水稻黄绿叶基因YGL4的遗传分析和分子定位

水稻黄绿叶基因YGL4的遗传分析和分子定位

论文摘要

水稻叶色突变体不仅是研究高等植物的光合作用,叶绿素的生物合成,叶绿体的遗传分化及发育等的重要材料,而且可作为标记性状在水稻杂种优势利用中应用。因此,水稻叶色突变基因的发掘、研究和利用越来越受到人们的关注。本试验通过EMS诱变恢复系缙恢10号,获得了一个稳定遗传的全生育期黄绿化叶色突变体。随后,对其的农艺性状进行调查,并在苗期、分蘖期、抽穗期三个不同时期对叶绿素含量进行测量,最后还对突变体ygl4进行了精细定位。试验结果表明:1.ygl4突变体的有效穗和株高与对照相比显著下降,分别下降了30.0%和8.9%发但其他农艺性状与对照相比均没有显著变化。2.ygl4的叶绿素含量比对照下降38.2%~50.5%,其中叶绿素a和叶绿素b的含量均有较大幅度的下降,说明ygl4黄绿叶性状是由总叶绿素含量的大幅度下降引起的。同时,叶绿素a与叶绿素b的比值由野生型的2.14~2.25变化为突变体的7.91~13.82,表明叶绿素b的下降幅度大于叶绿素a。从突变表型和叶绿素含量之间的关系来看,叶绿素含量越低,叶色越浅,二者存在明显的相关性,这与目前报道的大多数叶色突变性状类似。3.杂交组合西农1A×ygl4的F1代植株叶片均表现为绿叶,表明该突变体受隐性基因控制。F2代单株间叶色出现分离,在4305株总群体中,正常株3245株、黄绿叶1060株,经x2测验,绿叶株与黄绿叶株株数符合3:1的分离比例(x0.052=3.84),表明该基因受1对隐性核基因控制,命名为YGL4。利用微卫星标记将YGL4定位于第10染色体微卫星标记RM3123和RM590之间,分别距RM3123和RM590 7.6 cM和7.8 cM。在两标记间进一步设计SSR引物,将该黄绿叶基因定位于RM1162和RM7093之间,分别距其1.8 cM和4.0 cM。4.根据日本晴序列可知物理距离为402kb,利用gramene网站(http://www.gramene.org)对该区域序列进行分析,其间存在3个与叶绿素缺失相关的基因:其中2个编码叶绿素酸酯氧化酶(CAO),这是一个催化叶绿素b生物合成的关键酶,这个酶的缺失或活性降低将影响叶绿素b的合成;另外1个基因是CHL-CPN10,这是一个存在于叶绿体中的伴侣蛋白,与叶绿体发育有关。扩增了CAO1和CAO2的全长DNA,转化大肠杆菌测序发现CAO1基因的第7外显子发生了C到T的单碱基突变,碱基序列由ACTTCTTCTG突变为ATTTCTTCTG,使翻译的蛋白质由亮氨酸突变为苯丙氨酸,增加的苯环可能对叶绿素b的生物合成中物质的侧链产生阻碍作用,从而导致了叶绿素生物合成的紊乱,而CAO2的测序无变化。因此我们将CAO1基因确定为ygl4的候选基因。但最终要确定CAO1是否就是YGL4,还有待于进一步的精细定位及对相关候选基因的互补验证结果,相关研究正在进行中。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第1章 文献综述
  • 1.1 水稻叶色突变体的产生方法
  • 1.1.1 天然自发突变
  • 1.1.2 物理和化学诱变
  • 1.1.3 插入突变
  • 1.2 水稻叶色突变体的种类
  • 1.3 叶色突变体表型与叶绿素含量的关系
  • 1.3.1 叶绿素的生物合成
  • 1.3.2 叶色突变体表型与叶绿素含量的关系
  • 1.4 分子标记技术及其在水稻研究上的应用
  • 1.4.1 分子标记的特点
  • 1.4.2 常见的分子标记的种类
  • 1.5 水稻叶色突变体的遗传分析及基因定位
  • 1.5.1 水稻叶色突变体的遗传分析
  • 1.5.2 水稻叶色突变体的基因定位
  • 1.6 水稻叶色基因定位的研究现状
  • 1.7 水稻叶色突变体的基因克隆
  • 1.8 水稻叶色突变体的应用价值
  • 1.8.1 水稻叶色突变体作为标记性状在杂交育种中的应用
  • 1.8.2 水稻叶色突变体在高光效育种中的应用
  • 1.8.3 水稻叶色突变体在作物改良品质性状和质量性状方面的应用
  • 第2章 引言
  • 第3章 材料与方法
  • 3.1 供试材料
  • 3.2 叶绿素含量的测定
  • 3.3 农艺性状的考查与分析
  • 3.4 叶绿体透射电镜的观察
  • 3.5 遗传分析
  • 3.6 DNA提取
  • 3.6.1 基因池叶片的提取
  • 3.6.2 群体单株叶片总 DNA的提取
  • 3.7 SSR分析
  • 3.8 遗传图谱的构建
  • 3.9 目的片段的克隆与测序
  • 3.9.1 凝胶电泳
  • 3.9.2 目的片段的回收
  • 3.9.3 大肠杆菌感受态细胞的制备
  • 3.9.4 目的片段与pMD18-T载体的连接
  • 3.9.5 质粒DNA转化大肠杆菌
  • 3.9.6 转化子的蓝白菌落筛选及菌液PCR扩增鉴定
  • 3.9.7 测序与生物信息学分析
  • 第4章 结果与分析
  • 4.1 ygl4的表型和主要农艺性状
  • 4.2 ygl4的叶绿素含量
  • 4.3 ygl4突变体叶绿素超微结构的分析
  • 4.4 ygl4的遗传分析
  • 4.5 ygl4的分子图谱定位
  • 4.6 ygl4突变体的基因克隆
  • 第5章 讨论
  • 5.1 水稻叶色突变性状的遗传
  • 5.2 水稻黄绿化突变性状的生理生化基础
  • 5.3 水稻黄绿叶突变体的基因定位及基因克隆
  • 第6章 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 在校期间所发表的文章
  • 相关论文文献

    • [1].水稻黄绿叶基因YGL4的遗传分析和分子定位[J]. 作物学报 2009(08)
    • [2].水稻黄绿叶突变体ygl4(t)的鉴定与基因定位[J]. 西南大学学报(自然科学版) 2015(10)

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