论文摘要
β-葡聚糖酶是重要的工业用酶,可有效消除谷物β-葡聚糖在酿造和饲料工业中产生的负面影响。与国外相比,我国对β-葡聚糖酶的研究起步较晚,且研制的β-葡聚糖酶的热稳定性普遍较差,不能满足现代啤酒糖化工艺和颗粒饲料造粒的温度要求,因此提高β-葡聚糖酶的热稳定性具有非常重要的意义。本课题以大肠杆菌表达系统克隆和重组表达了β-葡聚糖酶基因;建立了高通量筛选耐热β-葡聚糖酶的方法;以克隆的β-葡聚糖酶基因为起始材料,通过设计的定向进化策略和建立的筛选手段提高野生型β-葡聚糖酶的热稳定性;检验所构建的热稳定性重组菌株的遗传稳定性;对热稳定性突变株EGs2的发酵条件进行优化;筛选并优化出提高β-葡聚糖酶热稳定性的复合保护剂;估算了热稳定性β-葡聚糖酶的储藏寿命。主要研究结果如下: 从Bacillus subtilis ZJF-1A5中克隆了大小为849bp的β-葡聚糖酶基因。通过序列比对,该基因编码的氨基酸序列与Borriss R、Sun,J和Hidetoshi发表的β-葡聚糖酶的氨基酸序列分别有1—3氨基酸的替换。β-葡聚糖酶基因经BamHⅠ和HindⅢ双酶切后与用同样限制性内切酶切割的载体pET28a(+)进行重组表达,得到了27KD的有活性的β-葡聚糖酶。对酶在宿主细胞中的位置进行测定,结果显示:β-葡聚糖酶不仅分泌至细胞外,而且也存在于细胞内和周质空间。发酵上清液经硫酸氨盐析沉淀和DEAE Cellulose 52离子交换柱层析,纯化的β-葡聚糖酶经SDS-PAGE电泳鉴定,纯化产品为单一条带,分子量约27KD。纯化的β-葡聚糖酶的热学性质研究表明:β-葡聚糖酶的Tm值为62.5℃,最适反应温度为55℃。 本研究将定位膜转印和肉眼可见的平板筛选策略相结合,通过对影响菌落生长、酶的表达和转印成功率的各因素的优化,建立了高通量筛选耐高温β-葡聚糖酶的方法。结果显示:每个LB平板(直径90mm)用4μl 200mg/ml IPTG;IPTG要预先涂在LB平板上;菌落密度约为100个/平板;菌落培养时间为37℃,15小时;完全钝化野生型酶的条件为100℃ 2小时。对该方法的稳定性考察结果显示:该方法的重现性为100%,假阳性率为0.16%,假阴性率为12.22%。与其它高通量筛选方法相比,以滤膜为基础的高通量筛选方法存在许多优点,如透明圈清晰,假阳性率较低,筛选通量高,操作简便,费用低等。该方法作为一种固相酶筛选方法,在鉴别热稳定性和低温下催化活性同时得到提高的变异体时非常有效。 为了提高β-葡聚糖酶的热稳定性,利用体外定向进化技术对编码β-葡聚糖酶的基因进行改造。设计的定向进化策略包括一轮的随机突变和一轮的DNA改组。应用建立的高通量筛选方法筛选热稳定性突变体,最终获得EGs1和EGs2两株热稳定性突变体。通过对野生酶和突变酶的DNA序列和酶学性质分析发现:EGs1和EGs2分别有四个和五个氨基酸替换;这些氨基酸替换使EGs1和EGs2突变酶的Tm值分别比野生酶的Tm值(62.5℃)提高了3℃和5℃,达到了65.5℃和67.5℃;突变酶的最适反应温度也提高了5℃;两个突变酶对地衣多糖的水解能力分别被提高28%和降低21.6%;对地衣多糖的亲和力与野生型的一致,未见改变;在酶的最适pH值上,野生酶和EGs1突变酶为6.5,而EGs2突变酶为7.0;在酶的pH值稳定性方面,野生型和突变型β-葡聚糖酶都有较宽的pH稳定范围,在pH 6.0-8.5的范围内放置48h,β-葡聚糖酶仍保持80%以上的酶活力。这一结果说明了定向进化在提高酶的热稳定性方面是比较有效的。
