北京鸭A-FABP、PRLR基因多态性及其与生产性状的关联分析

论文摘要

本研究采用PCR-SSCP和DNA测序技术,检测了北京鸭和樱桃谷鸭4个群体共400个个体与脂肪性状相关基因（A-FABP基因）、北京鸭2个群体共238个个体与繁殖性状相关基因（PRLR基因）的遗传变异,分析了其遗传结构和遗传多样性,并对北京鸭和樱桃谷鸭4个群体在上述基因位点的多态性与其相关生产性状进行了关联分析,以期发现对重要经济性状具有显著效应的遗传标记,为中国地方鸭的高效选育和分子标记数据库的建立、种质资源保存与利用提供遗传学依据。本研究取得了以下结果:1肉鸭A-FABP基因多态性及其与屠体性状的关联分析（1）进行A-FABP基因SNPs分析发现,所检测的A1位点未发现多态,A2位点发现6个SNPs（EU306610和EU306611:g. 106A>T、108T>C、123T>C、164C>T、215C>A和231T>C）,均位于内含子2上。（2）群体遗传学分析结果表明,群体基因型频率和基因频率有差异。四个群体A等位基因频率均高于B等位基因频率,并且在Z4和Z2中达到显著水平。（3）适合性χ2检验结果表明,北京鸭Z4、Z4×Z2杂交和樱桃谷鸭群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）,而北京鸭Z2群体处于Hardy-Weinberg非平衡状态（P<0.05）,四个群体平均杂合度为0.42,平均多态信息含量为0.33,均为中度多态（0.25<PIC<0.5）。（4）最小二乘法分析SNPs与屠体性状的关联性结果表明,群体屠体性状差异极显著,Z4系屠体重、全净膛重、肌内脂肪含量显著高于其它品系,而樱桃谷鸭胸肌率、腿肌率显著高于其它品系,皮脂率、腹脂率显著低于其它群体。各群体内不同基因型与屠体性状的关系均未达到显著水平。2北京鸭PRLR基因多态性及其与产蛋性状的关联分析（1）研究北京鸭的PRLR基因的遗传多态性,经PCR-SSCP检测,在第9内含子区域未发现多态,第10外显子发现8个单核苷酸突变位点。表明在北京鸭2个品系中,该座位有7种基因型。（2）最小二乘法分析突变与产蛋性状的关联性表明,北京鸭Z2系突变型F型个体产蛋量（率）高于B型;而北京鸭W2系不同基因型各项指标差异均不显著。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 前言
• 第一章 文献综述
• 1.1 北京鸭和樱桃谷鸭介绍
• 1.1.1 北京鸭
• 1.1.2 樱桃谷鸭
• 1.2 SNP 技术的发展与PCR-SSCP 方法
• 1.2.1 SNP 技术在基因组研究中的地位和意义
• 1.2.2 SNPs 检测技术的发展现状
• 1.2.3 SNPs 研究中存在的问题
• 1.2.4 PCR-SSCP 方法的原理
• 1.2.5 影响SSCP 检测效率的因素
• 1.2.6 PCR-SSCP 技术在动物遗传变异研究中的应用前景
• 1.3 候选基因的选择
• 1.4 脂肪酸结合蛋白研究概况
• 1.4.1 脂肪酸结合蛋白的特征及分类
• 1.4.2 脂肪酸结合蛋白的结构
• 1.4.3 脂肪酸结合蛋白的结合机制及功能
• 1.4.4 脂肪酸结合蛋白与脂肪酸的关系
• 1.4.5 脂肪酸结合蛋白家族的研究进展
• 1.4.6 脂肪型脂肪酸结合蛋白基因（A-FABP 基因）
• 1.5 催乳素和催乳素受体研究概况
• 1.5.1 催乳素和催乳素受体一般结构和特征
• 1.5.2 催乳素受体的剪接多样性和组织特异性表达
• 1.5.3 催乳素受体的定位
• 1.5.4 催乳素受体介导的信号传导途径
• 1.5.5 催乳素受体的多态性研究
• 1.6 研究的目的和意义
• 第二章 屠体性能指标与胸肌肌内脂肪含量的测定
• 2.1 材料与方法
• 2.1.1 材料
• 2.1.2 方法
• 2.2 结果与分析
• 2.2.1 北京鸭3 个品系、樱桃谷鸭屠体性能与肌内脂肪含量的比较结果
• 第三章 北京鸭A-FABP 基因多态性及其与屠体性状的关联分析
• 3.1 材料与方法
• 3.1.1 材料
• 3.1.2 试验方法
• 3.2 结果
• 3.2.1 PCR 产物扩增片段
• 3.2.2 PCR-SSCP 结果
• 3.2.3 回收测序
• 3.2.4 统计分析
• 第四章 北京鸭PRLR 基因多态性及其与产蛋性能的关联分析
• 4.1 材料与方法
• 4.1.1 材料
• 4.1.2 研究方法
• 4.1.3 PCR 产物检测、变性及PAGE 和SSCP 图像分析
• 4.1.4 北京鸭PRLR 基因序列测定及DNA 序列分析
• 4.2 结果和分析
• 4.2.1 PCR 产物的电泳检测
• 4.2.2 PCR-SSCP 分析
• 4.2.3 PRLR 基因突变与产蛋性能的关联分析
• 第五章 讨论
• 5.1 关于候选基因法
• 5.2 关于抽样与样本含量
• 5.3 关于PCR 扩增效率
• 5.4 关于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测效率
• 5.5 关于饲养试验
• 5.6 关于基因多态性
• 5.6.1 北京鸭、樱桃谷鸭A-FABP 基因多态性的研究
• 5.6.2 北京鸭PRLR 基因多态性的研究
• 5.7 SNP 与生产性状的关联分析
• 5.7.1 北京鸭、樱桃谷鸭A-FABP 基因多态性与屠体性状的关联分析
• 5.7.2 北京鸭PRLR 基因多态性与产蛋性能的关联分析
• 第六章 结论
• 6.1 屠体性能指标与胸肌肌内脂肪含量的测定
• 6.2 北京鸭A-FABP 基因多态性与屠体性状的关联分析
• 6.3 北京鸭PRLR 基因多态性与产蛋性能的关联分析
• 参考文献
• 缩略语
• 致谢
• 个人简介