代谢谱论文-鲁娜,马晓丽,李琳琳,王烨,骆新

代谢谱论文-鲁娜,马晓丽,李琳琳,王烨,骆新

导读:本文包含了代谢谱论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:维吾尔族,哈萨克族,气阴两虚,2型糖尿病

代谢谱论文文献综述

鲁娜,马晓丽,李琳琳,王烨,骆新[1](2019)在《新疆维吾尔族与哈萨克族气阴两虚2型糖尿病患者尿液中氨基酸代谢谱的研究》一文中研究指出目的:探究新疆维吾尔族(维族)和哈萨克族(哈族)气阴两虚2型糖尿病(T2DM)患者尿液中氨基酸的变化,找出氨基酸特征性代谢物。方法:选择177例志愿者,检测其尿液中的17种氨基酸。结果:在尿液的17种氨基酸中,维族和哈族的氨基酸差异性代谢物为蛋氨酸(Met)、亮氨酸(Leu);气阴两虚T2DM的氨基酸差异性代谢物为天冬氨酸(Asp)、缬氨酸(Val)、Met、异亮氨酸(Ile)。结论:17种氨基酸代谢谱中,Met是维哈两民族气阴两虚T2DM尿液中的特征性氨基酸代谢物,从而为T2DM中医病机理论的研究提供了依据。(本文来源于《中华中医药杂志》期刊2019年11期)

张雪,漆正堂,丁树哲[2](2019)在《不同方式运动对DEN诱导肝肿瘤肝脏代谢谱的影响》一文中研究指出研究目的:近年来,许多研究发现大强度间歇性运动可作为一种"节约时间"的碎片化运动方式,延缓衰老、改善代谢性疾病。对于肿瘤而言,以往的研究重点关注低或中等强度耐力运动的抗肿瘤作用,而大强度间歇性运动对肿瘤的影响研究相对较少。大强度间歇性运动能否发挥同样的抗肿瘤作用,值得进一步探讨。代谢组学是通过对内源性代谢物种类及数量变化的分析,将机体作为一个完整的体系来研究,应用全面性系统策略解读疾病过程和机制。本研究以二乙基亚硝胺(DEN)诱导小鼠肝细胞肝癌(HCC)为动物模型,比较不同方式运动的抗肿瘤效益,从代谢组学的角度研究不同方式运动后肝脏的代谢谱变化,旨在进一步揭示不同运动方式抗肿瘤作用发生差异的可能机制。研究方法:3周龄C57小鼠腹腔注射二乙基亚硝胺(Diethylntrosamine,DEN)(25mg/kg,每周1次),给药10周,诱发肝肿瘤模型。8周对DEN注射小鼠进行运动干预,直至26周异氟烷麻醉处死取材。大强度间歇运动(HIT):85-90%VO2max,25m/min,运动2min,休息间歇2min,交替进行10次/日,5日/周;中等强度耐力运动(ET):65-75%VO2max,13m/min,持续运动40min/日,5日/周。取肝组织放入10%甲醛溶液固定,24—48h后转入70%酒精保存,进行常规的HE染色观察并拍照。采用气相色谱-飞行时间质谱联用(GC-TOFMS)检测小鼠肝脏代谢物,原始GC-TOFMS数据文件通过ChromaTOF软件(美国Leco公司)进行处理,最终得到保留时间和质荷比组成的谱峰索引、样本信息以及谱峰强度值组成的叁维矩阵。经过数据提取功能得到480个变量,将上述处理的矩阵导入SIMCA-P软件中进行多元统计分析。研究结果:各组体重与肝脏重没有显着性变化。DEN组肿瘤发生率66.7%,HIT组肿瘤发生率62.5%,ET组肿瘤发生率20%,ET组肿瘤发生率明显下降。病理组织学检测(H&E染色)表明:NC组肝组织结构完整,清晰,细胞形态规则,未见凋亡、肿胀以及坏死,未见炎性细胞浸润。DEN组和HIT组肝组织结构破坏,胞浆空泡化,细胞肿胀,细胞大小、形态不一,有不同程度炎性细胞浸润。还观察到长时间中等强度运动可减轻DEN诱导的肝组织病变,减缓炎性细胞浸润。采用PCA-X对肝脏样本进行分组处理,DEN、HIT和ET肝脏样本在PCA得分图上可以区分(R2X(cum)=0.489,Q2(cum)=0.045),提示小鼠肝脏代谢网络因不同运动方式干预发生了明显变化。为了进一步验证代谢通路,采用OPLS-DA对DEN与ET组,HIT与ET组肝脏样本重新建模,以鉴别差异变量。在正交偏最小二乘法分析(OPLS)模型中,DEN与ET组(R2X(cum)=0.576,R2Y(cum)=0.698,Q2(cum)=-0.021),HIT与ET组(R2X(cum)=0.468,R2Y(cum)=0.643,Q2(cum)=-0.199),表明代谢物差异显着。通过OPLS-DA分析结果,DEN与ET组之间找到37个差异变量(VIP>1),HIT与ET组之间找到27个差异变量(VIP>1),并对这些差异代谢物的变量进行t检验(P<0.05),鉴定了13个差异代谢物。与DEN组相比,耐力运动后肝脏半乳糖、脯氨酸、甘氨酸、胆固醇、氨基甲酸和棕榈酸显着下降;丙二酸、鸟氨酸和谷氨酸显着上升。将DEN与ET组发生变化的代谢物带入Metaboanalyst4.0中进行代谢通路分析,构建与长时间中等强度运动相关的代谢通路分析图。设立t检验P<0.05、-log(p)值大于1以及代谢通路影响因子(pathway impact)大于0.2的临界点,发现与长时间中等强度运动相关的代谢通路主要涉及4条:谷氨酰胺和谷氨酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成,精氨酸和脯氨酸代谢,丙氨酸天冬氨酸和谷氨酸代谢。HIT与ET组间的差异代谢物带入Metaboanalyst4.0中进行代谢通路分析,没发现运动方式对其影响的代谢通路。研究结论:DEN诱导肝肿瘤发生过程中,中等强度耐力运动使肝脏代谢谱发生了显着性变化,主要体现在脂代谢和氨基酸代谢通路。与大强度间歇性运动比较,运动抗肿瘤作用产生差异的代谢标记物包括胆固醇、棕榈酸、尿嘧啶、羟基吡啶、麦芽糖、硬脂酸,这些代谢物提示:中等强度耐力运动与大强度间歇性运动对肝脏的代谢谱进行了差异化重构,涉及脂代谢和氨基酸代谢通路。大强度间歇运动对DEN诱导肿瘤发生发展没有抑制作用,两种不同运动方式对肝脏的脂代谢和氨基酸代谢通路进行了差异化调节,这可能是抗肿瘤作用发生差异的重要机制。(本文来源于《第十一届全国体育科学大会论文摘要汇编》期刊2019-11-01)

