微卫星标记多态性及其与凉山半细毛羊体重性状相关关系研究

论文摘要

本研究以凉山半细毛羊原种场的2001～2003年度的凉山半细毛羊个体为研究对象，采用聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）电泳银染法和PCR技术相结合的方法，利用微卫星标记技术，以位于绵羊基因组3号染色体和X染色体上的共计15个微卫星标记来研究该群体的5个体重性状与微卫星标记之间的相关关系。5个体重表型性状为：初生重（Birth weight），断奶重（Weaning weight），断奶日增重（Weaning daily gain），1.5岁体重（1.5-year weight，1.5-YW）及2.5岁体重（2.5-year weight，2.5-YW）等5个体重性状。对所研究群体的5个体重性状进行表型相关分析。初生重和断奶重的相关系数为0.2086，达显著水平，初生重和1.5岁体重，断奶重和断奶日增重，断奶重和1.5岁体重及断奶日增重和1.5岁体重之间分别达极显著水平，且相关系数均为正相关。在凉山半细毛羊15个微卫星标记遗传特性实验结果中，平均等位基因数为7个（3～12个），平均观察杂合度为0.6288，平均预期杂合度为0.7877，平均多态信息含量为0.7518，其中微卫星BMS0460的多态信息含量最高（PIC=0.842），而标记MILVET09的多态信息含量最低（PIC=0.569）。15个微卫星标记均表现为高度多态性，在分子水平上为该资源群体的研究提供了可靠的依据。通过SAS统计软件中的一般线性模型程序进行表型性状与15个微卫星标记的相关分析，有7个微卫星标记与部分体重性状存在显著或极显著相关。标记BMS0460的初生重差异显著（P＜0.05），标记RM150的断奶重和断奶曰增重差异显著（P＜0.05），标记BMS1953的2.5岁体重差异显著（P＜0.05），标记BL0004和标记BMS1248的1.5岁体重差异显著（P＜0.05），标记AE25的断奶日增重差异显著（P＜0.05），标记BMC1009的1.5岁体重则差异极显著（P＜0.01）。标记RM150同时和两个相关性状存在关联。对差异显著的标记进行不同基因型间各体重性状的多重比较。标记BMS0460的基因型EI、EH、DF对初生重影响显著。标记RM150基因型BB、DI和JJ对断奶重影响显著。标记RM150基因型EI、GG、DI和JJ，标记AE25的基因型AA对断奶日增重影响显著。标记BL0004基因型EE、CD，标记BMS1248基因型BC、AA，标记BMC1009的DI、CE、GI基因型对1.5岁体重影响显著。标记BMS1953基因型CF、CE和BD对2.5岁体重影响显著。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1. 文献综述
• 1.1 绵羊品种资源的起源和特性等概况
• 1.1.1 绵羊的起源
• 1.1.2 绵羊的物种特性及品种分布
• 1.1.3 我国绵羊资源的状况
• 1.1.4 凉山半细毛羊的概况
• 1.2 家畜体重性状的研究进展
• 1.2.1 传统育种方法在家畜体重中的研究
• 1.2.2 遗传标记在家畜体重研究中的应用
• 1.3 微卫星DNA及微卫星DNA遗传标记在动物遗传育种中的应用
• 1.3.1 微卫星DNA的发现与命名
• 1.3.2 微卫星DNA的结构、分布及遗传特点
• 1.3.3 多态性及形成机制
• 1.3.4 微卫星多态性的主要统计参数
• 1.3.5 多态性检测原理和流程
• 1.3.6 微卫星位点的检测方法和标记分析
• 1.3.7 微卫星DNA功能
• 1.3.8 微卫星遗传标记在动物遗传育种中的应用
• 1.4 运用微卫星标记进行凉山半细毛羊体重性状QTL定位研究进展
• 1.5 数量性状与遗传标记之间相关研究的意义和方法
• 1.5.1 数量性状与遗传标记之间相关研究试验设计
• 1.5.2 数量性状与遗传标记相关分析的主要方法
• 1.6 目的与意义
• 2. 试验材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 试验群体
• 2.1.2 绵羊耳组织采集方法
• 2.1.3 试验分析的表型性状
• 2.1.4 主要仪器设备
• 2.1.5 主要试剂和酶
• 2.1.6 溶液的配制
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 表型资料的获得
• 2.2.2 基因组DNA的提取
• 2.2.3 基因组DNA的检测
• 2.2.4 标记的选择和引物的合成
• 2.2.5 PCR反应程序和反应体系
• 2.2.6 PCR产物的检测
• 2.2.7 统计分析
• 3. 结果与分析
• 3.1 生长曲线
• 3.2 各体重性状的简单统计分析
• 3.3 凉山半细毛羊各体重性状间的表型相关分析
• 3.4 DNA提取结果
• 3.5 PCR产物的电泳结果及多态性
• 3.6 凉山半细毛羊15个微卫星座位的等位基因及其基因型频率
• 3.7 凉山半细毛羊的观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量
• 3.8 凉山半细毛羊的有效等位基因数
• 3.9 利用一般线性模型对15个微卫星标记不同基因型进行不均衡数据方差分析
• 3.10 微卫星座位不同基因型多重比较
• 3.10.1 标记BMS0460在初生重性状上的多重比较
• 3.10.2 标记RM150在断奶重性状上的多重比较
• 3.10.3 标记RM150和AE25在断奶日增重性状上的多重比较
• 3.10.4 标记BL0004、BMS1248和BMC1009在1.5岁体重性状上的多重比较
• 3.10.5 标记BMS1953在2.5岁体重性状上的多重比较
• 4. 讨论
• 4.1 基因组DNA的提取
• 4.2 关于微卫星标记的选择问题
• 4.3 关于微卫星保守性
• 4.4 关于PCR条件
• 4.5 有关聚丙烯酰胺凝胶电泳
• 4.5.1 PAGE的影响因素
• 4.5.2 带型判读和“影子带”
• 4.6 关于群体内遗传变异问题
• 4.7 关于标记与性状相联的分析
• 5. 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文