本文主要研究内容
作者姜蓬垒,时应娣,侯艳雯,韩兵社,张俊芳(2019)在《低温压力对ZF4细胞组蛋白修饰的影响》一文中研究指出:为探索低温压力对斑马鱼细胞组蛋白修饰的影响,建立并优化使用斑马鱼(Danio rerio)成纤维细胞ZF4进行染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation, ChIP)的条件。本研究分别优化了ChIP过程中裂解细胞所使用的NP-40浓度、超声破碎的时间,确定了最佳NP-40浓度为0.2%,超声时间为20 min。利用针对β-actin启动子区域的引物,通过常规PCR初步验证ChIP实验是否成功。琼脂糖凝胶电泳结果显示, IgG组常规PCR产物基本无条带,H3K27me3组条带较暗, H3K4me3和H3K27ac组有较亮条带,初步说明实验可靠。使用正常培养(28℃)与长期低温驯化(18℃, 30 d)的斑马鱼成纤维细胞ZF4作为实验材料,通过优化之后的ChIP技术进行实验。分别使用qPCR和ChIP-qPCR检测低温驯化对肿瘤坏死因子b(tumor necrosis factor b,tnfb)基因表达以及其启动子区域H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3的影响。qPCR结果显示tnfb基因经过低温驯化后上调,而ChIP-qPCR结果显示,tnfb基因启动子区域的H3K4me3、H3K27ac富集度也出现升高, H3K27me3没有明显变化,提示低温压力可能通过影响tnfb基因启动子区域的H3K4me3、H3K27ac水平来调控tnfb基因的表达。本研究建立并优化的ChIP实验条件可以用来研究ZF4细胞组蛋白修饰变化,为下一步探索低温压力对斑马鱼细胞全基因组组蛋白修饰的影响奠定基础。
Abstract
wei tan suo di wen ya li dui ban ma yu xi bao zu dan bai xiu shi de ying xiang ,jian li bing you hua shi yong ban ma yu (Danio rerio)cheng qian wei xi bao ZF4jin hang ran se zhi mian yi gong chen dian (chromatin immunoprecipitation, ChIP)de tiao jian 。ben yan jiu fen bie you hua le ChIPguo cheng zhong lie jie xi bao suo shi yong de NP-40nong du 、chao sheng po sui de shi jian ,que ding le zui jia NP-40nong du wei 0.2%,chao sheng shi jian wei 20 min。li yong zhen dui β-actinqi dong zi ou yu de yin wu ,tong guo chang gui PCRchu bu yan zheng ChIPshi yan shi fou cheng gong 。qiong zhi tang ning jiao dian yong jie guo xian shi , IgGzu chang gui PCRchan wu ji ben mo tiao dai ,H3K27me3zu tiao dai jiao an , H3K4me3he H3K27aczu you jiao liang tiao dai ,chu bu shui ming shi yan ke kao 。shi yong zheng chang pei yang (28℃)yu chang ji di wen xun hua (18℃, 30 d)de ban ma yu cheng qian wei xi bao ZF4zuo wei shi yan cai liao ,tong guo you hua zhi hou de ChIPji shu jin hang shi yan 。fen bie shi yong qPCRhe ChIP-qPCRjian ce di wen xun hua dui zhong liu huai si yin zi b(tumor necrosis factor b,tnfb)ji yin biao da yi ji ji qi dong zi ou yu H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3de ying xiang 。qPCRjie guo xian shi tnfbji yin jing guo di wen xun hua hou shang diao ,er ChIP-qPCRjie guo xian shi ,tnfbji yin qi dong zi ou yu de H3K4me3、H3K27acfu ji du ye chu xian sheng gao , H3K27me3mei you ming xian bian hua ,di shi di wen ya li ke neng tong guo ying xiang tnfbji yin qi dong zi ou yu de H3K4me3、H3K27acshui ping lai diao kong tnfbji yin de biao da 。ben yan jiu jian li bing you hua de ChIPshi yan tiao jian ke yi yong lai yan jiu ZF4xi bao zu dan bai xiu shi bian hua ,wei xia yi bu tan suo di wen ya li dui ban ma yu xi bao quan ji yin zu zu dan bai xiu shi de ying xiang dian ding ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国水产科学的姜蓬垒,时应娣,侯艳雯,韩兵社,张俊芳,发表于刊物中国水产科学2019年02期论文,是一篇关于染色质免疫共沉淀论文,低温论文,斑马鱼细胞论文,组蛋白修饰论文,中国水产科学2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国水产科学2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。
标签:染色质免疫共沉淀论文; 低温论文; 斑马鱼细胞论文; 组蛋白修饰论文; 中国水产科学2019年02期论文;