杨蒙,郭涛[3](2019)在《低温胁迫下水稻种子萌发代谢谱分析和关键代谢物鉴定》一文中研究指出【研究背景】水稻(Oryza sativa.)低温萌发是一个多基因控制的数量性状。目前,对该性状的研究主要集中在QTL定位及差异表达基因分析,而低温萌发过程中代谢谱的分析尚未有报道;【材料与方法】本研究以粳稻品种02428和籼稻品种YZX为实验材料,分别对其进行低温、常温及低温转常温处理,在不同萌发时间点进行取样,共获取16组48个样品。利用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)联用的广泛靶向代谢组技术【结果与分析】测到730个代谢物。在低温胁迫处理下,两种水稻上调类型的差异代谢物以黄酮(31),核苷酸及其衍生物(29),有机酸及其衍生(23),酚胺(21)为主,其差异代谢结果,进行KEGG通路富集,表明在低温胁迫处理下上调的代谢物的主要富集在Biosynthesis of secondary metabolites通路中。为进一步筛选水稻种子响应低温胁迫的差异代谢物,我们在730个代谢物中通过筛选低温处理下代谢物含量高于干种子和常温处理下及第4天高于转化点代谢物含量(■)的代谢物,获得35个响应低温胁迫的差异代谢物。进而又根据fold change和VIP(variable importance in project) value,对35个差异代谢物做进一步筛选,找到了7个响应低温胁迫的核心差异代谢物。利用SIMCA-P软件进行7个核心差异代谢物与低温胁迫萌发表型的芽长(SL),芽表面积(SSA),芽体积(SV)做偏最小二乘法回归分析(PLS),所构建的回归模型R2X、R2Y以及Q2均大于0.5,拟合效果较好。基于回归方程,鉴定出Tri251(N-Caffeoyl putrescine),Tri524(Anthranilic acid),Tri845(Inositol),Tri890(L-ascorbate)四个核心差异代谢物是对低温发芽表型贡献较大的的差异代谢物。根据它们在kegg中所注释的路径,构建了代谢通路图,它们主要参与苯丙素的生物合成,氨基酸的生物合成,肌醇磷酸,谷胱甘肽等代谢途径。【结论】本研究利用广泛靶向代谢组技术分析了水稻品种02428(粳稻)和YZX(籼稻)低温条件下种子萌发代谢谱。通过代谢物差异比较及PLS分析,从检测到的730种代谢物中鉴定出7个显着响应低温并促进低温萌发的关键代谢物。这7个关键代谢物参与氨基酸的生物合成、苯丙素生物合成、谷胱甘肽、肌醇磷酸等代谢途径,为水稻种子低温萌发提供能量和代谢原料。本研究为进一步理解水稻种子低温萌发机理及鉴定低温萌发相关基因奠定了基础。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27)

