石斛属药用植物内生真菌多样性研究

论文摘要

石斛属植物为附生性兰科植物,多种具有药用价值。自然条件下所有石斛属植物均与内生真菌共生,内生真菌在石斛属植物整个生活史中扮演着重要角色。针对石斛属植物内生真菌的研究得到了大量学者的重视,但是当前国内外针对石斛属植物内生真菌多样性的研究少有报道。本研究以石斛属植物为研究对象,通过形态学和分子生物学鉴定对24种石斛属药用植物中分离到的542株内生真菌进行了多样性研究。鉴于大量内生真菌不产孢无法通过形态学鉴定的现实,我们首先对内生真菌产孢诱导的方法进行了筛选。本研究选用美登木、金线莲两种药用植物来源的74株常规条件下不产孢的内生真菌进行了产孢诱导实验。结果表明低温诱导对内生真菌产孢诱导效果较为理想,因而在我们对石斛属药用植物内生真菌不产孢菌株采用低温诱导法诱导产孢。在该实验过程中,我们从金线莲内生真菌中发现一个Hansfordia的新种,定名为Hansfordia pallens。542株石斛属药用植物内生真菌中249株可产孢,占总菌株数的46%。通过形态学观察249株石斛内生真菌鉴定到21个属,其中148株鉴定到种,分别属于51个种,其中发现3个中国新纪录种(Acremonium sordidulum,Periconiella cestri,Hyalodendron lignicola ).Alternaria,Cladosporium,Aureobasidium,Chaetophoma,Periconiella,Nigrospora,Hyalodendron,Thielavia,Pleurophragmium,Melanconium,Glomerularia,Sirodesmium,Ckaetomella,Streptomyces 14个属系首次从石斛属植物中发现。虽然我们对石斛属药用植物不产孢的内生真菌进行了产孢诱导,但仍有293株不产孢,无法通过传统形态学方法进行鉴定。对于不产孢的菌株,我们采用分子生物学手段来对其进行鉴定。根据菌落培养特征和显微观察特征,将不产孢菌株划分为30个形态型,从30个形态型中选取148个代表菌株进行分子生物学鉴定。对148株内生真菌的ITS片段进行PCR扩增测序,将获得的ITS序列与参考菌种一起进行系统发育分析,结合序列碱基相似性比对来确定石斛属药用植物内生真菌的分类地位。通过分子生物学鉴定,148株代表菌株中8株鉴定到种,分别属于8个不同种;128株鉴定到属,分别属于28个属;10株鉴定到科,分别属于5个科;2株放到目。形态学鉴定的28个属中,Arthrinium,Chaetomium,Colletotrichum,Cercophora,Phomopsis,Nectria,Cosmospora,Bionectria,Nemania,Pleospora,Leptosphaerulina,Lewia,Paraconiothyrium,Ampelomyces,Davidiella,Lasiodiplodia,Fusicoccum,Botryosphaeria,Pezicula,Hypocrea20个属系首次从石斛属植物中发现。形态学鉴定结果结合分子生物学鉴定结果表明,石斛属药用植物内生真菌种类非常丰富,不同种石斛属药用植物的内生真菌在数量上和种类上差别较大,多样性丰富程度不同。

论文目录

• 中文摘要
• ABSTRACT
• 前言
• 第一章 植物内生真菌的来源途径及生物多样性研究进展
• 第一节 内生真菌研究简述
• 第二节 植物内生真菌分离、培养和鉴定方法研究
• 一、植物内生真菌分离方法
• 二、植物内生真菌培养方法
• 三、植物内生真菌鉴定方法
• 第三节 植物内生真菌种类的生物多样性
• 一、内生真菌及其宿主植物的物种多样性
• 二、内生真菌遗传多样性
• 参考文献
• 第二章 内生真菌的产孢诱导
• 一、材料方法
• 二、结果
• 三、讨论
• 参考文献
• 第三章 石斛属药用植物内生真菌的形态学鉴定
• 一、材料方法
• （一） 供试菌株
• （二） 方法
• 二、结果
• （一） 铁皮石斛内生真菌形态鉴定
• （二） 金钗石斛内生真菌形态鉴定
• （三） 串珠石斛内生真菌形态鉴定
• （四） 美花石斛内生真菌形态鉴定
• （五） 环草石斛内生真菌形态鉴定
• （六） 矮棒石斛内生真菌形态鉴定
• （七） 报春石斛内生真菌形态鉴定
• （八） 杯鞘石斛内生真菌形态鉴定
• （九） 长距石斛内生真菌形态鉴定
• （十） 齿瓣石斛内生真菌形态鉴定
• （十一） 大苞鞘石斛内生真菌形态鉴定
• （十二） 兜唇石斛内生真菌形态鉴定
• （十三） 叠鞘石斛内生真菌形态鉴定
• （十四） 黑毛石斛内生真菌形态鉴定
• （十五） 喉红石斛内生真菌形态鉴定
• （十六） 流苏石斛内生真菌形态鉴定
• （十七） 密花石斛内生真菌形态鉴定
• （十八） 束花石斛内生真菌形态鉴定
• （十九） 细茎石斛内生真菌形态鉴定
• （二十） 细叶石斛内生真菌形态鉴定
• （二十一） 小黄花石斛内生真菌形态鉴定
• （二十二） 肿节石斛内生真菌形态鉴定
• （二十三） 重唇石斛内生真菌形态鉴定
• （二十四） 竹枝石斛内生真菌形态鉴定
• 三、形态学鉴定总结
• 四、分析与讨论
• 参考文献
• 第四章 石斛属药用植物内生真菌的分子鉴定
• 第一节 内生真菌形态型的划分
• 一、形态型划分依据
• 二、形态型划分结果与分析
• 第二节 内生真菌的分子鉴定
• 一、材料方法
• （一）材料
• （二）方法
• 二、系统发育分析
• （一） 基本分类地位分析
• （二） 系统发育分析
• 三、结果分析
• （一） 担子菌起源菌株的鉴定
• （二） 子囊菌起源菌株的鉴定
• （三） 分子鉴定各属内生真菌在石斛属药用植物中的分布情况
• 参考文献
• 主要结论
• 附表
• 在读期间发表论文及获奖情况
• 致谢