本文主要研究内容
作者陈双双（2019）在《蓝狐肠道菌群多样性分析及其体外培养方法比较研究》一文中研究指出：为了探究蓝狐肠道菌群多样性及其体外培养方法,本试验分别采集蓝狐粪便和结肠内容物进行高通量测定,选择三种不同的培养基对蓝狐粪便及结肠内容物进行体外富集培养、传代培养,通过高通量测序结果分析蓝狐肠道菌群多样性并确定最优的体外培养方法,为进一步研究蓝狐肠道细菌的功能以及在营养物质代谢过程中作用提供微生物学基础。本研究包括三部分:第一部分:蓝狐粪便菌群多样性分析本试验随机选取8只健康育成期(5-6月龄)雄性舍饲蓝狐,采集新鲜粪便后采用高通量测序技术对蓝狐肠道菌群结构进行分析。结果表明,8只健康的蓝狐的操作分类单元(OTU)范围为468~574,归类于16个门的209个属。在门水平上以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、变形菌门、梭杆菌门为主。在属水平上以链球菌属所占比例最高,其次为乳杆菌属、普雷沃菌属、巨型球菌属、柯林斯菌属、Blautia、拟杆菌属。通过高通量测序技术发现蓝狐具有复杂的肠道菌群结构,且个体间存在较大差异。第二部分:蓝狐粪便菌群体外培养方法的比较研究除去第一部分中肠道菌群差异性较大的两只蓝狐,采集剩下的6只蓝狐的新鲜粪便。用A、B、C三种培养基对蓝狐新鲜粪便进行富集培养,连续培养三代后,用Illumina HiSeq测序技术分析培养液中菌群结构。结果表明,A、B、C三种培养液中菌群结构存在显著性差异,Alpha指数分析表明,在连续传代培养三代后,A培养液中菌群的丰度及多样性>C培养液中菌群的丰度及多样性>B培养液中菌群的丰度及多样性。Beta多样性分析表明,与A、C培养液的菌群结构相比,B培养液中的菌群结构较单一。对于蓝狐粪便菌群,A培养基富集得到的细菌多样性较丰富,其次是C培养基,B培养基富集得到的细菌多样性最低,因此A培养基可作为蓝狐肠道细菌体外培养的富集培养基。第三部分:蓝狐结肠菌群多样性分析及其体外培养方法验证随机选取7只健康育成期(3-4月龄)雌性舍饲蓝狐,采集结肠后端内容物。液氮速冻后用高通量测序技术对蓝狐结肠菌群结构进行分析。另外选择A、B、C三种培养基对新鲜的蓝狐结肠内容物进行富集培养,连续培养9代后,用高通量测序技术分析培养基中菌群结构。结果表明,随着传代次数的增加,A、B、C三种培养基对蓝狐结肠微生物进行富集培养后的菌群结构发生了改变。通过Alpha指数分析表明,A培养液中菌群组成的丰度及多样性最高,其次是C培养液中菌群组成的丰度及多样性,B培养液中菌群组成的丰度及多样性最低。通过Beta多样性分析表明,A培养液中菌群组成的丰富度较高,B、C培养液中菌群组成较单一。随着传代次数的增加,A、C培养液中的菌群组成趋于稳定,但B培养液中的菌群逐渐消失。通过PICRUSt基因预测分析表明,A培养液中菌群功能基因与蓝狐结肠菌群功能基因相似度高,而B、C培养液中菌群功能基因与蓝狐结肠菌群功能基因差异性较大。对于蓝狐结肠菌群,A培养基富集得到的蓝狐结肠菌群多样性较丰富,其次是C培养基,B培养基富集得到的菌群多样性最低,该结果与蓝狐粪便体外培养结果一致,因此A可作为蓝狐结肠菌群体外培养的富集培养基。
Abstract
wei le tan jiu lan hu chang dao jun qun duo yang xing ji ji ti wai pei yang fang fa ,ben shi yan fen bie cai ji lan hu fen bian he jie chang nei rong wu jin hang gao tong liang ce ding ,shua ze san chong bu tong de pei yang ji dui lan hu fen bian ji jie chang nei rong wu jin hang ti wai fu ji pei yang 、chuan dai pei yang ,tong guo gao tong liang ce xu jie guo fen xi lan hu chang dao jun qun duo yang xing bing que ding zui you de ti wai pei yang fang fa ,wei jin yi bu yan jiu lan hu chang dao xi jun de gong neng yi ji zai ying yang wu zhi dai xie guo cheng zhong zuo yong di gong wei sheng wu xue ji chu 。ben yan jiu bao gua san bu fen :di yi bu fen :lan hu fen bian jun qun duo yang xing fen xi ben shi yan sui ji shua qu 8zhi jian kang yo cheng ji (5-6yue ling )xiong xing she si lan hu ,cai ji xin xian fen bian hou cai yong gao tong liang ce xu ji shu dui lan hu chang dao jun qun jie gou jin hang fen xi 。jie guo biao ming ,8zhi jian kang de lan hu de cao zuo fen lei chan yuan (OTU)fan wei wei 468~574,gui lei yu 16ge men de 209ge shu 。zai men shui ping shang yi hou bi jun men 、ni gan jun men 、fang xian jun men 、bian xing jun men 、suo gan jun men wei zhu 。zai shu shui ping shang yi lian qiu jun shu suo zhan bi li zui gao ,ji ci wei ru gan jun shu 、pu lei wo jun shu 、ju xing qiu jun shu 、ke lin si jun shu 、Blautia、ni gan jun shu 。tong guo gao tong liang ce xu ji shu fa xian lan hu ju you fu za de chang dao jun qun jie gou ,ju ge ti jian cun zai jiao da cha yi 。di er bu fen :lan hu fen bian jun qun ti wai pei yang fang fa de bi jiao yan jiu chu qu di yi bu fen zhong chang dao jun qun cha yi xing jiao da de liang zhi lan hu ,cai ji sheng xia de 6zhi lan hu de xin xian fen bian 。