姬海南,李海山,宋乃宁,徐宝梁,赵潺[4](2019)在《基于高分辨质谱研究双酚A对小鼠血浆代谢谱的影响》一文中研究指出目的:观察不同染毒剂量的双酚A对C57BL6小鼠血浆代谢谱的变化,探讨其产生毒性效应可能的作用机制,并尝试寻求其毒性相关生物靶点。方法:运用双酚A制备不同染毒剂量的小鼠模型,将小鼠随机分为对照组、1、10、50、250μg·kg-1组。利用超高液相色谱-质谱(UHPLC-MS/MS)技术结合主成分分析、偏最小二乘分析等方法对血清数据进行分析,鉴定出潜在生物标记物,通过VIP及非参数检验筛选并通过多元化ROC曲线验证差异代谢物;运用Pathway Analysis数据库对差异性代谢物进行拓扑分析;运用R和Cytoscape进行代谢产物的相关性分析和模块化分析。结果:发现对照组各染毒剂量组基本分离,并随染毒剂量的增加,各组逐渐偏离对照组,提示小鼠机体具有发生紊乱的趋势;从血浆中筛选出27种差异代谢物进行通路分析,发现双酚A发挥干预作用可能与亚油酸代谢、花生四烯酸代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、丙酮酸代谢、鞘脂类代谢、磷酸肌醇代谢等通路有关;进行模块化分析发现7个模块之间关系密切,焦谷氨酸,花生四烯酸,5-羟色胺,异柠檬酸,甘油叁酯等生物靶点可作为双酚A引起机体毒性的标识。结论:双酚A经过14d染毒后,所产生的毒性作用机制可能与双酚A导致小鼠体内氨基酸代谢、能量代谢及脂代谢等代谢紊乱相关。(本文来源于《2019全国呼吸毒理与卫生毒理学术研讨会论文集》期刊2019-10-25)

王朋倩,吴茵,戴丽,霍海如,隋峰[5](2019)在《基于UHPLC-MS的吴茱萸汤影响虚寒呕吐大鼠尿液代谢谱的研究》一文中研究指出目的观察吴茱萸汤对虚寒呕吐大鼠尿液代谢谱的变化,探讨其治疗虚寒呕吐证可能的作用机制。方法运用复合法(大黄+顺铂)制备大鼠虚寒呕吐模型,将大鼠随机分为对照组、模型组、吴茱萸汤组。利用超高液相色谱-质谱(UPLC-MS/MS)技术结合主成分分析、偏最小二乘分析等方法对尿液数据进行分析,鉴定出潜在生物标志物,通过VIP及非参数检验筛选并通过多元化ROC曲线验证差异代谢物;运用PathwayAnalysis数据库对差异性代谢物进行拓扑分析;运用R和Cytoscape进行代谢产物的相关性分析和模块化分析。结果尿液代谢谱对照组和模型组完全分离,吴茱萸汤组靠近对照组,表明模型复制成功,且吴茱萸汤能够干预大鼠的虚寒呕吐症状,提示大鼠机体具有恢复到正常状态的趋势。从尿液中筛选出34种差异代谢物进行通路分析,发现虚寒呕吐发挥干预作用可能与缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成,精氨酸和脯氨酸代谢,色氨酸代谢,酪氨酸代谢,花生四烯酸代谢,叁羧酸循环(TCA循环)等通路有关;进行模块化分析发现10个模块之间关系密切,丙氨酸、亮氨酸、酪氨酸、色氨酸、异亮氨酸、琥珀酸、丙氨酸、富马酸、苹果酸、异柠檬酸等生物靶点可作为虚寒呕吐模型的标识。结论吴茱萸汤能够改善虚寒呕吐模型的生理特征,机制可能与吴茱萸汤调节大鼠体内紊乱的氨基酸代谢、能量代谢及脂代谢等有关。(本文来源于《中草药》期刊2019年18期)

