凡纳滨对虾分子标记筛选、连锁图谱构建和QTL定位

论文摘要

利用AFLP和微卫星标记,以凡纳滨对虾F1全同胞家系为作图群体,构建了凡纳滨对虾的雌性和雄性遗传连锁图谱并对生长相关性状体长和体重进行了QTL分析。利用经过筛选的108对AFLP引物组合,对亲本和94个子代个体进行了分离分析。共得到2041个多态AFLP标记（1:1分离）。平均每个引物组合产生20个多态片段。有826个AFLP标记偏离孟德尔遗传（40.5%, P<0.05）。所筛选的100个微卫星标记中有30个在家系中有作图信息,分别有24个和20个位点可以用于母本和父本的作图。对父母本β-1,3-葡聚糖结合蛋白（BGBP）,脂多糖和葡聚糖结合蛋白（LGBP）和蜕皮抑制激素（MIH）等基因片段进行序列分析得到一些可用于构建连锁图谱的SNP标记。对所有的分离标记进行了连锁分析,分别绘制了凡纳滨对虾的雌性和雄性连锁图谱。雌性连锁图谱的框架图有319个遗传标记组成,分布于45个连锁群,其中AFLP标记300个,微卫星位点18个,性别标记一个,连锁群长度从29.5cM到260.0cM,每个连锁群含4-16个标记。图谱长度为4134.4 cM,各连锁群平均图距在7.6到25.9 cM之间,总平均图距为15.1 cM。有267个标记（含14个微卫星）整合到雄性框架图上。雄性框架图也含45个连锁群,长度从14.2cM到161.1cM,图谱长度为3220.9 cM,各连锁群平均图距在4.1到25.5 cM之间,总平均图距为14.5 cM。作图群体所有个体的性别均作为标记整合到雌雄分离信息中,在94个F1个体中,54个为雌虾,40个是雄虾。在雌性图谱第29连

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 引言
• 第一章 文献综述
• 第一节连锁图谱构建的原理及意义
• 1.1.1 连锁图谱构建的理论基础
• 1.1.2 拟测交策略作图
• 1.1.3 连锁图谱的功能和应用
• 第二节用于构建连锁图谱的分子标记
• 1.2.1 AFLP 标记
• 1.2.2 微卫星标记
• 1.2.3 SNP 标记
• 第三节 连锁图谱在水生动物中的构建、应用及前景展望
• 1.3.1 水生动物连锁图谱的研究进展
• 1.3.2 水生动物QTL 研究进展及前景展望
• 第二章 AFLP,微卫星和SNP 分离标记的筛选
• 前言
• 第一节 AFLP 分析
• 2.1.1 材料与方法
• 2.1.2 结果与分析
• 第二节 微卫星分析
• 2.2.1 材料和方法
• 2.2.2 结果
• 2.2.3 讨论
• 第三节 SNP 筛选
• 2.3.1 材料与方法
• 2.3.2 结果和分析
• 第三章 遗传连锁图谱的构建
• 3.1 材料和方法
• 3.1.1 作图群体
• 3.1.2 AFLP 和微卫星分析（见第二章）
• 3.1.3 连锁图谱构建
• 3.1.4 基因组长度预测和图谱覆盖率
• 3.2 结果和讨论
• 3.2.1 连锁图谱
• 3.2.2 基因组长度，覆盖率和雌雄图谱差异
• 3.2.3 标记分布
• 3.2.4 偏分离标记
• 3.2.5 性别相关标记
• 3.2.6 应用前景
• 第四章 生长相关性状的QTL 分析
• 4.1 材料与方法
• 4.1.1 实验材料及表型数据测量
• 4.1.2 体长和体重的QTL 定位
• 4.2 结果
• 4.2.1 性状分布及相关
• 4.2.2 QTL 定位
• 4.3 讨论
• 4.3.1 QTL 定位策略和分析方法
• 4.3.2 基因效应及性状相关
• 4.3.3 QTL 稳定性评价和标记辅助选择育种
• 第五章 总结
• 参考文献
• 已完成的论文及发表文章
• 致谢