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目录摘要ABSTRACT第一章 文献综述1 β-葡聚糖酶的研究概况1.1 β-葡聚糖酶的分布1.2 β-葡聚糖酶的酶学性质1.3 β-葡聚糖酶的结构与功能研究1.3.1 β-葡聚糖酶的三级结构和折叠1.3.2 β-葡聚糖酶催化水解机理和催化氨基酸残基1.4 β-葡聚糖酶的分子生物学研究1.5 β-葡聚糖酶的蛋白质工程1.5.1 杂合酶和热稳定性1.5.2 循环重排2 体外分子定向进化研究进展2.1 体外分子定向进化的基本思路和策略2.2 体外分子定向进化技术的演变和发展2.2.1 以寡核苷酸为基础的最大随机化过程2.2.2 整个基因的随机突变2.2.3 依赖于序列同源的重组2.2.4 不依赖于序列同源的重组2.2.5 用计算机数值模拟进行定向进化2.3 蛋白质进化方法的优、缺点2.4 突变体文库筛选技术2.5 体外分子定向进化的应用和发展前景3 嗜热酶的研究进展3.1 嗜热酶的生物化学和分子生物学特性3.2 嗜热酶基因的克隆与表达3.3 蛋白质的热稳定性机制3.3.1 氨基酸组成及其内在倾向性对蛋白质热稳定性的影响3.3.2 蛋白质分子内作用力对蛋白质热稳定性的影响3.3.3 蛋白质构型对蛋白质热稳定性的影响3.4 提高蛋白质稳定性的策略3.4.1 蛋白质工程策略3.4.2 计算机数值模拟方法3.4.3 化学修饰法3.4.4 保护剂的添加4 选题背景及研究内容第二章 枯草芽孢杆菌ZJF-1A5 B-葡聚糖酶基因的克隆与表达0 前言1 材料与方法1.1 菌株、质粒和酶1.2 培养基1.3 主要仪器和设备1.4 实验方法1.4.1 引物的设计和合成1.4.2 基因组提取1.4.3 β-葡聚糖酶基因的扩增1.4.4 PCR产物的纯化和回收1.4.5 PCR产物的克隆1.4.6 感受态细胞的制备和转化1.4.7 质粒提取1.4.8 琼脂糖凝胶电泳1.4.9 平衡酚的制备1.4.10 双酶切大片断的低熔点胶回收1.4.11 重组质粒pUCmT-bgls的筛选和鉴定1.4.12 重组质粒pET28 a(+)-bgls的构建1.4.13 表达载体pET28(+)-bgls的筛选和鉴定1.4.14 表达产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测1.4.15 β葡聚糖酶基因的诱导表达1.4.16 胞外、胞内和周质空间的β葡聚糖酶的提取1.4.17 β-葡聚糖酶的酶活测定1.4.18 β-葡聚糖酶的纯化1.4.19 蛋白质含量测定1.4.20 β-葡聚糖酶的最适反应温度1.4.21 β-葡聚糖酶的热稳定性2 结果与分析2.1 β-葡聚糖酶基因的扩增2.2 β-葡聚糖酶基因的克隆与鉴定2.2.1 阳性重组质粒pUCmT-bgls的PCR鉴定2.2.2 阳性重组质粒pUCmT-bgls的双酶切鉴定2.2.3 β-葡聚糖酶基因的序列测定2.3 重组表达载体的构建2.3.1 表达载体和宿主的选择2.3.2 重组表达载体pET28a(+)-bgls的构建思路2.3.3 重组表达载体pET28a(+)-bgls的PCR鉴定2.3.4 重组表达载体pET28a(+)-bgls的双酶切鉴定2.3.5 重组表达载体pET28a(+)-bgls中目的序列的测定2.4 重组表达载体pET28a(+)-bgls的诱导表达2.5 胞外、胞内和周质空间的β-葡聚糖酶分布2.6 β-葡聚糖酶的纯化2.7 β-葡聚糖酶的热学性质3 讨论4 小结第三章 高通量筛选耐高温β-葡聚糖酶方法0 前言1 材料和方法1.1 菌株、试剂1.2 培养基和鉴定平板1.3 主要仪器和设备1.4 实验方法1.4.1 IPTG用量和加入方式对平板上的菌落生长和β-葡聚糖酶表达的影响1.4.2 平板上的菌落密度对筛选的影响1.4.3 细菌培养时间对筛选的影响1.4.4 定位膜转印1.4.5 筛选平板的制作和显色反应1.4.6 β-葡聚糖酶酶活测定2 结果2.1 IPTG用量对平板上菌落生长和β-葡聚糖酶表达的影响2.2 细菌培养时间对筛选的影响2.3 菌落密度对筛选的影响2.4 膜片处理温度对筛选的影响2.5 耐高温β-葡聚糖酶菌株筛选方法的建立2.6 以滤膜为基础的高通量筛选方法的稳定性考察2.7 以滤膜为基础的高通量筛选方法与其它平板筛选方法的比较3 讨论4 结论第四章 热稳定性β-葡聚糖酶的定向进化0 前言1 材料与方法1.1 实验材料1.2 培养基1.3 主要仪器和设备1.4 实验方法1.4.1 大肠杆菌质粒的提取1.4.2 易错PCR扩增β-葡聚糖酶基因1.4.3 随机突变酶的突变1.4.4 