李忆涛,桑潮,梁丹丹,陈天璐[6](2019)在《基于贝叶斯网络的典型关节炎代谢谱研究》一文中研究指出目的比较类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者及痛风性关节炎(gout arthritis,GA)患者与正常对照组之间血清代谢谱的差异,构建两种关节炎共有和特有代谢物的贝叶斯网络模型。方法采用液相色谱质谱和气相色谱质谱技术检测27例RA患者及34例GA患者和60例正常对照者血清代谢产物,识别RA及GA的潜在生物标志物;构建基于贪婪搜索算法的两种关节炎特有和共有代谢物的贝叶斯网络图。结果 RA及GA组与正常对照组血清代谢物存在明显差异,基于单元及多元统计方法,RA组筛选出34个差异代谢物,GA组筛选出41个差异代谢物,其中两种关节炎共有的差异代谢物14个;基于上述代谢物构建的贝叶斯网络揭示了不同代谢物之间可能存在的因果关系。结论相比于代谢组学传统的多元统计学方法,贝叶斯网络能良好反映疾病差异代谢物之间存在的因果关系,在代谢组学中具有较好的应用前景。(本文来源于《转化医学杂志》期刊2019年04期)

廖晗[7](2019)在《基于同位素标记的蛋氨酸甲基化代谢谱分析方法研究》一文中研究指出一碳代谢包括叶酸循环和蛋氨酸循环,参与多种生理过程包括嘌呤和胸腺嘧啶的生物合成、维持氨基酸体内稳态、表观遗传学的维持、氧化还原平衡以及甲基化过程等等,其中一碳代谢中甲基化异常与与肿瘤的发生发展有着密不可分的联系。然而,目前有关甲基化的研究主要集中在基因和蛋白质水平,在代谢水平上甲基化与癌症亦有非常密切的关系。因此有必要对一碳循环中甲基化代谢进行深入研究,不仅有利于寻找与癌症相关的生物标志物,探索癌症在甲基化途径上可能发生的紊乱,更有可能为癌症的发病机理提供线索,为其诊疗和获取癌症新的治疗靶点提供可靠依据。但是甲基受体在体内种类繁多,甲基化代谢物的质谱分析特征性较低,相关代谢物的结构特异性不强且无特征官能团,因此难以建立统一的定性及定量分析方法对其实现有效检测,难以实现其整体定性识别和结构鉴定。本研究采用稳定同位素标记技术与同位素稀释定量分析方法,以乳腺癌细胞为研究对象通过代谢标记蛋氨酸的活性甲基(13CD3)对标记后的甲基代谢物进行追踪分析,开展了基于LC-MS技术的细胞内甲基化代谢物整体定性与相对定量分析方法研究,以实现对乳腺癌细胞与蛋氨酸相关的甲基化代谢特征分析;然后结合同位素稀释定量方法实现在不同分子分型的乳腺癌细胞和乳腺上皮细胞的甲基化代谢谱的定量分析。本研究旨在建立甲基化代谢谱定性与定量分析新方法,该方法可能会为发现新的癌症发生发展生物标志物,阐明癌症发病机制等带来新的依据。本论文的研究内容主要包括以下叁个部分:1.基于同位素代谢标记的甲基化代谢物定性分析方法研究本章第一节首先建立了细胞内代谢组和脂质组的非靶向LC-MS分析方法,为后续甲基化代谢物的寻找建立良好基础;第二节采用稳定同位素代谢标记技术,以乳腺癌细胞为研究对象开展蛋氨酸相关的甲基化代谢特征分析。研究首先考察并优化了细胞前处理方法并分别采用氨基色谱柱和C18色谱柱建立细胞内极性代谢和脂类代谢物的定性分析方法。然后将13CD3-蛋氨酸作为示踪剂引入到乳腺癌细胞的培养中,结合非靶向代谢组学研究策略寻找和鉴定标记的甲基化代谢物。研究最终寻找到与蛋氨酸代谢相关的20个甲基化代谢物,包括单甲基、二甲基、叁甲基标记的代谢物,包括氨基酸类、寡肽类、磷脂酰胆碱类以及一些未经报道的新代谢物。由此,发现与蛋氨酸活性甲基相关的7条甲基化代谢途径,包括肌酸合成、组蛋白甲基化、磷脂酰胆碱的合成、精胺和亚精胺的合成、1-甲基烟酰胺的合成以及2条推测的代谢途径,并对关键性代谢物的甲基化通路进行了阐释。通过本章研究,建立了基于同位素代谢标记的细胞甲基化代谢物分析方法,发现了一些细胞中与蛋氨酸甲基化相关的代谢物和代谢途径,为阐明甲基化代谢机制提供了新的分析手段和依据。2.甲基化代谢物相对定量分析方法研究本研究建立了蛋氨酸相关的甲基化代谢物的LC-MS同位素稀释定量分析方法。研究首先通过分析不同标记时间的甲基化代谢物的同位素丰度比,发现细胞在标记培养48小时后代谢物基本达到标记稳态,并以此作为稳定同位素内标建立同位素稀释定量分析方法。然后,采用全扫描(Full MS)与单离子扫描(Single ion monitoring,SIM)相结合的质谱数据采集方式,对寻找到的甲基化代谢物建立了相对定量分析方法,并考察了该方法的线性及精密度。其中,所有代谢物工作曲线的线性拟合系数均达0.98以上,80%以上均大于0.99;绝大部分代谢物相对含量测定值的相对标准偏差(RSD)均小于20%,精密度良好。该方法能满足细胞样本中甲基化标记代谢物的相对定量分析要求。3.乳腺癌细胞甲基化代谢谱分析研究采用上述建立的LC-MS同位素稀释定量分析方法,对不同基因分型的乳腺癌细胞系和人乳腺上皮细胞系中的甲基化代谢物进行相对定量分析,寻找与乳腺癌相关的甲基化代谢物。结果表明,大多数的甲基化代谢物在乳腺癌中呈上调,其中二甲基精氨酸、蛋氨酸、和寡肽赖氨酸-甲基缬氨酸-甲基脯氨酸、甲基脯氨酸-甲基脯氨酸-赖氨酸-天冬氨酸上调2倍以上,叁甲基赖氨酸和叁甲基甘氨酸-谷氨酸-赖氨酸上调超过5倍;而1-甲基烟酰胺在乳腺癌细胞中显着下降,下调倍数超过5倍。值得注意的是,1-甲基烟酰胺在乳腺癌细胞中显着下调可能是和代谢通路上下游的相关代谢酶有关但目前尚未得到确证,还需更深入的验证实验。且不同基因分型的乳腺癌细胞间甲基化代谢谱差异较大,可能和相关的基因表达有关,后期将进行深入的生物学验证。(本文来源于《北京协和医学院》期刊2019-05-01)