yong A、B、Csan chong pei yang ji dui lan hu xin xian fen bian jin hang fu ji pei yang ,lian xu pei yang san dai hou ,yong Illumina HiSeqce xu ji shu fen xi pei yang ye zhong jun qun jie gou 。jie guo biao ming ,A、B、Csan chong pei yang ye zhong jun qun jie gou cun zai xian zhe xing cha yi ,Alphazhi shu fen xi biao ming ,zai lian xu chuan dai pei yang san dai hou ,Apei yang ye zhong jun qun de feng du ji duo yang xing >Cpei yang ye zhong jun qun de feng du ji duo yang xing >Bpei yang ye zhong jun qun de feng du ji duo yang xing 。Betaduo yang xing fen xi biao ming ,yu A、Cpei yang ye de jun qun jie gou xiang bi ,Bpei yang ye zhong de jun qun jie gou jiao chan yi 。dui yu lan hu fen bian jun qun ,Apei yang ji fu ji de dao de xi jun duo yang xing jiao feng fu ,ji ci shi Cpei yang ji ,Bpei yang ji fu ji de dao de xi jun duo yang xing zui di ,yin ci Apei yang ji ke zuo wei lan hu chang dao xi jun ti wai pei yang de fu ji pei yang ji 。di san bu fen :lan hu jie chang jun qun duo yang xing fen xi ji ji ti wai pei yang fang fa yan zheng sui ji shua qu 7zhi jian kang yo cheng ji (3-4yue ling )ci xing she si lan hu ,cai ji jie chang hou duan nei rong wu 。ye dan su dong hou yong gao tong liang ce xu ji shu dui lan hu jie chang jun qun jie gou jin hang fen xi 。ling wai shua ze A、B、Csan chong pei yang ji dui xin xian de lan hu jie chang nei rong wu jin hang fu ji pei yang ,lian xu pei yang 9dai hou ,yong gao tong liang ce xu ji shu fen xi pei yang ji zhong jun qun jie gou 。jie guo biao ming ,sui zhao chuan dai ci shu de zeng jia ,A、B、Csan chong pei yang ji dui lan hu jie chang wei sheng wu jin hang fu ji pei yang hou de jun qun jie gou fa sheng le gai bian 。tong guo Alphazhi shu fen xi biao ming ,Apei yang ye zhong jun qun zu cheng de feng du ji duo yang xing zui gao ,ji ci shi Cpei yang ye zhong jun qun zu cheng de feng du ji duo yang xing ,Bpei yang ye zhong jun qun zu cheng de feng du ji duo yang xing zui di 。tong guo Betaduo yang xing fen xi biao ming ,Apei yang ye zhong jun qun zu cheng de feng fu du jiao gao ,B、Cpei yang ye zhong jun qun zu cheng jiao chan yi 。sui zhao chuan dai ci shu de zeng jia ,A、Cpei yang ye zhong de jun qun zu cheng qu yu wen ding ,dan Bpei yang ye zhong de jun qun zhu jian xiao shi 。tong guo PICRUStji yin yu ce fen xi biao ming ,Apei yang ye zhong jun qun gong neng ji yin yu lan hu jie chang jun qun gong neng ji yin xiang shi du gao ,er B、Cpei yang ye zhong jun qun gong neng ji yin yu lan hu jie chang jun qun gong neng ji yin cha yi xing jiao da 。dui yu lan hu jie chang jun qun ,Apei yang ji fu ji de dao de lan hu jie chang jun qun duo yang xing jiao feng fu ,ji ci shi Cpei yang ji ,Bpei yang ji fu ji de dao de jun qun duo yang xing zui di ,gai jie guo yu lan hu fen bian ti wai pei yang jie guo yi zhi ,yin ci Ake zuo wei lan hu jie chang jun qun ti wai pei yang de fu ji pei yang ji 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国农业科学院的陈双双，发表于刊物中国农业科学院2019-07-05论文，是一篇关于肠道菌群论文,蓝狐论文,高通量测序论文,中国农业科学院2019-07-05论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国农业科学院2019-07-05论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：肠道菌群论文; 蓝狐论文; 高通量测序论文; 中国农业科学院2019-07-05论文;