小麦TaRARF基因克隆及功能研究

小麦TaRARF基因克隆及功能研究

论文摘要

根据已知胁迫应答小麦EST序列,从小麦中克隆获得一个ABA应答基因TaRARF基因,该基因存在两个转录本,TaRARF-V1和TaRARF-V2。在完成该基因的结构特点和表达特性分析的基础上,采用农杆菌介导法分别将Ubipromoter启动子驱动的TaRARF-V1、TaRARF-V2基因导入粳稻品种kitaake,获得经分子鉴定证实的转基因水稻植株,并对转基因植株的抗旱性进行研究,主要研究结果如下:1、小麦TaRARF基因的转录表达存在可变剪切采用PCR扩增,从小麦中克隆获得一个ABA应答基因TaRARF (Real ABA Response Functional gene),该基因全长2490bp,包含8内含子和9外显子。PCR扩增显示,TaRARF含有2个转录本,TaRARF-V1和TaRARF-V2;其中,TaRARF-V1的cDNA全长1072 bp,包含一个长度为870bp,编码289个氨基酸残基的开放阅读框,编码蛋白分子量约为33.16kD,等电点为6.55,属于弱酸性蛋白,该蛋白含有1个跨膜螺旋结构,2个胁迫应答功能域;TaRARF-V2全长1056 bp,编码184个氨基酸,分子量约为20.88 kD,等电点为9.76,属于碱性蛋白,该蛋白含有1个跨膜螺旋结构,1个胁迫应答功能域。2、物种间ItARF基因的可变剪切转录表达存在共性TaRARF的基因组及转录表达可变剪切体TaRARF-V1和TaRARF-V2的序列比对分析显示,两个转录本来源于B族染色体的同一基因,差异在于TaRARF-V2比TaRARF-V1少了16bp;与小麦TaRARF基因类似,水稻和拟南芥的同源基因OsRARF和AtRARF也存在可变剪切体,OsRARF-V1和OsRARF-V2,以及AtRARF-V1和AtRARF-V2,所编码蛋白氨基酸数目分别为289和87,以及276和149。3、小麦TaRARF基因的组织表达及ABA诱导表达具品种特异性组织表达谱分析结果显示,TaRARF基因转录表达具有较强的组织特性,两品种均以叶片中表达量最高,“中国春”的表达量强弱顺序为叶片、茎、籽粒和根,“洛旱2号”表达强弱顺序为叶片、子粒、茎和根,表明TaRARF基因的表达在品种间存在些微差异;苗期不同ABA浓度处理条件下TaRARF转录表达分析结果显示,在“洛旱2号”幼苗阶段TaRARF基因的表达受ABA处理的强烈诱导,02 μmol、0.4 μmol、0.6 μmol、0.8 μmol和1.0μmol的ABA处理条件下TaRARF基因的表达量分别为0μmol处理的1.489、6.035、3.344、3.138和7.499倍,相比之下,品种“中国春”的表达量分别为对照的0.248、0.228、0.201、0.500和0.590倍,呈现抑制作用;半定量分析结果显示,在品种“洛旱2号”幼苗中转录本TaRARF-V1的表达水平高于T aRARF-V2,ABA处理可加急表达量差异,相比之下,品种“中国春”的两转录本TaRARF-V1和TaRARF-V2间的表达量无显著变化。上述结果表明,TaRARF基因对ABA的敏感性在品种间存在显著差异,“洛旱2号”比“中国春”对ABA的敏感性更高。4、超量表达基因载体构建及水稻的遗传转化在构建Ubipromoter启动子驱动的TaRARF-V1和TaRARF-V2基因植物转化载体基础上,采用农杆菌介导法将上述基因导入粳稻品种Kitaake,同时以转空载体为对照,分别获得转TaRARF-V1基因、TaRARF-V2基因和空载体的独立阳性株系31株、45株和15株,特异性PCR鉴定及测序证实外源目的基因已整合进入受体植株基因组。5、过表达aRARF可提高种子萌发期对ABA的敏感性,增强苗期抗旱能力转基因水稻种子萌发期ABA敏感性分析结果显示,超量表达TaRARF-V1、TaRARF-V2能提高转基因水稻苗期生长对的ABA敏感性。苗期抗旱性鉴定结果显示,在供试干旱条件下,转TaRARF-V1植株的存活率介于58.31%~71.43%之间,转TaRARF-V2各株系的存活率介于23.71-28.58%,相比之下转空载体水稻的存活率为0%,过表达TaRARF基因可显著增强转基因水稻的抗旱能力,并以TaRARF-V1的功能更强。MDA含量检测结果显示,干旱处理5d时转TaRARF-V1、转TaRARF-V2和转空载体水稻植株的MDA含量变化量分别为63.6765%,85.432%和305.79%,差异极显著(P≤0.01);此外,相对失水率同样显示,超量表达转基因株系失水速率极显著小于转空载体CK(P≤0.01),表明TaRARF基因的导入可增加转基因植株的持水能力。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • 1. 文献综述
  • 1.1 逆境胁迫的影响与危害
  • 1.2 植物的抗逆性
  • 1.2.1 植物抗逆途径概述
  • 1.2.2 抗性鉴定指标归类
  • 1.2.2.1 形态指标