樊欢[8](2019)在《柑橘大实蝇蛹期发育的代谢谱分析及海藻糖—6—磷酸磷酸酯酶基因功能分析》一文中研究指出柑橘大实蝇Bactrocera minax(Ederliein)是柑橘类果实的重要害虫之一,给柑橘产业带来重大经济损失。柑橘大实蝇于蛹期进入专性滞育使其躲避不利环境因素的伤害,从而保证种群的繁衍。海藻糖是昆虫的“血糖”,在昆虫生长发育和滞育方面起着重要的作用。本学位论文分析了柑橘大实蝇不同滞育时期代谢谱差异,并进一步深入研究了海藻糖合成途径中的海藻糖-6-磷酸磷酸酯酶基因(TPPB、TPPC1、TPPC2)的分子特性和功能,旨在为柑橘大实蝇滞育分子机理的研究提供理论依据。主要研究结果如下:1柑橘大实蝇不同滞育期代谢谱的分析本研究利用核磁共振波谱分析方法对柑橘大实蝇滞育前期(PreD)、滞育早(ED)、中(MD)、晚(LD)期以及滞育后期(PD)这5个时间点的样品进行了代谢组分析。主成分分析和最小二乘判别分析得到的柑橘大实蝇蛹期代谢谱差异与前期获取的基因表达谱差异相一致,两者都表明滞育早(ED)、中(MD)、后(LD)期的样品彼此差异不显着,叁者与滞育前期(PreD)和滞育后期(PD)的差异显着。通过计算各代谢物VIP值,明确了对代谢组组间差异贡献最大的9种代谢物是脯氨酸、海藻糖、N-乙酰谷氨酸、琥珀酸、谷氨酸、丙氨酸和甘油磷酰胆碱、谷氨酰胺在以及2-氧基戊二酸。其中,脯氨酸和海藻糖的VIP值大大高于其他代谢物,并且在整个滞育期间浓度维持较高水平。脯氨酸和海藻糖在柑橘大实蝇越冬期间能起到冷冻保护剂的作用,保护个体免受寒冷伤害。2柑橘大实蝇BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2具有发育阶段和组织特异性利用qPCR与微滴数字PCR,对BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2在不同发育阶段及不同组织的表达水平进行了相对和绝对定量分析。相对定量分析表明:BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2在蛹期表达量低于幼虫与成虫期。此外,在整个发育阶段BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2叁者之间略有差异。BmTPPB在表皮中高表达,BmTPPC1在马氏管中特异性表达,远远高于在其他组织中的表达量,而BmTPPC2在脂肪体中的表达水平最高。绝对定量分析表明:除了10日龄蛹外,BmTPPB转录本拷贝数占BmTPPs总拷贝数的比例在每个时间点上都高于其他两个基因;BmTPPC1在马氏管中的拷贝数比例最高;BmTPPC2在脂肪体中的拷贝数比例最高;BmTPPB在其他组织中的拷贝数比例最高。3 BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2蛋白质生物学信息分析BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2蛋白质序列分析结果显示都具有有HAD超家族的保守区域:motif I—DXXX—(T/V);motif II—(S/T)—GX;motif—III—K;motif IV—(G/S)—(D/S)—XXX(D/N)。motif I序列具有DxD特征,Motif II具有高度保守的苏氨酸或丝氨酸残基,Motif III以保守的赖氨酸为中心,其发生在α-螺旋区的N-末端部分周围,Motif II和III有助于水解中间体的稳定性。Motif IV的特征是有保守的酸性残基。Motif IV的酸性残基通常表现出以下叁种特征之一:DD,GDxxxD或GDxxxxD(其中x是任何氨基酸)。柑橘大实蝇TPP Motif IV的标记由GDxxxD酸性残基表示。4柑橘大实蝇BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2基因异源表达以及活性分析采用毕赤酵母真核表达系统,分别构建BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2的重组蛋白表达载体,并在细胞内成功表达,获取纯化后的重组蛋白。对重组蛋白活性研究分析表明,BmTPPB在37.5℃、pH7.8的条件下酶活性最强,BmTPPC1在27.5℃、pH7.4条件下活性最强,而BmTPPC2在35℃、pH7.4的条件下酶活性最强。TPPC1对底物的亲和力高于TPPB和TPPC2,TPPC2酶促反应的速率最快。5基于RNAi技术的柑橘大实蝇BmTPPB、BmTPPC1、BmTPPC2功能验证采用显微注射的方法,将2.0μg ds-BmTPPB、ds-BmTPPC1、ds-BmTPPC2以及叁者的混合液注射到柑橘大实蝇3龄幼虫体内。利用qPCR检测注射不同dsRNA后的基因沉默效率。结果显示,注射48 h后目的基因沉默效果显着,并且不存在相互干扰与脱靶效应。同时,BmTPP基因的干扰也导致了TPP酶活力与海藻糖含量下降,以及几丁质合成通路相关基因表达量的下降。综上所述,本学位论文分析了柑橘大实蝇不同滞育期代谢谱差异,筛选出与滞育密切相关的代谢物,其中包括海藻糖。随后另外全面解析了海藻糖合成途径中的BmTPPB、BmTPPC1与BmTPPC2的序列特征、时空表达模式以及在海藻糖合成中的作用。上述研究结果为进一步明确柑橘大实蝇海藻糖合成的生理机制,以及为进一步了解揭示柑橘大实蝇滞育的分子机理提供数据基础。(本文来源于《西南大学》期刊2019-04-08)