DNA改组(DNA shuffling)1.4.5 DEAE-纤维素膜电泳回收DNA小片段1.4.6 回收双酶切的质粒载体1.4.7 突变库的构建1.4.8 含突变基因的表达文库的构建1.4.9 突变文库的筛选1.4.10 β-葡聚糖酶的纯化1.4.11 β-葡聚糖酶活力测定1.4.12 蛋白质的SDS-PAGE电泳1.4.13 蛋白质浓度测定1.4.14 DNA测序和序列比对1.4.15 野生型酶和突变酶的催化动力学研究1.4.16 野生型酶和突变酶的热稳定性1.4.17 野生型酶和突变酶的最适反应温度1.4.18 野生型酶和突变酶的最适pH值1.4.19 野生型酶和突变酶的pH值稳定性1.4.20 碱基和氨基酸序列比较分析2 结果和分析2.1 β-葡聚糖酶体外定向进化实验设计2.2 β-葡聚糖酶基因的易错PCR2.2.1 易错PCR条件的确定2.2.2 突变文库中突变子产生透明圈的情况2.2.3 随机突变文库的构建和筛选2.2.4 热稳定性突变体的测序2.3 第一代突变体基因的DNA改组2.3.1 DNA改组的设计思路2.3.2 DNA改组文库的构建2.3.3 热稳定性酶的耐热机制分析2.4 突变酶和野生酶的纯化鉴定2.5 野生酶和突变酶的酶学性质2.5.1 野生酶和突变酶的催化动力学2.5.2 野生酶和突变酶的热稳定性和最适反应温度2.5.3 野生酶和突变酶的最适pH值和pH值稳定性3 讨论4 结论第五章 突变株EGS1和EGS2的遗传稳定性0 前言1 材料与方法1.1 菌株、质粒、酶及试剂1.2 培养基1.3 主要仪器和设备1..4 实验方法1.4.1 菌种传代方法1.4.2 质粒对宿主的传代稳定性1.4.3 β-葡聚糖酶活性测定2 结果与分析2.1 质粒稳定性测定2.1.1 EGs1突变株的质粒稳定性测定2.1.2 EGs2突变株的质粒稳定性测定2.2 突变株各代细胞表达目的产物的稳定性2.2.1 EGs1突变株的表达稳定性2.2.2 EGs2突变株的表达稳定性3 讨论4 结论第六章 热稳定性突变体EGS2的发酵工艺研究0 前言1 材料与方法1.1 试剂、材料1.2 主要仪器和设备1.3 实验方法1.3.1 菌种活化1.3.2 装液量、接种量和初始pH值的优化1.3.3 IPTG对目的产物表达的影响1.3.4 乳糖对目的产物表达的影响1.3.5 诱导温度对目的产物表达的影响1.3.6 菌株EGs2的生物量测定2 结果与分析2.1 最佳装液量、接种量和初始pH的确定2.2 目的产物表达和菌体生长的条件优化2.2.1 IPTG和乳糖浓度对菌体生长和目的产物表达的影响2.2.2 诱导时间对菌体生长和目的产物表达的影响2.2.3 诱导温度对菌体生长和目的产物表达的影响3 讨论4 结论第七章 保护剂对β-葡聚糖酶稳定性影响的研究0 前言1 实验材料、仪器和方法1.1 实验材料1.2 主要仪器和设备1.3 实验方法1.3.1 β-葡聚糖酶活力测定1.3.2 保护剂的筛选1.3.3 β-葡聚糖酶的热稳定性实验1.3.4 β-葡聚糖酶的加速实验2 结果与分析2.1 不同物质对β-葡聚糖酶热稳定性的影响2.2 保护剂浓度对β-葡聚糖酶热稳定性的影响2.3 复合保护剂配方的优化2.4 复合保护剂对β-葡聚糖酶热稳定性的影响2.5 复合保护剂对β-葡聚糖酶储存稳定性的影响3 讨论4 结论第八章 β-葡聚糖酶的储存寿命估算0 前言1 材料和方法1.1 实验材料1.2 主要仪器和设备1.3 实验方法1.3.1 β-葡聚糖酶活力测定1.3.2 蛋白质含量测定1.3.3 β-葡聚糖酶的加速实验1.3.4 实验数据的处理2 结果与分析2.1 β-葡聚糖酶加速稳定性实验测定结果2.2 β-葡聚糖酶在28℃、36.2℃和45℃下的热降解速度2.3 β-葡聚糖酶在不同温度下的热降解速度2.4 β-葡聚糖酶储存寿命的估算3 讨论4 结论第九章 结论与后续研究展望1 结论2 后续研究展望参考文献致谢附:个人简历及攻读博士学位期间发表的论文
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