106份狗牙根种质资源的SRAP、RAPD、SSR分析

论文摘要

狗牙根(Cynodon)是暖季草中应用最广泛的草种之一,为世界广布种。在新疆南北疆各地均有分布,这些材料具有很强的抗寒、抗旱、耐盐碱、耐瘠薄等特性,但目前对这一珍贵资源的遗传多样性研究还只是在形态上识别,缺乏分子水平的相关研究。本文利用SRAP、RAPD、SSR标记方法对106份狗牙根种质资源进行研究,从分子水平进一步明确其亲缘关系,以期为狗牙根种质资源的保护和利用,创新种质,选育优良狗牙根品种提供科学依据。主要研究结果如下：1.狗牙根具有很丰富的遗传多样性,通过对106个狗牙根居群的SRAP、RAPD、SSR进行GS值统计,106个狗牙根居群遗传相似系数变化较大,SRAP的GS值在0.276到0.939之间；RAPD在0.46到0.98之间；SSR在0.43到1.0之间。SRAP引物共检测位点133个位点；RAPD引物共检测位点63个位点,SSR引物共检测位点53个位点,三种标记方法对应的多态性百分率分别为92.5%、92.06%、94.33%。2.利用SRAP、RAPD和SSR分子标记对106个居群的群体遗传结构进行分析,遗传分化系数分别为0.3914,0.4052,0.3946,表明有39.14%,40.52%,39.46%的变异存在于居群间,60.86%,59.48%,60.54%的变异存在于居群内,居群内的遗传分化大于居群间的遗传分化,狗牙根的遗传变异主要存在于居群内。3.聚类分析结果表明,聚类结果与地理分布有一定的相关性,相近区域或具有相同生境的材料可聚为一类,其原因可能是地理分布较近的居群生态环境相似,基因交流的机会相对较多。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 1.1 研究意义
• 1.2 遗传多样性及其研究方法
• 1.2.1 遗传多样性的研究方法
• 1.3 狗牙根国内外研究现状
• 1.3.1 国内外对狗牙根资源的研究
• 1.3.2 狗牙根遗传多样性研究进展
• 第二章 材料与方法
• 2.1 材料
• 2.2 方法
• 2.2.1 样本采集
• 2.2.2 狗牙根基因组DNA的提取
• 2.2.3 DNA检测方法
• 2.2.4 SRAP分析
• 2.2.5 RAPD分析
• 2.2.6 SSR分析
• 第三章 结果与分析
• 3.1 狗牙根基因组DNA提取结果
• 3.1.1 不同方法提取幼叶基因组DNA的效果比较
• 3.1.2 紫外分光光度检测两种狗牙根DNA的浓度和纯度
• 3.2 SRAP分析结果
• 3.2.1 引物筛选及结果
• 3.2.2 遗传多样性分析
• 3.2.3 遗传相似性分析
• 3.2.4 聚类分析
• 3.3 RAPD分析结果
• 3.3.1 引物筛选及结果
• 3.3.2 遗传多样性分析
• 3.3.3 遗传相似性分析
• 3.3.4 聚类分析
• 3.4 SSR分析结果
• 3.4.1 引物筛选及结果
• 3.4.2 遗传多样性分析
• 3.4.3 遗传相似性分析
• 3.4.4 聚类分析
• 第四章 讨论
• 4.1 DNA的提取
• 4.2 野生狗牙根遗传多样性
• 4.3 关于种群结构的稳定性
• 4.4 聚类结果与地理来源相关性分析
• 第五章 结论
• 参考文献
• 附录
• 1 银染步骤
• 致谢
• 作者简介