广西壮族自治区原发性肝细胞癌的微阵列比较基因组杂交研究

论文摘要

目的 了解广西壮族自治区原发性肝细胞癌染色体结构改变的特点,结合生物数据库信息分析,进一步分析它的癌变机理,寻找和定位于原发性肝细胞癌的癌相关基因。方法应用微阵列比较基因组杂交技术分析31例原发性肝细胞癌标本的染色体DNA拷贝数变化；结合生物信息学数据库的信息,对本研究结果中发生高频扩增及缺失的基因进行初步的筛查,找出在与原发性肝细胞癌发生、发展有关的信号传导通路上起关键作用的基因。结果通过应用微阵列比较基因组杂交技术对31例原发性肝细胞癌进行分析后发现,大部分病例的DNA拷贝数都有不同程度的变化。同时发现存在着若干非随机的DNA拷贝数扩增或丢失的区段：发生高频率扩增（大于40%）的染色体区段有1q21.1-q32.1,8q22.2-q24.23;及发生高频缺失比例（大于40%）的染色体区段有1p34.2-p36.2,4q13.1-q35.2,8p11.22-p23.2, 16q12.1-q24.3,17pl2-17pl3.3,19p13.12-p13.3;另外通过和不同机构对HCC的CGH研究结果进行比较,并从Array CGH结果中筛查出DNA拷贝数扩及缺失变化较大（≥30%）基因,有TP53, CDH, MAP2K2, RB1, PIK3R5, EGF, NFKB1, TRADD, TNFRSF等；结合本实验DNA拷贝数变化结果和生物数据库的信息,从中归纳出细胞凋亡通路、Ras介导的细胞增殖通路等19条信号通路。结论通过应用微阵列比较基因组杂交技术对我区31例原发性肝细胞癌进行分析,结合生物信息学技术,筛选出我区HCCDNA拷贝数扩增及缺失较明显的染色体区段及基因,并初步阐明这些基因在与HCC发生发展过程有关的信号通路上的功能,为我区原发性肝细胞癌癌前预防、早期诊断指标的筛查提洪理论依据。

论文目录

• 主要缩略语及中英对照
• 摘要
• ABSTRACT
• 前言
• 材料方法学
• 1.1 标本来源
• 1.2 主要试剂
• 1.3 主要仪器设备
• 1.4 实验步骤
• 实验结果
• 讨论
• 小结
• 全文结论
• 展望及后续工作
• 参考文献
• 附录
• 综述
• 参考文献
• 致谢