银杏种质资源遗传多样性的AFLP研究

论文摘要

以来自国内外的90个银杏种质为材料,采用CTAB法提取幼嫩银杏叶片总DNA,从64对EcoRI/MseI引物（其中Msel引物为荧光标记物）中筛选出7-8对清晰、多态性高的引物,对90个银杏材料的遗传多样性进行了AFLP分析。采用GeneScan3.1软件对图像进行处理,构建0、1数学矩阵。利用POPGENE32 version1.32软件计算遗传多样性指数,采用NTSYS.pc2.11f计算软件,得到Dice相似性系数矩阵,并用UPGMA法进行聚类分析,研究结果如下:（1）利用8对引物首次对来自美国、荷兰、日本、法国和我国的21个银杏观赏品种的遗传多样性进行了研究,共产生1117条谱带,229个特异位点（包括单态带单态带175条和缺失带54条）,多态带983条,多态带的比例为88%;每对引物鉴别效率为100%。品种之间的相似系数为0.49-0.84。当相似系数为0.73时,供试观赏品种可分为四类。聚类结果表明:品种并没有全部按来源地聚类,各来源地的品种之间存在着广泛的交流。来源地相同的品种并不单独聚成一类,中国和法国的品种分别属于其中的三类。根据对观赏品种的特异位点、相似系数、聚类结果等进行综合分析表明,‘塔形银杏’、‘垂乳银杏’、‘筒叶银杏’、‘大耳银杏’、‘斑叶银杏’、‘展冠银杏’、‘垂枝银杏’、‘沂源叶籽银杏1’这8个品种是银杏观赏品种中的重要特异种质。14个国外银杏观赏种质平均多态带的比例高于7个国内种质。（2）首次利用7对引物对对来自国内的29个银杏雄株种质的遗传多样性进行了研究,7对引物共产生1173条谱带,187个特异位点和1145条多态带,多态带的比例平均为97.6%。每对引物鉴别效率达到100%。所有种质之间相似系数在0.38-0.82之间,所试种质遗传变异大。当相似系数为0.51时,全部种质可以分为2大类,山东的大部分种质聚为一类。‘天目山6’、‘宁国2’、‘郯城5’可能是比较原始的种质。29个国内雄株的遗传多样性略高于21个银杏观赏种质。（3）利用7对引物对来自国内外的49个银杏雌株种质的遗传多样性进行了研究,共产生1219条谱带,131个特异位点（包括单态带120条和缺失带11条）,多态带1200条,多态性为98.44%。每对引物的鉴别效率为100%。各雌株种质之间相似系数在0.39-0.83之间。在SC=0.51、0.64处,供试材料分为2类和7类,所试山东银杏雌株种质占总类型的100%,山东银杏雌株种质存在着较宽的遗传基础。49个国内雌株的遗

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1 前言
• 1.1 果树种质资源的概念及重要性
• 1.1.1 果树种质资源的概念
• 1.1.2 果树种质资源的重要性
• 1.2 果树资源的起源中心
• 1.3 我国果树种质资源研究进展
• 1.4 遗传多样性的历史与回顾
• 1.4.1 遗传多样性的概念
• 1.4.2 遗传多样性的研究方法
• 1.4.3 果树种质资源遗传多样性的研究进展
• 1.5 银杏种质资源及遗传多样性研究的评述
• 1.5.1 银杏种质资源
• 1.5.2 银杏遗传多样性研究的概述
• 1.6 研究的目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 实验地概况
• 2.2 实验材料
• 2.3 主要的试剂与仪器
• 2.3.1 药品
• 2.3.2 主要的仪器设备
• 2.4 试验方法
• 2.4.1 DNA 模板的制备
• 2.4.2 酶切与连接
• 2.4.3 预扩增
• 2.4.4 选择性扩增
• 2.4.5 引物对的筛选
• 2.4.6 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析
• 2.5 统计分析
• 3 结果与分析
• 3.1 银杏DNA 的提取与质量
• 3.2 观赏品种遗传多样性的分析
• 3.2.1 不同引物对的多态性分析
• 3.2.2 各个观赏品种的特异位点
• 3.2.3 相似性分析
• 3.2.4 聚类分析
• 3.2.5 遗传多样性的分析
• 3.3 国内雄株遗传多样性的分析
• 3.3.1 AFLP 的选择性扩增结果
• 3.3.2 雄株种质的特异位点
• 3.3.3 相似性分析
• 3.3.4 聚类分析
• 3.3.5 种质间亲缘关系分析
• 3.3.6 遗传多样性的分析
• 3.4 雌株遗传多样性的分析
• 3.4.1 AFLP 的选择性扩增结果
• 3.4.2 雌株种质的特异位点
• 3.4.3 相似性分析
• 3.4.4 聚类分析
• 3.4.5 遗传多样性的分析
• 3.5 叶籽银杏遗传多样性的分析
• 3.5.1 AFLP 的选择性扩增结果
• 3.5.2 叶籽银杏的特异位点
• 3.5.3 相似性分析
• 3.5.4 聚类分析
• 3.5.5 遗传多样性的分析
• 3.6 90 个种质的遗传多样性分析
• 3.6.1 AFLP 的选择性扩增结果
• 3.6.2 90 个种质的特异位点
• 3.6.3 相似性分析
• 3.6.4 聚类分析
• 3.6.5 遗传多样性的分析
• 3.6.6 不同银杏群体遗传多样性的分析
• 4 讨论
• 4.1 关于银杏亲缘关系与分类
• 4.2 关于银杏的特异种质
• 4.3 关于银杏的遗传多样性
• 5 结论
• 5.1 观赏品种的遗传多样性
• 5.2 国内雄株的遗传多样性
• 5.3 雌株的遗传多样性
• 5.4 叶籽银杏的遗传多样性
• 5.5 90 个种质的遗传多样性
• 5.6 不同银杏群体的遗传多样性
• 5.6.1 古树与非古树银杏的遗传多样性
• 5.6.2 长江以南与长江以北银杏的遗传多样性
• 5.6.3 山东省内不同产地银杏的遗传多样性
• 5.6.4 国内不同产地银杏的遗传多样性
• 5.6.5 不同国家银杏的遗传多样性
• 5.7 研究的创新点
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的论文情况