中国荷斯坦牛C4A基因的遗传变异及其作为乳腺炎抗性标记的可行性分析

中国荷斯坦牛C4A基因的遗传变异及其作为乳腺炎抗性标记的可行性分析

论文摘要

补体成分4(Complement component4, C4)是补体经典途径和凝集素途径中的一个重要成分,血清含量仅次于C3位居第二。在补体激活和抵抗外源微生物侵入中发挥着积极作用的C4,主要在肝脏中表达,一些肝外组织如心脏、肺脏、脾脏、肾脏、大脑、甲状腺和乳腺中也有表达。C4是补体系统中多态含量最高的成分,其结构基因位于主要组织相容性复合物区。因此,研究C4意义更显得重要。1.C4A基因多态性与奶牛生产性状关联性分析本研究以1182头中国荷斯坦牛,利用PCR-RFLP和DNA测序等方法检测牛C4A基因中未报道的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并将发现的这些SNPs位点及其构建的不同单倍型组合与奶牛产奶性状进行关联性分析,筛查与奶牛产奶性状相关的分子标记,为培育高产奶量、高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供参考依据。通过C4浓度、抗菌活性和补体活性三个指标,验证其抗性效果。序列分析比对显示:外显子10存在g.2994A>G突变,外显子12含g.3508A>G和g.3649G>C突变。试验群体中SNPs组成的单倍型有8种,满足统计分析数量的单倍型组合为7种。统计分析发现g.2994A>G-AG和g.3649G>C-CC个体牛的SCS较其它基因型低(P<0.01);H5H5(GAC/GAC)为乳腺炎抗性单倍型组合,H2H1(AAG/AAC)是易感性群体。两种组合对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的抗菌活性差异极显著(P<0.001);各基因型C4浓度差异不显著,但H5H7个体较H5H5高(P<0.05)。2.C4A基因可变剪切体的寻找根据体细胞评分和奶样病原菌鉴定结果,将6头奶牛分为健康组和乳腺炎组。利用RT-PCR和克隆测序技术,在肝脏和乳腺组织中发现一种形式为内含子10保留的可变剪切体,即C4A-AS.两种转录本在研究个体的心脏、’肾脏、肝脏、脾脏、肺脏、肌肉、乳腺和舌中都有表达,且在健康奶牛组织中表达差异极显著(P<0.001),在乳腺炎奶牛中差异不显著(P=0.257,);乳腺炎发生时C4A-AS的表达量显著增加(P=0.030)。3.C4A基因启动子活性分析利用在线预测软件对牛C4A基因的5’侧翼区序列进行生物信息学分析,成功构建了一系列表达载体,利用双荧光素酶报告基因检测系统分析牛C4A基因的5’侧翼区启动活性。分别通过定点突变技术构建突变质粒和脂多糖刺激试验,研究调控C4基本表达和诱导表达的转录因子结合位点。利用EMSA技术验证转录因子在研究细胞系中存在与否。C4A基因启动子序列存在两个SNP位点,即g.-889C>T和g.+147G>A。其中,位于内含子1的g.+147G>A位点与血清C4浓度相关,可能调控C4的表达。C4A基因启动子序列转录起始位点上游169bp为报告基因荧光值最高的片段,即为启动子核心区;其中SP1(-169--158)、E-box(-122--117)和AP-1(-80--71)是调控C4基本表达的主要转录因子结合位点。其中,AP-1在脂多糖刺激C4表达中发挥作用,而且这三个转录因子在HepG2细胞系中真实存在。综上所述,C4A基因可作为奶牛乳腺炎抗性育种的候选基因。当然奶牛乳腺炎抗性育种仅仅为控制乳腺炎工作的一部分,即从“本”上治疗奶牛乳腺炎;同时在奶牛饲养中应加强管理、注重营养平衡,从“标”上减少乳腺炎的发生。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 缩略词
  • 文献综述
  • 第一章 乳腺炎及相关抗性基因的研究进展
  • 1 乳腺炎概况
  • 1.1 奶牛乳腺炎的发生
  • 1.2 奶牛乳腺炎的危害
  • 1.3 乳腺炎的治疗手段
  • 1.4 乳腺炎遗传学研究
  • 2 乳腺炎抗性候选基因研究现状
  • 2.1 β-防御素
  • 2.2 牛主要组织相容性复合物(BoLA)基因
  • 2.3 热休克蛋白70
  • 2.4 Toll样受体基因
  • 2.5 溶质转运家族11成员1(Slc11A1)基因
  • 2.6 乳铁蛋白
  • 2.7 其他
  • 3 C4基因研究进展
  • 3.1 C4结构和功能
  • 3.2 C4基因多态性研究
  • 4 本项目的研究目的和意义
  • 参考文献
  • 试验研究
  • 第二章 C4A基因多态性研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试验动物
  • 1.2 仪器设备及试剂
  • 1.3 试验方法
  • 2 试验结果
  • 2.1 牛C4A基因多态位点的筛查
  • 2.2 牛C4A基因多态性分析结果
  • 2.3 数据统计分析结果
  • 2.4 单倍型分析结果
  • 参考文献
  • 第三章 C4A多态性与乳腺炎的相关分析及其验证
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试验动物
  • 1.2 仪器设备及试剂
  • 1.3 抗性效果验证
  • 1.4 统计分析
  • 2 试验结果
  • 2.1 多态位点与奶牛产奶性状的相关性分析
  • 2.2 多态位点与奶牛C4浓度和CH50的相关性分析
  • 2.3 单倍型组合与奶牛产奶性状的相关性分析
  • 2.4 单倍型组合与奶牛C4浓度和CH50的相关性分析
  • 2.5 抗菌活性分析结果
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 第四章 C4A可变剪切体的鉴定与表达
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试验材料
  • 1.2 仪器设备及试剂
  • 1.3 试验方法
  • 2 试验结果
  • 2.1 奶样病原菌鉴定结果
  • 2.2 RNA检测
  • 2.3 可变剪切体的鉴定
  • 2.4 可变剪切体的定量分析
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 第五章 C4A基因启动子功能和SNPs分析
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试验动物
  • 1.2 仪器设备及试剂
  • 1.3 试验方法
  • 2 试验结果
  • 2.1 重组质粒鉴定结果
  • 2.2 启动子序列及结构
  • 2.3 SNPs与C4浓度的相关性
  • 2.4 牛C4A基因5'调控区的转录活性
  • 2.5 LPS对牛C4A 5'调控区启动子活性的影响
  • 2.6 EMSA结果
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 全文总结
  • 附录
  • 致谢
  • 作者简介
  • 攻读硕士期间发表论文
  • 相关论文文献

    • [1].中国荷斯坦牛C4A基因5'侧翼区功能分析[J]. 畜牧与兽医 2015(06)

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