变性高效液相色谱检测视网膜母细胞瘤Rb1基因外显子

变性高效液相色谱检测视网膜母细胞瘤Rb1基因外显子

论文摘要

目的:以变性高效液相色谱(denaturing high performance liquidchromatography,DHPLC)检测视网膜母细胞瘤(retinoblastoma,RB)的Rh1基因外显子,探讨其突变情况以及DHPLC的检测情况,建立应用DHPLC检测Rb1基因的技术平台。方法:收集25例行眼球摘除的视网膜母细胞瘤患者的肿瘤组织,和3例健康对照者的外周血,进行基因组提取,以多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增Rb1基因的第3,7,9,12和26个外显子片段。以DHPLC技术检测其突变情况,再采用DNA直接测序法进行进一步分析。结果:全部25例患者和3例健康对照者均扩增出5个外显子片段。进行变性高效液相色谱分析,第3,7,9,12,26个外显子的最优化检测注温分别为54.4,55.2,53.4,53.4和55.2℃。行变性高效液相色谱分析结果,第3,7,9,12个外显子中,25例患者和3例健康对照者均呈现同样峰形;而第26个外显子中,有2例患者呈现不同峰形。对所有片段进行测序,第3,7,9,12外显子的扩增片段中未发现突变。而外显子26的扩增片段中,DHPLC峰形和其他片段不同的2个样品也未出现突变。结论:DHPLC能快速检测出视网膜母细胞瘤Rb1外显子片段的突变位点,可以用于视网膜母细胞瘤的基因检测。

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