王佳,王攀,樊欢,刘映红[9](2019)在《柑橘大实蝇滞育型与非滞育型蛹的代谢谱比较》一文中研究指出【目的】明确柑橘大实蝇(Bactrocera minax)滞育型(D)与非滞育型(ND)蛹各自在不同时间点之间的代谢谱差异,以及相同时间点上D型与ND型蛹之间的代谢谱差异。此外,发掘在不同对比组合中具有显着差异的代谢物种类。【方法】在化蛹后1 d内,注射20E溶液解除滞育,获取ND型蛹;注射10%乙醇溶剂获取对照D型蛹。在注射后1、15和30 d收集两种类型的蛹,利用核磁共振(NMR)技术对样品进行检测。运用Chenomx软件将NMR谱图信号与数据库逐一比对分析,确定代谢物种类和对应的浓度。再使用偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)进行数据分析,明确D1对D15对D30、ND1对ND15对ND30、D1对ND1、D15对ND15、D30对ND30共5个对比组合之间的代谢谱差异。最后结合变量投影重要性分析(VIP)和单因素方差分析或t检验,发掘在不同对比组合中具有显着浓度差异的代谢物种类。【结果】在所有样品中,共获得50种代谢物及其浓度。其中,氨基酸及其衍生物20种、有机酸11种、糖类4种、核酸组分5种,其他代谢物10种。PLS-DA分析表明,D型蛹在3个时间点之间代谢谱差异显着;ND型蛹在注射后15 d和30 d之间代谢谱无显着差异,但两者均与注射后1 d之间差异显着;在3个不同时间点上,D型与ND型蛹之间代谢谱均差异显着。VIP分析和单因素方差分析或t检验结果表明,共有21种代谢物浓度至少在一个对比组合中呈现显着差异,其中,D1对D15对D30组合中有10种;ND1对ND15对ND30组合中有12种;D1对ND1组合中有6种;D15对ND15组合中有12种;D30对ND30组合中有8种。柠檬酸、葡萄糖、麦芽糖、脯氨酸、海藻糖、谷氨酸、天冬酰胺和N-乙酰谷氨酸出现显着差异的次数最多。【结论】出现显着差异次数最多的代谢物中,柠檬酸、葡萄糖、麦芽糖、脯氨酸、海藻糖、谷氨酸和天冬酰胺能直接或间接进入叁羧酸循环,说明柑橘大实蝇滞育期间能量代谢和物质转化产生了显着的变化。此外,海藻糖、脯氨酸、N-乙酰谷氨酸和肌醇的显着差异有助于调控柑橘大实蝇滞育期间的耐寒性。研究结果可为后续解析重要代谢物及相关生理途径在柑橘大实蝇滞育中的作用机理提供依据。(本文来源于《中国农业科学》期刊2019年06期)

