河北渔业.2018(09)
  • [5].黄条鰤人工繁育技术取得重大突破[J]. 柳学周.  海洋与渔业.2017(08)
  • [6].黄条鰤早期生长发育特征[J]. 徐永江,张正荣,柳学周,王滨,史宝,刘永山,李荣,张言祥.  中国水产科学.2019(01)
  • [7].“黄条鰤亲鱼陆海接力培育技术”通过现场验收[J].   中国水产.2015(12)
  • [8].黄条鰤不同组织碳稳定同位素的转化率与分馏[J]. 韩羽嘉,田甲申,李多慧,王震,鹿志创,木云雷.  水产学杂志.2017(06)
  • [9].黄条鰤PTEN基因克隆、组织分布及早期发育阶段的表达分析[J]. 孙冉冉,史宝,柳学周,常亚青,张言祥,高全义,徐永江,王滨,姜燕,张正荣.  大连海洋大学学报.2019(01)
  • [10].盐度渐变过程对黄条鰤(Seriola aureovittata)幼鱼渗透调节的影响[J]. 史宝,柳学周,刘永山,张言祥,高全义,徐永江,王滨,姜燕,宋雪松.  海岸工程.2019(01)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国水产科学的史宝,柳学周,刘永山,张言祥,高全义,徐永江,王滨,姜燕,宋雪松,发表于刊物中国水产科学2019年03期论文,是一篇关于黄条鰤论文,线粒体基因组论文,序列分析论文,系统进化论文,中国水产科学2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国水产科学2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    史宝:黄条鰤线粒体全基因组测序及结构特征分析论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