  • 1.2.2.2 生理与生化指标
  • 1.3 逆境胁迫下植物的信号传导
  • 1.4 ABA信号传导研究进展
  • 1.4.1 ABA受体的发现及功能研究
  • 1.4.2 ABA信号传导途径组件及逆境胁迫应答因子的发现和功能研究
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.1.1 供试材料
  • 2.1.2 试验所用到的菌株、载体
  • 2.1.3 试验所用到的分子生物学试剂
  • 2.2 总DNA的提取及纯化
  • 2.3 总RNA的提取及反转录
  • 2.3.1 小麦、拟南芥、水稻叶片总RNA的提取
  • 2.3.1.1 RNA的质量及纯度检测
  • 2.3.1.2 分光光度计RNA纯度检测
  • 2.3.2 CDNA第一条链的合成
  • 2.4 小麦、拟南芥、粳稻RARF基因的克隆
  • 2.4.1 目的片段的PCR扩增
  • 2.4.2 PCR扩增产物的检测和回收纯化
  • 2.4.3 回收产物与PMD-18T载体的连接与转化
  • 2.5 TARARF基因组织特异性表达分析
  • 2.5.1 TARARF基因组织特异性半定量分析
  • 2.5.2 TARARF基因组织特异性荧光定量分析
  • 2.6 苗期T-RARF基因ABA应答表达分析
  • 2.7 植物遗传转化载体的构建和转化
  • 2.7.1 超量表达载体的构建
  • 2.7.2 遗传转化
  • 2.7.2.1 农杆菌感受态细胞的制备转化
  • 2.7.2.2 水稻基本培养基
  • 2.7.2.3 根癌农杆菌介导水稻转化
  • 2.7.2.3.1 种子消毒和愈伤组织的诱导
  • 2.7.2.3.2 农杆菌介导水稻转化
  • 2.7.2.4 转基因植株的初步鉴定
  • 2.7.2.4.1 转基因水稻DNA的提取
  • 2.7.2.4.2 转基因植株的PCR检测
  • 2.7.2.4.3 外源目的基因TARARF-V1、TARARF-V2的表达分析
  • 2.8 转基因植株的ABA敏感性实验
  • 2.9 转基因植株苗期抗旱性分析
  • 2.10 转基因植株离体条件下失水速率统计
  • 2.11 丙二醛(MDA)含量的测定
  • 2.12 酵母双杂交系统筛选TARARF基因相互作用基因
  • 2.12.1 小麦T-RARF基因的克隆
  • 2.12.1.1 小麦T-RARF基因片段的PCR扩增
  • 2.12.1.2 PCR扩增产物的检测和回收纯化
  • 2.12.1.3 回收产物与PMD18-T载体的连接与转化
  • 2.12.1.4 重组克隆的验证及序列测定
  • 2.12.2 诱饵蛋白载体的构建
  • 2.12.3 酵母菌株的表型鉴定
  • 2.12.4 诱饵载体的自激活检测
  • 2.12.4.1 酵母感受态的制备
  • 2.12.4.2 酵母感受态的转化
  • 2.12.5 诱饵质粒和文库质粒的大规模共转化
  • 2.12.6 分析和确认阳性克隆
  • 2.13 实验所用引物及序列
  • 3. 结果与分析
  • 3.1 小麦TARARF基因克隆及序列分析
  • 3.2 RARF基因转录本存在剪切变异体
  • 3.3 RARF剪切变异体编码蛋白结构分析
  • 3.4 不同小麦品种中T-RARF基因组织特异性表达
  • 3.5 苗期TARARF基因的ABA应答分析
  • 3.6 过表达载体的构建
  • 3.7 转TARARF-V1、TARARF-V2水稻获得
  • 3.7.1 根癌农杆菌介导水稻转化
  • 3.7.2 转基因植株的PCR鉴定
  • 3.8 TARARF-V1、TARARF-V2超量表达转基因植株抗逆性分析
  • 3.8.1 转基因植株ABA敏感性分析
  • 3.8.2 转基因株系苗期抗旱性分析
  • 3.8.3 转基因株系苗期失水速率分析
  • 3.9 T-RARF基因酵母双杂交诱饵表达载体的构建、鉴定
  • 3.9.1 重组质粒PMDL8-TARARF的鉴定
  • 3.9.2 重组诱饵表达质粒PGBKT7-T-RARF的鉴定
  • 3.10 酵母AHL09菌株表型的验证
  • 3.11 组诱饵表达质粒PGBKT7-TARARF的自激活检测
  • 3.12 DNA文库的筛选与相互作用蛋白的确认
  • 3.12.1 CDNA文库的筛选结果
  • 3.12.2 阳性克隆的PCR鉴定
  • 3.12.3 阳性克隆的质粒提取
  • 3.12.4 阳性克隆测序获得插入片段序列及信息学分析结果
  • 4 讨论
  • 4.1 TARARF基因选择性剪接机制探讨
  • 4.2 TARARF基因在水稻抗逆性提高作用机理探讨
  • 4.3 利用酵母双杂交系统进行文库筛选的研究讨论
  • 参考文献
  • ABSTRACT
  • 相关论文文献

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