范子玲,宋玉锡,张江,赵畅,白云龙[10](2018)在《基于~1H-NMR技术的产后卵巢静止奶牛乳清和血清代谢谱分析》一文中研究指出旨在应用代谢组学技术筛选产后卵巢静止奶牛乳清和血清的差异代谢物,明确其与奶牛卵巢静止的关系。本研究选取产后45~60 d的正常发情奶牛和卵巢静止奶牛各14头进行试验。应用一维氢谱核磁共振(~1H-NMR)技术对两组奶牛的乳清和血清进行检测,结合多元统计分析和单变量分析,筛选出组间差异代谢物,并进行生物信息学分析,阐明差异代谢物参与的代谢通路与奶牛卵巢静止的关系。结果表明,在乳清和血清中分别筛选出13种差异代谢物。与发情奶牛相比,卵巢静止奶牛乳清中6种差异代谢物含量升高:琥珀酸、磷酸肌酸、甘氨酸、肌醇、乙醇酸、乳清酸,7种下降:丙氨酸、肌酐、磷酸胆碱、乳糖、牛磺酸、半乳糖、葡萄糖-1-磷酸;血清中4种差异代谢物升高:β-羟丁酸、乙酸、谷氨酰胺、甘氨酸,9种降低:丙氨酸、琥珀酸、柠檬酸、肌酐、磷酸胆碱、葡萄糖、肌醇、酪氨酸、组氨酸。两组奶牛乳清差异代谢物主要参与牛磺酸和亚牛磺酸代谢、半乳糖代谢、原代胆汁酸生物合成等。血清差异代谢物主要参与丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、柠檬酸循环、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成等。本研究获得了卵巢静止奶牛乳清和血清的代谢谱及其差异代谢物,结果表明了主要的糖代谢、脂代谢和氨基酸代谢的异常途径在奶牛产后卵巢静止发生中所起的作用,为今后深入研究奶牛产后卵巢静止发生机制和防治策略提供了新的方向。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2018年12期)

