中国荷斯坦牛SERPINA1和POU1F1基因多态性对产奶性状影响研究

论文摘要

随着养殖业对奶牛生产水平的要求不断提高,需要明确对生产性能有主效作用的数量性状基因效应,以加快通过后裔测定的育种改良速度。本试验选择了中国荷斯坦牛的SERPINA1基因和POUIF1基因作为功能候选基因进行研究,通过单核苷酸多态性和统计模型分析,以期为中国荷斯坦牛育种提供分子标记辅助选择的依据。试验采集220头系谱资料齐全、生产记录完整的中国荷斯坦牛血样。对牛SERPINA1基因运用PCR-RFLP、CRS-PCR、MAMA-PCR和PCR-SSCP技术,以及牛POU1F1基因的第六外显子运用PCR-RLP技术进行多态性分析,并进行各位点多态性与产奶性状（产奶量,乳蛋白率,乳脂率,体细胞评分）关联分析。研究表明,中国荷斯坦牛SERPINA1基因第五外显子没有多态性;第二外显子的5504,5609,5624和5747位点,以及第4外显子的8178位点这五个多态位点均存在多态性。除了8178位点外,5504,5609,5624和5747位点均符合哈迪-温伯格平衡。多态信息含量分析显示,此五个多态位点均呈中度多态。对5个多态位点的基因型与奶牛性状（产奶量,乳蛋白率,乳脂率以及体细胞评分）的关联分析显示,五个多态位点不同基因型对产奶量、乳蛋白率和乳脂率的影响均不显著（P＞0.05）。仅5747位点的不同基因型对SCS有明显的影响（P＜0.05）。因此,5747位点初步可以作为中国荷斯坦牛抗乳腺炎的分子标记。分析中国荷斯坦牛POUIF1基因第六外显子的遗传多态性表明,样本群体在该位点符合哈迪-温伯格平衡。其多态信息含量呈中度多态。其多态信息含量呈中度多态。将其遗传多态性与产奶性状进行关联分析表明,该位点对乳脂率、产奶量以及SCS影响不显著（P＞0.05）;GG基因型奶牛平均乳蛋白率较高（P＜0.05）。POU1F1基因的该SNP初步可以作为影响中国荷斯坦牛乳蛋白率的分子标记,可以通过扩大试验进一步验证。

论文目录

• 中文摘要
• Abstract
• 英文缩写一览表
• 文献综述
• 引言
• 1 材料与方法
• 1.1 试验材料
• 1.1.1 试验动物
• 1.1.2 主要仪器设备
• 1.1.3 溶液试剂配制
• 1.1.4 主要分子生物学软件
• 1.2 试验方法和步骤
• 1.2.1 奶牛DNA的提取
• 1.2.2 基因组DNA浓度和纯度的检测
• 1.3 SERPINA1基因和POU1F1基因多态性的检测方法
• 1.3.1 SERPINA1基因和POU1F1引物的设计与合成
• 1.3.2 最佳PCR条件的建立
• 1.3.3 PCR产物的测序方法
• 1.3.4 a1-AT和POU1F1基因SNP酶切反应条件
• 1.3.5 SERPINA1基因外显子Ⅱ和外显子Ⅴ的PCR-SSCP分析方法
• 1.4 统计分析
• 1.4.1 多态性统计方法
• 1.4.2 相关性统计方法
• 2 结果与分析
• 2.1 基因组DNA的提取
• 2.2 SERPINA1基因和POU1F1基因的突变位点
• 2.3 SERPINA1和POU1F1基因的基因分型
• 2.4 SERPINA1基因的PCR-SSCP检测
• 2.5 中国荷斯坦牛SERPINA1和POU1F1基因多态性分析
• 2.6 产奶性状均值分析
• 2.7 SERPINA1和POU1F1基因多态性与产奶性状关联分析
• 3 讨论
• 3.1 影响PCR的有效扩增问题
• 3.2 关于建立碱基错配检测SERPINA1基因SNP的方法
• 3.3 关于SERPINA1和POU1F1对产奶性状的影响
• 3.4 关于统计分析模型的选择
• 3.5 存在的问题及展望
• 4 结论
• 参考文献
• 致谢
• 作者简介
• 在读期间发表的学术论文