论文摘要
大多数基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的距离方法中存在个不足之处，就足这些距离在数学意义下并不足严格的距离。本文首先介绍基于完全基因组的四种建树的字符串距离方法，这些距离基于原始的基因组序列得到的字，并小需要进行序列比对的过程。接着提出了两种新的距离，弦距离和分段距离，来替代以前在我们动力学语言方法中的距离。我们用四个基因组数据对这种替换从生物学角度进行评价。我们发现这两种严格的距离度量所产生的亲缘树与用旧的距离所产生的亲缘树相同或相似，并且用16sRNA所产生的树存大多数分支上是一致的。因此，本文所提出的两个严格距离故良了我们的动力学语言构建亲缘树的方法
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标签：亲缘分析论文; 完全基因组论文; 成分向量论文; 与关联有关的距离度量论文;