优质早籼稻“佳辐占”外观品质性状的遗传学研究及QTL分析

优质早籼稻“佳辐占”外观品质性状的遗传学研究及QTL分析

论文题目: 优质早籼稻“佳辐占”外观品质性状的遗传学研究及QTL分析

论文类型: 硕士论文

论文专业: 水生生物学

作者: 张凯

导师: 周克夫,黄育民

关键词: 水稻,外观品质性状,数量性状基因座位

文献来源: 厦门大学

发表年度: 2005

论文摘要: 稻米的外观品质性状主要包括粒长、粒宽、长宽比、垩白率、垩白度、整精米率和透明度等。这些性状很大程度上决定了稻米产品的商品品质和市场价值。因此揭示稻米外观品质性状的基因遗传行为将有助于选育优质水稻品种。本研究的主要目的就是利用SSR(simple sequence repeat)分子标记技术对稻米外观品质性状进行数量性状基因座位(quantitive traits locus,QTL)定位,以期获得相关性状的遗传座位,并进一步指导分子标记辅助育种的应用研究。本研究以历史上主栽品种广陆矮4号为母本,高产优质早籼稻新品种佳辐占为父本,构建了一个包含435个株系的重组自交系(RIL)。调查RIL每株系的粒长、粒宽、长宽比、垩白率以及粒重性状。分析表明粒宽和粒重性状存在超亲现象;垩白率的平均值为62.9%,明显偏向广陆矮4号;所有性状均表现为连续分布,属于数量性状遗传。相关性分析发现粒长、粒宽与长宽比之间存在极显著相关性,相关系数分别为0.7970**和-0.8033**;垩白率同粒宽之间相关系数为0.5445**,达极显著水平;粒重与粒长、粒宽、垩白率之间相关系数分别为0.5620**、0.5071**和0.5680**,均表现为极显著水平。分析结果表明佳辐占具有长粒型和低垩白率表现,表现为大粒优质的和谐统一。利用559对SSR引物对双亲及群体进行遗传差异分析和连锁图谱构建。所得遗传图谱包含127对引物,覆盖1015.7cM,平均引物间距8cM。利用该图谱进行QTL分析,共获得8个粒长QTL、6个粒宽QTL、8个长宽比QTL、5个垩白率QTL和8个粒重QTL,每个性状总遗传贡献率分别为74.69%、69.27%、73.56%、47.68%和58.39%。3号染色体上的RM411标记附近存在粒长、长宽比和粒重的QTL,贡献率分别为31.72%、18.25%和9.78%,佳辐占的基因型能够有效增加粒长和长宽比;5号染色体上RM289-RM598区间同时检测到粒宽、长宽比、垩白率和粒重的QTL,贡献率分别为16.13%、6.19%、27.35%和13.20%,佳辐占的基因型能有效增加粒长和长宽比,降低垩白率。上述两个区间同时检测到多个性状,且具有较大遗传贡献率,对于分子标记辅助育种具有很高的应用价值,同时对于基因的精细定位甚至图位克隆也具有积极的指导作用。

论文目录:

摘要

ABSTRACT

1. 前言

2. 稻米外观品质性状的研究现状与展望

2.1 稻米外观品质性状及其评价标准

2.2 稻米外观品质性状的经典遗传学研究

2.2.1 稻米外观品质性状的遗传模式

2.2.2 稻米外观品质性状的相关性

2.3 稻米外观的分子遗传学分析

2.4 稻米外观品质性状 QTL 分析的研究现状与展望

2.4.1 SSR 标记在水稻性状QTL 分析中的广泛应用

2.4.2 稻米外观品质性状QTL 的研究现状

2.4.3 稻米外观品质性状QTL 分析的应用与展望

3. 本研究目标

4. 材料与方法

4.1 材料

4.2 方法

5. 结果与分析

5.1 稻米外观品质性状的遗传学特性

5.1.1 稻米外观品质性状在群体中的表现

5.1.2 外观品质性状相关性

5.2 亲本遗传差异分析

5.3 遗传图谱构建

5.3.1 多态性引物在基因组中的分布

5.3.2 遗传图谱构建

5.4 QTL 定位

6. 讨论

6.1 亲本选择的要素

6.2 遗传图谱的构建

6.3 外观品质性状QTL 的对比分析

6.4 目标区域精细定位

6.5 大粒高产与优质的关系

附录:实验药品与实验方法

硕士期间发表的学术论文

参考文献

致 谢

发布时间: 2007-03-19

参考文献

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