代谢谱论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

研究目的:近年来,许多研究发现大强度间歇性运动可作为一种"节约时间"的碎片化运动方式,延缓衰老、改善代谢性疾病。对于肿瘤而言,以往的研究重点关注低或中等强度耐力运动的抗肿瘤作用,而大强度间歇性运动对肿瘤的影响研究相对较少。大强度间歇性运动能否发挥同样的抗肿瘤作用,值得进一步探讨。代谢组学是通过对内源性代谢物种类及数量变化的分析,将机体作为一个完整的体系来研究,应用全面性系统策略解读疾病过程和机制。本研究以二乙基亚硝胺(DEN)诱导小鼠肝细胞肝癌(HCC)为动物模型,比较不同方式运动的抗肿瘤效益,从代谢组学的角度研究不同方式运动后肝脏的代谢谱变化,旨在进一步揭示不同运动方式抗肿瘤作用发生差异的可能机制。研究方法:3周龄C57小鼠腹腔注射二乙基亚硝胺(Diethylntrosamine,DEN)(25mg/kg,每周1次),给药10周,诱发肝肿瘤模型。8周对DEN注射小鼠进行运动干预,直至26周异氟烷麻醉处死取材。大强度间歇运动(HIT):85-90%VO2max,25m/min,运动2min,休息间歇2min,交替进行10次/日,5日/周;中等强度耐力运动(ET):65-75%VO2max,13m/min,持续运动40min/日,5日/周。取肝组织放入10%甲醛溶液固定,24—48h后转入70%酒精保存,进行常规的HE染色观察并拍照。采用气相色谱-飞行时间质谱联用(GC-TOFMS)检测小鼠肝脏代谢物,原始GC-TOFMS数据文件通过ChromaTOF软件(美国Leco公司)进行处理,最终得到保留时间和质荷比组成的谱峰索引、样本信息以及谱峰强度值组成的叁维矩阵。经过数据提取功能得到480个变量,将上述处理的矩阵导入SIMCA-P软件中进行多元统计分析。研究结果:各组体重与肝脏重没有显着性变化。DEN组肿瘤发生率66.7%,HIT组肿瘤发生率62.5%,ET组肿瘤发生率20%,ET组肿瘤发生率明显下降。病理组织学检测(H&E染色)表明:NC组肝组织结构完整,清晰,细胞形态规则,未见凋亡、肿胀以及坏死,未见炎性细胞浸润。DEN组和HIT组肝组织结构破坏,胞浆空泡化,细胞肿胀,细胞大小、形态不一,有不同程度炎性细胞浸润。还观察到长时间中等强度运动可减轻DEN诱导的肝组织病变,减缓炎性细胞浸润。采用PCA-X对肝脏样本进行分组处理,DEN、HIT和ET肝脏样本在PCA得分图上可以区分(R2X(cum)=0.489,Q2(cum)=0.045),提示小鼠肝脏代谢网络因不同运动方式干预发生了明显变化。为了进一步验证代谢通路,采用OPLS-DA对DEN与ET组,HIT与ET组肝脏样本重新建模,以鉴别差异变量。在正交偏最小二乘法分析(OPLS)模型中,DEN与ET组(R2X(cum)=0.576,R2Y(cum)=0.698,Q2(cum)=-0.021),HIT与ET组(R2X(cum)=0.468,R2Y(cum)=0.643,Q2(cum)=-0.199),表明代谢物差异显着。通过OPLS-DA分析结果,DEN与ET组之间找到37个差异变量(VIP>1),HIT与ET组之间找到27个差异变量(VIP>1),并对这些差异代谢物的变量进行t检验(P<0.05),鉴定了13个差异代谢物。与DEN组相比,耐力运动后肝脏半乳糖、脯氨酸、甘氨酸、胆固醇、氨基甲酸和棕榈酸显着下降;丙二酸、鸟氨酸和谷氨酸显着上升。将DEN与ET组发生变化的代谢物带入Metaboanalyst4.0中进行代谢通路分析,构建与长时间中等强度运动相关的代谢通路分析图。设立t检验P<0.05、-log(p)值大于1以及代谢通路影响因子(pathway impact)大于0.2的临界点,发现与长时间中等强度运动相关的代谢通路主要涉及4条:谷氨酰胺和谷氨酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成,精氨酸和脯氨酸代谢,丙氨酸天冬氨酸和谷氨酸代谢。HIT与ET组间的差异代谢物带入Metaboanalyst4.0中进行代谢通路分析,没发现运动方式对其影响的代谢通路。研究结论:DEN诱导肝肿瘤发生过程中,中等强度耐力运动使肝脏代谢谱发生了显着性变化,主要体现在脂代谢和氨基酸代谢通路。与大强度间歇性运动比较,运动抗肿瘤作用产生差异的代谢标记物包括胆固醇、棕榈酸、尿嘧啶、羟基吡啶、麦芽糖、硬脂酸,这些代谢物提示:中等强度耐力运动与大强度间歇性运动对肝脏的代谢谱进行了差异化重构,涉及脂代谢和氨基酸代谢通路。大强度间歇运动对DEN诱导肿瘤发生发展没有抑制作用,两种不同运动方式对肝脏的脂代谢和氨基酸代谢通路进行了差异化调节,这可能是抗肿瘤作用发生差异的重要机制。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

代谢谱论文参考文献

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