吉康娜:基于茄子基因组重测序的InDel标记开发及应用论文

吉康娜:基于茄子基因组重测序的InDel标记开发及应用论文

本文主要研究内容

作者吉康娜,郅俊杰,林丹妮,颜爽爽,田时炳,曹必好,邱正坤(2019)在《基于茄子基因组重测序的InDel标记开发及应用》一文中研究指出:茄子是我国重要的蔬菜作物,然而相比于其他茄果类蔬菜,分子标记在茄子中的应用较少。本研究基于2份在果实与抗性上存在显著差异的茄子的全基因重测序数据,鉴定出151327个InDel位点,随机选择并设计了180个InDel标记,利用重测序材料及其杂交一代进行有效性鉴定,结果显示:180个InDel标记均可获得PCR扩增产物,其中62个标记具有多态性,多态率为34.7%。基于62个InDel标记聚类分析结果揭示出24份紫红长茄自交系的遗传多样性,其中46个标记表现出多态性,每个标记的Nei′s基因多样性指数在0.0799~0.4991之间,Shannon′s多样性指数分布在0.1732~0.6923之间。基于24个InDel标记聚类分析结果揭示出143份茄子品种的遗传多样性,在遗传相似系数0.65处,143份茄子品种大体可以分为Ⅰ~Ⅶ七大类群。基于2对InDel标记的茄子品种纯度鉴定结果与田间鉴定结果相吻合。

Abstract

jia zi shi wo guo chong yao de shu cai zuo wu ,ran er xiang bi yu ji ta jia guo lei shu cai ,fen zi biao ji zai jia zi zhong de ying yong jiao shao 。ben yan jiu ji yu 2fen zai guo shi yu kang xing shang cun zai xian zhe cha yi de jia zi de quan ji yin chong ce xu shu ju ,jian ding chu 151327ge InDelwei dian ,sui ji shua ze bing she ji le 180ge InDelbiao ji ,li yong chong ce xu cai liao ji ji za jiao yi dai jin hang you xiao xing jian ding ,jie guo xian shi :180ge InDelbiao ji jun ke huo de PCRkuo zeng chan wu ,ji zhong 62ge biao ji ju you duo tai xing ,duo tai lv wei 34.7%。ji yu 62ge InDelbiao ji ju lei fen xi jie guo jie shi chu 24fen zi gong chang jia zi jiao ji de wei chuan duo yang xing ,ji zhong 46ge biao ji biao xian chu duo tai xing ,mei ge biao ji de Nei′sji yin duo yang xing zhi shu zai 0.0799~0.4991zhi jian ,Shannon′sduo yang xing zhi shu fen bu zai 0.1732~0.6923zhi jian 。ji yu 24ge InDelbiao ji ju lei fen xi jie guo jie shi chu 143fen jia zi pin chong de wei chuan duo yang xing ,zai wei chuan xiang shi ji shu 0.65chu ,143fen jia zi pin chong da ti ke yi fen wei Ⅰ~Ⅶqi da lei qun 。ji yu 2dui InDelbiao ji de jia zi pin chong chun du jian ding jie guo yu tian jian jian ding jie guo xiang wen ge 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物遗传资源学报的吉康娜,郅俊杰,林丹妮,颜爽爽,田时炳,曹必好,邱正坤,发表于刊物植物遗传资源学报2019年05期论文,是一篇关于茄子论文,分子标记论文,种质分析论文,品种纯度鉴定论文,植物遗传资源学报2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物遗传资源学报2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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